Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2M1

LRP2BP, LRP2-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRP2BPQ9P2M1 PRNP-203ENST00000430350 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
LRP2BPQ9P2M1 SLC6A20-204ENST00000456124 2662 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
LRP2BPQ9P2M1 SNRPN-203ENST00000400097 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
LRP2BPQ9P2M1 ILF2-201ENST00000361891 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
LRP2BPQ9P2M1 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
LRP2BPQ9P2M1 IRF9-202ENST00000396864 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
LRP2BPQ9P2M1 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
LRP2BPQ9P2M1 RAF1-205ENST00000442415 3085 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
LRP2BPQ9P2M1 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
LRP2BPQ9P2M1 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
LRP2BPQ9P2M1 GRB7-203ENST00000394209 1955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
LRP2BPQ9P2M1 AGGF1P1-201ENST00000509500 2073 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
LRP2BPQ9P2M1 E2F6-211ENST00000542100 3450 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
LRP2BPQ9P2M1 MYADML-201ENST00000474610 2147 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
LRP2BPQ9P2M1 KCNG4-202ENST00000568181 2199 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
LRP2BPQ9P2M1 SCAP-206ENST00000428413 3749 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
LRP2BPQ9P2M1 FKBP5-201ENST00000357266 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
LRP2BPQ9P2M1 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
LRP2BPQ9P2M1 GDAP1L1-207ENST00000612599 2585 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
LRP2BPQ9P2M1 YPEL1-201ENST00000339468 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
LRP2BPQ9P2M1 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
LRP2BPQ9P2M1 SIPA1-203ENST00000527525 3235 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
LRP2BPQ9P2M1 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
LRP2BPQ9P2M1 PDE3B-202ENST00000455098 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
LRP2BPQ9P2M1 SATB2-205ENST00000443023 6194 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
LRP2BPQ9P2M1 RHOXF1-201ENST00000217999 769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
LRP2BPQ9P2M1 BORCS5-201ENST00000298571 549 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
LRP2BPQ9P2M1 Metazoa_SRP.6-201ENST00000366384 298 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
LRP2BPQ9P2M1 RAB1A-201ENST00000398529 1198 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
LRP2BPQ9P2M1 COPS7B-205ENST00000409295 1009 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
LRP2BPQ9P2M1 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
LRP2BPQ9P2M1 ANP32A-210ENST00000560303 724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
LRP2BPQ9P2M1 ACP7-202ENST00000594229 1149 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
LRP2BPQ9P2M1 AC020922.3-201ENST00000595064 547 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
LRP2BPQ9P2M1 LINC01517-203ENST00000616194 908 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
LRP2BPQ9P2M1 HIST1H4A-201ENST00000617569 312 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
LRP2BPQ9P2M1 AGER-201ENST00000375055 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
LRP2BPQ9P2M1 IDH3B-212ENST00000613370 1400 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
LRP2BPQ9P2M1 AUTS2-218ENST00000615871 4511 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
LRP2BPQ9P2M1 ALDH8A1-204ENST00000367847 1587 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
LRP2BPQ9P2M1 ZNF691-206ENST00000372508 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
LRP2BPQ9P2M1 RPARP-AS1-202ENST00000492465 1556 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
LRP2BPQ9P2M1 PRAMEF8-202ENST00000614831 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
LRP2BPQ9P2M1 PRAMEF7-202ENST00000616979 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
LRP2BPQ9P2M1 AC109466.1-209ENST00000486913 1618 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
LRP2BPQ9P2M1 ZCCHC17-204ENST00000546109 1705 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
LRP2BPQ9P2M1 SRPX-205ENST00000538295 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
LRP2BPQ9P2M1 ABHD16A-202ENST00000440843 1906 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
LRP2BPQ9P2M1 DDX49-214ENST00000629999 1912 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
