Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0L0

VAPA, Vesicle-associated membrane protein-associated protein A, humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAPAQ9P0L0 AFAP1-203ENST00000382543 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
VAPAQ9P0L0 AC027612.1-201ENST00000445234 2395 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
VAPAQ9P0L0 CPA5-205ENST00000466363 2099 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
VAPAQ9P0L0 PVR-205ENST00000425690 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
VAPAQ9P0L0 PCDH17-201ENST00000377918 8232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
VAPAQ9P0L0 FARP2-201ENST00000264042 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
VAPAQ9P0L0 AP4B1-201ENST00000256658 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
VAPAQ9P0L0 RFESD-201ENST00000311364 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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VAPAQ9P0L0 SH3KBP1-205ENST00000397821 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
VAPAQ9P0L0 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
VAPAQ9P0L0 HECW1-203ENST00000453890 5169 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
VAPAQ9P0L0 ARID3B-206ENST00000622429 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
VAPAQ9P0L0 CPT1B-202ENST00000360719 2319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
VAPAQ9P0L0 TUNAR-201ENST00000503525 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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VAPAQ9P0L0 NCR3-204ENST00000376073 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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VAPAQ9P0L0 HCST-202ENST00000437550 445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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VAPAQ9P0L0 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
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VAPAQ9P0L0 ELF4-201ENST00000308167 4165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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VAPAQ9P0L0 COL11A2-203ENST00000374708 6209 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
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VAPAQ9P0L0 MARS-201ENST00000262027 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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VAPAQ9P0L0 ACSF2-202ENST00000427954 2251 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
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VAPAQ9P0L0 FGD6-203ENST00000546711 4568 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
VAPAQ9P0L0 KIF6-201ENST00000229913 1330 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
VAPAQ9P0L0 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
VAPAQ9P0L0 CCDC51-204ENST00000442740 1554 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
VAPAQ9P0L0 TDRD5-201ENST00000294848 3525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
VAPAQ9P0L0 CD3EAP-202ENST00000589804 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
VAPAQ9P0L0 FAM156A-221ENST00000622447 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
VAPAQ9P0L0 RPTOR-202ENST00000544334 5734 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
VAPAQ9P0L0 ERICH6-201ENST00000295910 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
VAPAQ9P0L0 RPN2-202ENST00000373622 2348 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
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