Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQP4

PFDN4, Prefoldin subunit 4, humanhuman

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Length 134 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PFDN4Q9NQP4 DRC3-203ENST00000399187 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PFDN4Q9NQP4 PCDHA5-203ENST00000614258 4248 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
PFDN4Q9NQP4 DLGAP1-205ENST00000400150 5332 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PFDN4Q9NQP4 LRRC34-208ENST00000522830 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PFDN4Q9NQP4 FAM193A-201ENST00000324666 4846 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PFDN4Q9NQP4 GABRA1-201ENST00000023897 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PFDN4Q9NQP4 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PFDN4Q9NQP4 TPRX1-202ENST00000535759 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PFDN4Q9NQP4 KRT17-201ENST00000311208 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PFDN4Q9NQP4 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PFDN4Q9NQP4 KCNH6-202ENST00000456941 2928 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PFDN4Q9NQP4 YWHAE-208ENST00000571732 1818 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PFDN4Q9NQP4 MAP4K2-201ENST00000294066 7178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PFDN4Q9NQP4 SLFNL1-204ENST00000372613 2654 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PFDN4Q9NQP4 ACP7-201ENST00000331256 2966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PFDN4Q9NQP4 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PFDN4Q9NQP4 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PFDN4Q9NQP4 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PFDN4Q9NQP4 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PFDN4Q9NQP4 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PFDN4Q9NQP4 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PFDN4Q9NQP4 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PFDN4Q9NQP4 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
PFDN4Q9NQP4 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PFDN4Q9NQP4 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PFDN4Q9NQP4 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PFDN4Q9NQP4 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PFDN4Q9NQP4 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PFDN4Q9NQP4 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
PFDN4Q9NQP4 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PFDN4Q9NQP4 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PFDN4Q9NQP4 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PFDN4Q9NQP4 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
PFDN4Q9NQP4 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
PFDN4Q9NQP4 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PFDN4Q9NQP4 AC092634.8-201ENST00000639687 773 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PFDN4Q9NQP4 GOLGA8R-201ENST00000327271 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PFDN4Q9NQP4 ZNF718-202ENST00000609714 2772 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PFDN4Q9NQP4 CYP20A1-201ENST00000356079 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PFDN4Q9NQP4 MBLAC2-202ENST00000514906 1936 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
PFDN4Q9NQP4 ATL3-203ENST00000538786 1920 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PFDN4Q9NQP4 LINC01138-206ENST00000622328 2212 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PFDN4Q9NQP4 CYP4F11-202ENST00000326742 2877 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PFDN4Q9NQP4 CEP131-202ENST00000374782 3505 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PFDN4Q9NQP4 AC002407.1-201ENST00000636668 3863 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PFDN4Q9NQP4 ARID3B-206ENST00000622429 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PFDN4Q9NQP4 EGR2-201ENST00000242480 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PFDN4Q9NQP4 TIAM1-201ENST00000286827 7200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
PFDN4Q9NQP4 CACNA1G-209ENST00000502264 6921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PFDN4Q9NQP4 CACNA1G-221ENST00000510115 6912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PFDN4Q9NQP4 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PFDN4Q9NQP4 ZMYND15-201ENST00000269289 2448 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
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PFDN4Q9NQP4 XPNPEP1-218ENST00000502935 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PFDN4Q9NQP4 MAP4-204ENST00000395734 5590 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
PFDN4Q9NQP4 FKBP6-201ENST00000252037 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PFDN4Q9NQP4 USP19-202ENST00000398888 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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PFDN4Q9NQP4 OTP-201ENST00000306422 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PFDN4Q9NQP4 SIGLEC6-202ENST00000346477 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
PFDN4Q9NQP4 PHACTR2-202ENST00000367582 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PFDN4Q9NQP4 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PFDN4Q9NQP4 DNM1-212ENST00000627543 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
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PFDN4Q9NQP4 GTF2IRD1-202ENST00000424337 3077 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PFDN4Q9NQP4 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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PFDN4Q9NQP4 GPT2-201ENST00000340124 3984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PFDN4Q9NQP4 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PFDN4Q9NQP4 RER1-207ENST00000488353 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PFDN4Q9NQP4 C19orf57-204ENST00000586783 2454 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
PFDN4Q9NQP4 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
PFDN4Q9NQP4 CNN2-201ENST00000263097 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PFDN4Q9NQP4 CNN2-205ENST00000562958 2194 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
PFDN4Q9NQP4 LPO-201ENST00000262290 2979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PFDN4Q9NQP4 SPECC1-202ENST00000395522 2982 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PFDN4Q9NQP4 TNIP1-214ENST00000522226 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
PFDN4Q9NQP4 SSTR1-201ENST00000267377 4295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
PFDN4Q9NQP4 MRVI1-204ENST00000527509 2686 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PFDN4Q9NQP4 P2RX5-207ENST00000551178 1863 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PFDN4Q9NQP4 NDUFA10-201ENST00000252711 4915 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PFDN4Q9NQP4 CHRNA3-201ENST00000326828 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PFDN4Q9NQP4 NHSL1-204ENST00000427025 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
PFDN4Q9NQP4 ACSM2A-209ENST00000573854 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PFDN4Q9NQP4 FRMD8-201ENST00000317568 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PFDN4Q9NQP4 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
PFDN4Q9NQP4 CHRD-206ENST00000450923 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PFDN4Q9NQP4 RPARP-AS1-202ENST00000492465 1556 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PFDN4Q9NQP4 RIN3-201ENST00000216487 3859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PFDN4Q9NQP4 NUBPL-201ENST00000281081 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
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