Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP61

ARFGAP3, ADP-ribosylation factor GTPase-activating protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 516 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARFGAP3Q9NP61 HECTD1-219ENST00000611816 8980 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ARFGAP3Q9NP61 NEDD4L-238ENST00000635997 4402 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ARFGAP3Q9NP61 ADAMTS13-202ENST00000356589 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ARFGAP3Q9NP61 BCAR3-210ENST00000539242 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ARFGAP3Q9NP61 HELLS-202ENST00000348459 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ARFGAP3Q9NP61 SLC43A2-201ENST00000301335 8136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ARFGAP3Q9NP61 AMT-221ENST00000538581 2038 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ARFGAP3Q9NP61 AC005865.2-203ENST00000636557 2959 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ARFGAP3Q9NP61 TMUB2-211ENST00000589184 1837 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ARFGAP3Q9NP61 NR4A1-202ENST00000360284 2589 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ARFGAP3Q9NP61 GRIK4-202ENST00000438375 4214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ARFGAP3Q9NP61 SLC26A6-213ENST00000455886 2460 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ARFGAP3Q9NP61 TMEM25-204ENST00000359862 2395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ARFGAP3Q9NP61 KDELR1-201ENST00000330720 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ARFGAP3Q9NP61 CREB3L4-204ENST00000368603 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ARFGAP3Q9NP61 MAMDC4-202ENST00000445819 3895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ARFGAP3Q9NP61 MIRLET7BHG-201ENST00000360737 4560 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ARFGAP3Q9NP61 SLC52A1-203ENST00000512825 2989 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ARFGAP3Q9NP61 LRRC41-208ENST00000617760 2158 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ARFGAP3Q9NP61 AXIN2-201ENST00000307078 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ARFGAP3Q9NP61 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ARFGAP3Q9NP61 ATXN2L-215ENST00000564304 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ARFGAP3Q9NP61 CLCN6-201ENST00000312413 5631 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ARFGAP3Q9NP61 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ARFGAP3Q9NP61 PI4KA-201ENST00000255882 6752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ARFGAP3Q9NP61 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ARFGAP3Q9NP61 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ARFGAP3Q9NP61 INMT-201ENST00000013222 2559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ARFGAP3Q9NP61 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ARFGAP3Q9NP61 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
ARFGAP3Q9NP61 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ARFGAP3Q9NP61 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
ARFGAP3Q9NP61 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ARFGAP3Q9NP61 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ARFGAP3Q9NP61 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
ARFGAP3Q9NP61 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ARFGAP3Q9NP61 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ARFGAP3Q9NP61 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ARFGAP3Q9NP61 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ARFGAP3Q9NP61 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
ARFGAP3Q9NP61 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ARFGAP3Q9NP61 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
ARFGAP3Q9NP61 GAPVD1-205ENST00000394084 3190 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ARFGAP3Q9NP61 TUNAR-201ENST00000503525 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ARFGAP3Q9NP61 NOTCH1-201ENST00000277541 9371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ARFGAP3Q9NP61 CXCL12-201ENST00000343575 1857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ARFGAP3Q9NP61 AGRN-210ENST00000620552 7394 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ARFGAP3Q9NP61 HPCAL4-201ENST00000372844 4856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ARFGAP3Q9NP61 AL022326.1-201ENST00000434516 1778 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ARFGAP3Q9NP61 SLC41A3-204ENST00000383598 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ARFGAP3Q9NP61 TMEM87B-201ENST00000283206 5212 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ARFGAP3Q9NP61 CCDC47-201ENST00000225726 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ARFGAP3Q9NP61 AC025171.1-202ENST00000499871 2271 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ARFGAP3Q9NP61 ZYG11A-201ENST00000371528 4469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ARFGAP3Q9NP61 CTIF-202ENST00000382998 4407 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ARFGAP3Q9NP61 PDE4D-203ENST00000340635 8232 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ARFGAP3Q9NP61 MEST-206ENST00000416162 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ARFGAP3Q9NP61 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ARFGAP3Q9NP61 SLIT3-206ENST00000519560 9706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ARFGAP3Q9NP61 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ARFGAP3Q9NP61 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ARFGAP3Q9NP61 PIK3R3-203ENST00000420542 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ARFGAP3Q9NP61 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ARFGAP3Q9NP61 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ARFGAP3Q9NP61 SF1-205ENST00000377394 2854 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ARFGAP3Q9NP61 NAPB-202ENST00000398425 3824 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ARFGAP3Q9NP61 LRRC32-201ENST00000260061 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ARFGAP3Q9NP61 DHRS4-AS1-204ENST00000555045 1848 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ARFGAP3Q9NP61 UMODL1-204ENST00000400427 5442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ARFGAP3Q9NP61 ADCYAP1R1-204ENST00000409489 1761 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ARFGAP3Q9NP61 CFAP157-206ENST00000614677 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ARFGAP3Q9NP61 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ARFGAP3Q9NP61 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ARFGAP3Q9NP61 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ARFGAP3Q9NP61 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ARFGAP3Q9NP61 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ARFGAP3Q9NP61 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ARFGAP3Q9NP61 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ARFGAP3Q9NP61 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
ARFGAP3Q9NP61 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ARFGAP3Q9NP61 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ARFGAP3Q9NP61 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ARFGAP3Q9NP61 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
ARFGAP3Q9NP61 PLLP-205ENST00000613167 7578 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ARFGAP3Q9NP61 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ARFGAP3Q9NP61 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ARFGAP3Q9NP61 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ARFGAP3Q9NP61 GMCL1-201ENST00000282570 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ARFGAP3Q9NP61 FHOD3-201ENST00000257209 4967 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ARFGAP3Q9NP61 SLC1A1-201ENST00000262352 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ARFGAP3Q9NP61 ASAP3-202ENST00000437606 2865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ARFGAP3Q9NP61 MAP3K3-203ENST00000577395 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ARFGAP3Q9NP61 CBLB-204ENST00000405772 3237 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ARFGAP3Q9NP61 ELL-201ENST00000262809 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ARFGAP3Q9NP61 STIM1-220ENST00000616714 4356 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ARFGAP3Q9NP61 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ARFGAP3Q9NP61 CCDC126-202ENST00000409765 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ARFGAP3Q9NP61 OS9-206ENST00000435406 2346 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ARFGAP3Q9NP61 SPATA7-217ENST00000556553 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ARFGAP3Q9NP61 P2RX5-208ENST00000552050 1536 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.4 ms