Protein–RNA interactions for Protein: Q96LT4

SAMD8, Sphingomyelin synthase-related protein 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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SAMD8Q96LT4 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SAMD8Q96LT4 NFIX-208ENST00000587260 1537 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SAMD8Q96LT4 PARP1-203ENST00000366794 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
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SAMD8Q96LT4 SLC35C2-213ENST00000543605 5740 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SAMD8Q96LT4 MMAB-210ENST00000545712 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
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SAMD8Q96LT4 ATL2-210ENST00000452935 2199 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
SAMD8Q96LT4 RHOH-220ENST00000615083 2156 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.38□□□□□ -0.27
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SAMD8Q96LT4 NUMB-216ENST00000555394 3037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SAMD8Q96LT4 CD68-202ENST00000380498 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SAMD8Q96LT4 BCL11B-201ENST00000345514 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
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SAMD8Q96LT4 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
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SAMD8Q96LT4 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
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SAMD8Q96LT4 CDRT15-202ENST00000431716 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
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SAMD8Q96LT4 SNHG11-209ENST00000440918 556 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
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SAMD8Q96LT4 PLEKHA7-214ENST00000532079 565 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
SAMD8Q96LT4 KSR1-207ENST00000578981 748 ntTSL 4 BASIC13.37□□□□□ -0.27
SAMD8Q96LT4 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
SAMD8Q96LT4 PRCD-204ENST00000586148 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
SAMD8Q96LT4 FP236240.1-204ENST00000624932 712 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
SAMD8Q96LT4 CHD1L-211ENST00000639534 1144 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
SAMD8Q96LT4 HHEX-202ENST00000472590 1605 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
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