Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSI4

TINF2, TERF1-interacting nuclear factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 451 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TINF2Q9BSI4 SOX2-OT-208ENST00000477928 902 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TINF2Q9BSI4 AC026410.1-201ENST00000507366 1101 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
TINF2Q9BSI4 HMGCLL1-208ENST00000508459 884 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TINF2Q9BSI4 INCA1-203ENST00000575780 1221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TINF2Q9BSI4 MIR4472-1-201ENST00000584349 80 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
TINF2Q9BSI4 LINC02081-203ENST00000591384 867 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TINF2Q9BSI4 AC020934.2-201ENST00000592400 456 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TINF2Q9BSI4 AL133467.4-201ENST00000602953 725 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
TINF2Q9BSI4 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TINF2Q9BSI4 SLC38A6-201ENST00000267488 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TINF2Q9BSI4 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TINF2Q9BSI4 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TINF2Q9BSI4 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TINF2Q9BSI4 MYRF-203ENST00000389602 2052 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TINF2Q9BSI4 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TINF2Q9BSI4 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TINF2Q9BSI4 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TINF2Q9BSI4 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TINF2Q9BSI4 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TINF2Q9BSI4 TMPRSS4-211ENST00000522307 1634 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TINF2Q9BSI4 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TINF2Q9BSI4 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TINF2Q9BSI4 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TINF2Q9BSI4 LILRA2-203ENST00000391737 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TINF2Q9BSI4 KAT5-216ENST00000534650 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TINF2Q9BSI4 LTF-202ENST00000417439 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TINF2Q9BSI4 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TINF2Q9BSI4 XKRX-202ENST00000468904 2249 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TINF2Q9BSI4 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TINF2Q9BSI4 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TINF2Q9BSI4 RBM4B-201ENST00000310046 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TINF2Q9BSI4 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TINF2Q9BSI4 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
TINF2Q9BSI4 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
TINF2Q9BSI4 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TINF2Q9BSI4 IL17B-201ENST00000261796 696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TINF2Q9BSI4 BAX-205ENST00000391871 687 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TINF2Q9BSI4 PPM1N-201ENST00000396735 895 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TINF2Q9BSI4 ACTG2-204ENST00000409918 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TINF2Q9BSI4 AL390778.2-201ENST00000420883 886 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TINF2Q9BSI4 RNF144A-AS1-203ENST00000426122 579 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TINF2Q9BSI4 AL592301.1-201ENST00000439501 864 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TINF2Q9BSI4 PPM1N-208ENST00000456399 618 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TINF2Q9BSI4 ACTN1-AS1-202ENST00000553961 599 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TINF2Q9BSI4 PGPEP1-203ENST00000595066 762 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TINF2Q9BSI4 AC006158.1-201ENST00000610661 249 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
TINF2Q9BSI4 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TINF2Q9BSI4 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TINF2Q9BSI4 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TINF2Q9BSI4 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TINF2Q9BSI4 TRMT10B-207ENST00000537911 2108 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TINF2Q9BSI4 NDRG2-226ENST00000554104 2146 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TINF2Q9BSI4 CCDC47-201ENST00000225726 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TINF2Q9BSI4 PLTP-203ENST00000372431 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TINF2Q9BSI4 SEPT9-228ENST00000590294 2816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TINF2Q9BSI4 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TINF2Q9BSI4 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TINF2Q9BSI4 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TINF2Q9BSI4 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TINF2Q9BSI4 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TINF2Q9BSI4 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TINF2Q9BSI4 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TINF2Q9BSI4 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TINF2Q9BSI4 CD3EAP-202ENST00000589804 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TINF2Q9BSI4 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TINF2Q9BSI4 TNFRSF1A-202ENST00000366159 1339 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TINF2Q9BSI4 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TINF2Q9BSI4 C2-205ENST00000418949 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TINF2Q9BSI4 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TINF2Q9BSI4 SH3GLB2-205ENST00000416629 1415 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TINF2Q9BSI4 Z84468.1-201ENST00000626321 1408 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TINF2Q9BSI4 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TINF2Q9BSI4 SNX2-201ENST00000379516 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TINF2Q9BSI4 EFHC1-212ENST00000635984 3293 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TINF2Q9BSI4 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TINF2Q9BSI4 VDAC1-201ENST00000265333 1953 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TINF2Q9BSI4 MX1-218ENST00000619682 1980 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TINF2Q9BSI4 FGD4-203ENST00000472289 1629 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TINF2Q9BSI4 AK1-202ENST00000373156 757 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TINF2Q9BSI4 CXCL12-205ENST00000395794 1052 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TINF2Q9BSI4 LINC01433-201ENST00000419003 697 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TINF2Q9BSI4 RGS5-216ENST00000449680 788 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TINF2Q9BSI4 SCARNA12-201ENST00000459155 270 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
TINF2Q9BSI4 DMKN-229ENST00000467637 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TINF2Q9BSI4 AC034231.1-201ENST00000507251 537 ntTSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TINF2Q9BSI4 PRR7-AS1-204ENST00000514846 543 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TINF2Q9BSI4 NDUFB10P1-201ENST00000567319 521 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
TINF2Q9BSI4 ZNF586-204ENST00000598183 603 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TINF2Q9BSI4 ANXA8L1-206ENST00000619162 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TINF2Q9BSI4 SLC12A5-219ENST00000628272 401 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TINF2Q9BSI4 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TINF2Q9BSI4 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TINF2Q9BSI4 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TINF2Q9BSI4 NMBR-201ENST00000258042 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TINF2Q9BSI4 POLR3K-201ENST00000293860 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TINF2Q9BSI4 MINDY4B-201ENST00000465419 1383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TINF2Q9BSI4 LINC02537-201ENST00000635943 1367 ntTSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TINF2Q9BSI4 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TINF2Q9BSI4 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TINF2Q9BSI4 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.5 ms