Protein–RNA interactions for Protein: Q9NV96

TMEM30A, Cell cycle control protein 50A, humanhuman

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM30AQ9NV96 HFE-201ENST00000309234 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMEM30AQ9NV96 POLD4-201ENST00000312419 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMEM30AQ9NV96 PRIMA1-201ENST00000316227 1080 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMEM30AQ9NV96 COPS7B-205ENST00000409295 1009 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMEM30AQ9NV96 LINC00686-201ENST00000435412 332 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMEM30AQ9NV96 H2AFV-206ENST00000437072 589 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMEM30AQ9NV96 BANF1-202ENST00000445560 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMEM30AQ9NV96 CEP164P1-201ENST00000455142 418 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
TMEM30AQ9NV96 RN7SL277P-201ENST00000481521 288 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
TMEM30AQ9NV96 AC145207.3-201ENST00000576784 529 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMEM30AQ9NV96 AC011825.3-201ENST00000583184 565 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMEM30AQ9NV96 IRF3-215ENST00000596822 823 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMEM30AQ9NV96 AC106872.11-201ENST00000605838 421 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
TMEM30AQ9NV96 ALKBH2-208ENST00000619381 895 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMEM30AQ9NV96 AC009975.2-202ENST00000634539 854 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMEM30AQ9NV96 FURIN-207ENST00000618099 4345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMEM30AQ9NV96 LACTB2-201ENST00000276590 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMEM30AQ9NV96 AC008125.1-201ENST00000548488 1538 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMEM30AQ9NV96 METTL17-221ENST00000556670 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMEM30AQ9NV96 PPT2-245ENST00000361568 1759 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMEM30AQ9NV96 AC093520.1-201ENST00000567545 1767 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMEM30AQ9NV96 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMEM30AQ9NV96 DIAPH2-202ENST00000355827 3782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMEM30AQ9NV96 AC022007.1-201ENST00000383808 1897 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMEM30AQ9NV96 MAPK14-204ENST00000468133 1376 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMEM30AQ9NV96 PALLD-215ENST00000512127 2958 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMEM30AQ9NV96 AC007191.1-201ENST00000623179 2995 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
TMEM30AQ9NV96 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMEM30AQ9NV96 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMEM30AQ9NV96 HPD-204ENST00000543163 1709 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMEM30AQ9NV96 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMEM30AQ9NV96 CACNA2D4-220ENST00000585732 2566 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMEM30AQ9NV96 HSPA8P5-201ENST00000456928 2069 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
TMEM30AQ9NV96 ARC-201ENST00000356613 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMEM30AQ9NV96 ATG4B-206ENST00000405546 3294 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMEM30AQ9NV96 KIAA1257-204ENST00000511438 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMEM30AQ9NV96 GGT1-202ENST00000400380 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMEM30AQ9NV96 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMEM30AQ9NV96 RNF135-202ENST00000328381 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMEM30AQ9NV96 ATP6V0E2-207ENST00000479613 1666 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMEM30AQ9NV96 PRIMPOL-211ENST00000515774 2007 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMEM30AQ9NV96 STK33-203ENST00000396672 2558 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMEM30AQ9NV96 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMEM30AQ9NV96 CNN1-201ENST00000252456 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMEM30AQ9NV96 RHOXF1-201ENST00000217999 769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMEM30AQ9NV96 GAD1-203ENST00000375272 1252 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMEM30AQ9NV96 MAD2L2-206ENST00000376672 1002 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMEM30AQ9NV96 RPS9P1-201ENST00000419943 583 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
TMEM30AQ9NV96 AC007274.2-201ENST00000421675 662 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
TMEM30AQ9NV96 AC060234.1-201ENST00000422966 474 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMEM30AQ9NV96 LINC00313-205ENST00000427188 967 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMEM30AQ9NV96 AL139246.4-201ENST00000442305 514 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMEM30AQ9NV96 SUPT4H1P2-201ENST00000501248 353 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
TMEM30AQ9NV96 AC008438.1-201ENST00000507521 549 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMEM30AQ9NV96 PAGE3-202ENST00000519203 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMEM30AQ9NV96 SPAG5-AS1-203ENST00000554154 491 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMEM30AQ9NV96 AC026803.1-201ENST00000569130 274 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
TMEM30AQ9NV96 PHBP15-201ENST00000574228 665 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
TMEM30AQ9NV96 AC005779.2-201ENST00000593083 550 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMEM30AQ9NV96 AC011466.3-201ENST00000596563 852 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMEM30AQ9NV96 ITGA9-AS1-213ENST00000614028 913 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMEM30AQ9NV96 MPHOSPH10-205ENST00000498451 2068 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMEM30AQ9NV96 DOK1-202ENST00000340004 1722 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMEM30AQ9NV96 CCNH-201ENST00000256897 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMEM30AQ9NV96 BRMS1-202ENST00000425825 1363 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMEM30AQ9NV96 MPZL2-202ENST00000438295 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMEM30AQ9NV96 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMEM30AQ9NV96 RARS2-201ENST00000369536 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMEM30AQ9NV96 COG3-206ENST00000617493 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMEM30AQ9NV96 SLCO2B1-203ENST00000428359 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMEM30AQ9NV96 ZNF77-201ENST00000314531 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMEM30AQ9NV96 PLEKHN1-202ENST00000379409 2455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMEM30AQ9NV96 NUP54-217ENST00000514987 1563 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMEM30AQ9NV96 AL022313.4-201ENST00000562756 2046 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
TMEM30AQ9NV96 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMEM30AQ9NV96 ZNF619-201ENST00000314686 2233 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMEM30AQ9NV96 SLC26A11-201ENST00000361193 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMEM30AQ9NV96 AATBC-203ENST00000448247 1889 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMEM30AQ9NV96 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMEM30AQ9NV96 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMEM30AQ9NV96 KIR3DL2-201ENST00000270442 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMEM30AQ9NV96 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMEM30AQ9NV96 BOLL-203ENST00000392296 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMEM30AQ9NV96 NOX5-209ENST00000530406 2289 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMEM30AQ9NV96 MAGEA1-201ENST00000356661 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMEM30AQ9NV96 ZNF385A-205ENST00000546970 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMEM30AQ9NV96 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMEM30AQ9NV96 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMEM30AQ9NV96 WNT9B-202ENST00000393461 2654 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMEM30AQ9NV96 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMEM30AQ9NV96 TMSB10-201ENST00000233143 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMEM30AQ9NV96 CELA3B-201ENST00000337107 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMEM30AQ9NV96 Metazoa_SRP.6-201ENST00000366384 298 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
TMEM30AQ9NV96 AL645608.5-201ENST00000398216 443 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMEM30AQ9NV96 AL391832.2-201ENST00000418557 889 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMEM30AQ9NV96 SNHG14-206ENST00000450809 677 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMEM30AQ9NV96 HOXB-AS3-206ENST00000474040 741 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMEM30AQ9NV96 RHEB-207ENST00000496004 744 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMEM30AQ9NV96 LINC02380-201ENST00000510956 1038 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMEM30AQ9NV96 ANKRD11-208ENST00000563291 593 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.2 ms