LRP2BPQ9P2M1 HYAL1-209ENST00000618175 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
LRP2BPQ9P2M1 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
LRP2BPQ9P2M1 GDI2-203ENST00000380191 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
LRP2BPQ9P2M1 ARHGAP27P1-BPTFP1-KPNA2P3-201ENST00000578492 2732 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
LRP2BPQ9P2M1 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
LRP2BPQ9P2M1 AXIN2-201ENST00000307078 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
LRP2BPQ9P2M1 PPIL6-202ENST00000424445 4031 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
LRP2BPQ9P2M1 TDRD5-204ENST00000444136 3946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
LRP2BPQ9P2M1 SP6-201ENST00000342234 3800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
LRP2BPQ9P2M1 TMEM201-202ENST00000340381 3776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
LRP2BPQ9P2M1 FYN-202ENST00000354650 3628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
LRP2BPQ9P2M1 LPAR1-203ENST00000374431 3637 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
LRP2BPQ9P2M1 AC007686.3-201ENST00000619017 3487 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
LRP2BPQ9P2M1 BIRC2-214ENST00000621637 3331 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
LRP2BPQ9P2M1 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
LRP2BPQ9P2M1 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
LRP2BPQ9P2M1 FGD2-201ENST00000274963 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
LRP2BPQ9P2M1 ZBTB17-201ENST00000375733 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
LRP2BPQ9P2M1 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
LRP2BPQ9P2M1 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
LRP2BPQ9P2M1 HIST1H2AG-201ENST00000359193 2250 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
LRP2BPQ9P2M1 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
LRP2BPQ9P2M1 CBX3-202ENST00000396386 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
LRP2BPQ9P2M1 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
LRP2BPQ9P2M1 THUMPD3-AS1-212ENST00000520447 1809 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
LRP2BPQ9P2M1 C3orf33-205ENST00000534941 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
LRP2BPQ9P2M1 CKMT1B-201ENST00000300283 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
LRP2BPQ9P2M1 CKMT1A-204ENST00000434505 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
LRP2BPQ9P2M1 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
LRP2BPQ9P2M1 AATBC-201ENST00000400385 4598 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
LRP2BPQ9P2M1 CAMK2A-203ENST00000398376 1493 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
LRP2BPQ9P2M1 KIAA1614-AS1-201ENST00000415647 1440 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
LRP2BPQ9P2M1 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
LRP2BPQ9P2M1 THOC6-201ENST00000253952 1246 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
LRP2BPQ9P2M1 NCR3-202ENST00000376071 541 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
LRP2BPQ9P2M1 APRT-201ENST00000378364 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
LRP2BPQ9P2M1 ESD-202ENST00000378720 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
LRP2BPQ9P2M1 AL645608.5-201ENST00000398216 443 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
LRP2BPQ9P2M1 TEX33-202ENST00000402860 986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
LRP2BPQ9P2M1 AC073150.1-201ENST00000450406 1084 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
LRP2BPQ9P2M1 AC018680.1-202ENST00000500324 525 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
LRP2BPQ9P2M1 LEF1-AS1-204ENST00000508266 559 ntTSL 4 BASIC17.59■□□□□ 0.41
LRP2BPQ9P2M1 POU5F1P2-201ENST00000521750 823 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
LRP2BPQ9P2M1 EEF1D-218ENST00000526838 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
LRP2BPQ9P2M1 TMBIM4-205ENST00000535812 766 ntTSL 4 BASIC17.59■□□□□ 0.41
LRP2BPQ9P2M1 PGAM1P5-201ENST00000548011 764 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
LRP2BPQ9P2M1 TMBIM4-212ENST00000556010 610 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
LRP2BPQ9P2M1 AC145207.3-201ENST00000576784 529 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
LRP2BPQ9P2M1 AF254983.2-201ENST00000612331 135 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
LRP2BPQ9P2M1 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
LRP2BPQ9P2M1 FAM214B-202ENST00000378557 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms