Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ49

SMIM7, Small integral membrane protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 75 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM7Q9BQ49 TBC1D3-201ENST00000620215 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
SMIM7Q9BQ49 TBC1D3C-201ENST00000622206 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
SMIM7Q9BQ49 MLF1-201ENST00000355893 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
SMIM7Q9BQ49 INSC-207ENST00000528567 2237 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
SMIM7Q9BQ49 VILL-201ENST00000283713 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
SMIM7Q9BQ49 CYP51A1-AS1-201ENST00000453068 2957 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
SMIM7Q9BQ49 SFRP1-202ENST00000379845 3873 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
SMIM7Q9BQ49 CCDC92-208ENST00000545135 4883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
SMIM7Q9BQ49 OPRK1-201ENST00000265572 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
SMIM7Q9BQ49 DYSF-208ENST00000410020 6657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
SMIM7Q9BQ49 DCAF11-204ENST00000446197 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
SMIM7Q9BQ49 RBM19-201ENST00000261741 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
SMIM7Q9BQ49 VHL-201ENST00000256474 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
SMIM7Q9BQ49 NCSTN-201ENST00000294785 2936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
SMIM7Q9BQ49 TRIB2-202ENST00000381465 2778 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
SMIM7Q9BQ49 CARS-214ENST00000529772 2637 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
SMIM7Q9BQ49 MKLN1-203ENST00000421797 2460 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
SMIM7Q9BQ49 FAM189A2-204ENST00000455972 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
SMIM7Q9BQ49 FAM124B-201ENST00000243806 2030 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
SMIM7Q9BQ49 CNN2-202ENST00000348419 2033 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
SMIM7Q9BQ49 CSGALNACT1-211ENST00000522854 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
SMIM7Q9BQ49 SGK2-203ENST00000373092 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
SMIM7Q9BQ49 RIOK3-203ENST00000577501 1904 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
SMIM7Q9BQ49 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
SMIM7Q9BQ49 INSC-208ENST00000530161 1702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
SMIM7Q9BQ49 DUOXA1-205ENST00000558422 1678 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
SMIM7Q9BQ49 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
SMIM7Q9BQ49 TINF2-215ENST00000626689 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
SMIM7Q9BQ49 RAB5B-202ENST00000448789 1530 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
SMIM7Q9BQ49 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
SMIM7Q9BQ49 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
SMIM7Q9BQ49 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
SMIM7Q9BQ49 CACNA1G-232ENST00000515411 6960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
SMIM7Q9BQ49 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
SMIM7Q9BQ49 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
SMIM7Q9BQ49 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
SMIM7Q9BQ49 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
SMIM7Q9BQ49 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.47□□□□□ -0.57
SMIM7Q9BQ49 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
SMIM7Q9BQ49 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
SMIM7Q9BQ49 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC11.47□□□□□ -0.57
SMIM7Q9BQ49 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
SMIM7Q9BQ49 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
SMIM7Q9BQ49 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
SMIM7Q9BQ49 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
SMIM7Q9BQ49 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
SMIM7Q9BQ49 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
SMIM7Q9BQ49 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC11.47□□□□□ -0.57
SMIM7Q9BQ49 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC11.47□□□□□ -0.57
SMIM7Q9BQ49 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
SMIM7Q9BQ49 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
SMIM7Q9BQ49 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
SMIM7Q9BQ49 INCENP-201ENST00000278849 3698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
SMIM7Q9BQ49 AGPAT3-202ENST00000327505 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
SMIM7Q9BQ49 AGPAT3-204ENST00000398061 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
SMIM7Q9BQ49 RBM10-201ENST00000329236 3201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
SMIM7Q9BQ49 NTNG1-206ENST00000370071 3149 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
SMIM7Q9BQ49 RS1-201ENST00000379984 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
SMIM7Q9BQ49 CXCR5-201ENST00000292174 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
SMIM7Q9BQ49 STK33-203ENST00000396672 2558 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
SMIM7Q9BQ49 PEG10-205ENST00000612748 2585 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
SMIM7Q9BQ49 TNFRSF21-201ENST00000296861 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
SMIM7Q9BQ49 MARK2-205ENST00000408948 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
SMIM7Q9BQ49 ZNF689-201ENST00000287461 3547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
SMIM7Q9BQ49 NCDN-201ENST00000356090 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
SMIM7Q9BQ49 KIF12-201ENST00000374118 2001 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
SMIM7Q9BQ49 DFFA-202ENST00000377038 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
SMIM7Q9BQ49 COASY-211ENST00000590958 1976 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
SMIM7Q9BQ49 CYB5RL-201ENST00000287899 5777 ntTSL 3 BASIC11.47□□□□□ -0.57
SMIM7Q9BQ49 TBX6-202ENST00000395224 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
SMIM7Q9BQ49 TRIM35-201ENST00000305364 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
SMIM7Q9BQ49 PRMT7-201ENST00000339507 4238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
SMIM7Q9BQ49 EMBP1-203ENST00000622787 4235 ntTSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
SMIM7Q9BQ49 MARCH3-201ENST00000308660 4196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
SMIM7Q9BQ49 ADAMTSL4-202ENST00000369038 4167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
SMIM7Q9BQ49 TJP2-206ENST00000453658 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
SMIM7Q9BQ49 CCDC13-201ENST00000310232 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
SMIM7Q9BQ49 TPR-201ENST00000367478 9708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
SMIM7Q9BQ49 DYNC1I1-202ENST00000359388 2843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
SMIM7Q9BQ49 CARHSP1-217ENST00000611932 2833 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.46□□□□□ -0.57
SMIM7Q9BQ49 OTUD6A-201ENST00000338352 1689 ntAPPRIS P1 BASIC11.46□□□□□ -0.57
SMIM7Q9BQ49 KIAA1191-202ENST00000393725 2700 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
SMIM7Q9BQ49 CDC37-201ENST00000222005 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
SMIM7Q9BQ49 SYNM-203ENST00000560674 5908 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
SMIM7Q9BQ49 SCN8A-209ENST00000627620 5943 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
SMIM7Q9BQ49 TJAP1-204ENST00000372449 2695 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
SMIM7Q9BQ49 RTFDC1-203ENST00000395881 1572 ntTSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
SMIM7Q9BQ49 PCMTD1-208ENST00000544451 3697 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
SMIM7Q9BQ49 LRPAP1-202ENST00000500728 7819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
SMIM7Q9BQ49 GLB1L-202ENST00000392089 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
SMIM7Q9BQ49 PAK1-201ENST00000278568 2543 ntTSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
SMIM7Q9BQ49 MYO1D-202ENST00000394649 5451 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
SMIM7Q9BQ49 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
SMIM7Q9BQ49 ENO2-201ENST00000229277 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
SMIM7Q9BQ49 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
SMIM7Q9BQ49 AGAP12P-201ENST00000585227 2359 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
SMIM7Q9BQ49 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
SMIM7Q9BQ49 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
SMIM7Q9BQ49 PCNX4-202ENST00000391611 4073 ntTSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
SMIM7Q9BQ49 AC107375.1-201ENST00000564464 2231 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.8 ms