Protein–RNA interactions for Protein: Q96GF1

RNF185, E3 ubiquitin-protein ligase RNF185, humanhuman

Predictions only

Length 192 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF185Q96GF1 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC10.66□□□□□ -0.7
RNF185Q96GF1 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
RNF185Q96GF1 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
RNF185Q96GF1 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
RNF185Q96GF1 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
RNF185Q96GF1 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
RNF185Q96GF1 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
RNF185Q96GF1 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
RNF185Q96GF1 PRSS30P-206ENST00000641773 873 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
RNF185Q96GF1 BX005266.2-201ENST00000450704 1549 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
RNF185Q96GF1 SLC7A7-201ENST00000285850 2263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
RNF185Q96GF1 POM121-202ENST00000395270 7011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
RNF185Q96GF1 ZNF783-202ENST00000434415 4452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
RNF185Q96GF1 SSBP2-220ENST00000615665 4465 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
RNF185Q96GF1 FRMD8-201ENST00000317568 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
RNF185Q96GF1 C12orf73-201ENST00000378090 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
RNF185Q96GF1 PLEKHB2-207ENST00000438882 1460 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
RNF185Q96GF1 MKRN5P-201ENST00000445263 1467 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
RNF185Q96GF1 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
RNF185Q96GF1 ARHGEF26-202ENST00000465093 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
RNF185Q96GF1 MAP7-202ENST00000432797 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
RNF185Q96GF1 CLCN4-201ENST00000380829 2418 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
RNF185Q96GF1 PABPC1-208ENST00000519004 2401 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
RNF185Q96GF1 SNX19-201ENST00000265909 6535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
RNF185Q96GF1 ZNF559-202ENST00000393883 5095 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
RNF185Q96GF1 LIMK1-208ENST00000538333 2170 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
RNF185Q96GF1 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
RNF185Q96GF1 COL6A2-203ENST00000397763 3101 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
RNF185Q96GF1 FIBCD1-204ENST00000448616 3119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
RNF185Q96GF1 SLC22A23-202ENST00000380302 2883 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
RNF185Q96GF1 ZNF202-207ENST00000530393 3564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
RNF185Q96GF1 CCND3-215ENST00000511642 2394 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
RNF185Q96GF1 CBX3-201ENST00000337620 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
RNF185Q96GF1 FES-201ENST00000328850 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
RNF185Q96GF1 GAD2-203ENST00000376261 5858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
RNF185Q96GF1 AC022007.1-201ENST00000383808 1897 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
RNF185Q96GF1 ZNF821-214ENST00000565601 1858 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
RNF185Q96GF1 POU2AF1-201ENST00000393067 3295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
RNF185Q96GF1 THEMIS2-201ENST00000328928 2337 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
RNF185Q96GF1 TK1-201ENST00000301634 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
RNF185Q96GF1 AP000437.1-201ENST00000624057 2085 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
RNF185Q96GF1 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
RNF185Q96GF1 HMGA1-203ENST00000374116 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
RNF185Q96GF1 TBX6-202ENST00000395224 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
RNF185Q96GF1 MAGEA2-203ENST00000611557 2024 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
RNF185Q96GF1 HSD17B6-205ENST00000554643 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
RNF185Q96GF1 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
RNF185Q96GF1 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
RNF185Q96GF1 PURA-201ENST00000331327 11497 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
RNF185Q96GF1 PBRM1-204ENST00000394830 5071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
RNF185Q96GF1 CCSER2-203ENST00000372088 7657 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
RNF185Q96GF1 HSD17B6-201ENST00000322165 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
RNF185Q96GF1 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
RNF185Q96GF1 C4B-201ENST00000425700 5237 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
RNF185Q96GF1 PELP1-201ENST00000301396 3673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
RNF185Q96GF1 KANK2-205ENST00000589359 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
RNF185Q96GF1 MARK2P9-201ENST00000430958 1727 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
RNF185Q96GF1 RBFADN-204ENST00000568911 5187 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
RNF185Q96GF1 NLRP7-207ENST00000590030 3209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
RNF185Q96GF1 AC093899.2-201ENST00000513963 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
RNF185Q96GF1 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
RNF185Q96GF1 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
RNF185Q96GF1 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
RNF185Q96GF1 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
RNF185Q96GF1 TAF8-202ENST00000372978 794 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
RNF185Q96GF1 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
RNF185Q96GF1 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
RNF185Q96GF1 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
RNF185Q96GF1 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
RNF185Q96GF1 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
RNF185Q96GF1 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
RNF185Q96GF1 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
RNF185Q96GF1 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
RNF185Q96GF1 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
RNF185Q96GF1 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
RNF185Q96GF1 AC136604.1-202ENST00000425471 771 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
RNF185Q96GF1 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
RNF185Q96GF1 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
RNF185Q96GF1 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
RNF185Q96GF1 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
RNF185Q96GF1 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
RNF185Q96GF1 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
RNF185Q96GF1 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
RNF185Q96GF1 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
RNF185Q96GF1 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
RNF185Q96GF1 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
RNF185Q96GF1 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
RNF185Q96GF1 AC026410.3-201ENST00000514280 936 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
RNF185Q96GF1 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
RNF185Q96GF1 AC103988.2-201ENST00000561804 725 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
RNF185Q96GF1 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
RNF185Q96GF1 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
RNF185Q96GF1 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
RNF185Q96GF1 RPP40-202ENST00000380051 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
RNF185Q96GF1 HSPA1L-201ENST00000375654 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
RNF185Q96GF1 RAB18-207ENST00000535776 4811 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
RNF185Q96GF1 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
RNF185Q96GF1 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
RNF185Q96GF1 MAP7-201ENST00000354570 4152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
RNF185Q96GF1 SGCE-202ENST00000415788 1871 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.8 ms