Protein–RNA interactions for Protein: Q8IX21

SLF2, SMC5-SMC6 complex localization factor protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLF2Q8IX21 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SLF2Q8IX21 C16orf45-209ENST00000566490 1854 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SLF2Q8IX21 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SLF2Q8IX21 GDI2-203ENST00000380191 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SLF2Q8IX21 SEC16A-202ENST00000290037 8982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SLF2Q8IX21 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SLF2Q8IX21 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SLF2Q8IX21 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SLF2Q8IX21 AL354702.1-201ENST00000442006 1960 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
SLF2Q8IX21 ZNF417-203ENST00000595559 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SLF2Q8IX21 VWCE-205ENST00000535710 1437 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SLF2Q8IX21 SYMPK-213ENST00000599460 5449 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SLF2Q8IX21 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SLF2Q8IX21 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SLF2Q8IX21 PLTP-203ENST00000372431 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SLF2Q8IX21 LAP3P2-201ENST00000454686 1454 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
SLF2Q8IX21 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SLF2Q8IX21 OR2I1P-209ENST00000641730 5365 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
SLF2Q8IX21 MEF2D-201ENST00000348159 5965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SLF2Q8IX21 C3orf62-201ENST00000343010 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SLF2Q8IX21 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SLF2Q8IX21 IRF9-202ENST00000396864 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SLF2Q8IX21 CCDC6-201ENST00000263102 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SLF2Q8IX21 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SLF2Q8IX21 CALD1-222ENST00000495522 2199 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SLF2Q8IX21 AMHR2-201ENST00000257863 1863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SLF2Q8IX21 GMEB1-202ENST00000361872 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SLF2Q8IX21 NDUFB8-201ENST00000299166 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SLF2Q8IX21 JTB-202ENST00000356648 1040 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SLF2Q8IX21 CMTM5-203ENST00000359320 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SLF2Q8IX21 BEX2-201ENST00000372674 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SLF2Q8IX21 LYPLA2-202ENST00000374502 1072 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SLF2Q8IX21 IGF2-201ENST00000381389 1023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SLF2Q8IX21 MIR557-201ENST00000385239 98 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
SLF2Q8IX21 FOLR1-202ENST00000393676 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SLF2Q8IX21 AC083949.1-201ENST00000422013 657 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SLF2Q8IX21 AL158825.2-201ENST00000455336 670 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SLF2Q8IX21 FBXO24-204ENST00000465843 957 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SLF2Q8IX21 TSHR-205ENST00000554263 1184 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SLF2Q8IX21 TSHR-206ENST00000554435 1089 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SLF2Q8IX21 AL031713.1-201ENST00000564813 661 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
SLF2Q8IX21 FAM104A-206ENST00000583024 417 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SLF2Q8IX21 AP005264.1-201ENST00000586226 733 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SLF2Q8IX21 SIGLEC18P-201ENST00000602271 909 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
SLF2Q8IX21 COX6A1P2-201ENST00000620597 330 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
SLF2Q8IX21 AC007718.1-201ENST00000621078 280 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
SLF2Q8IX21 SLC12A5-216ENST00000626701 617 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SLF2Q8IX21 AC009975.2-202ENST00000634539 854 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SLF2Q8IX21 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SLF2Q8IX21 CNN1-201ENST00000252456 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SLF2Q8IX21 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SLF2Q8IX21 SEZ6L-209ENST00000529632 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SLF2Q8IX21 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SLF2Q8IX21 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SLF2Q8IX21 ARV1-201ENST00000310256 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SLF2Q8IX21 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SLF2Q8IX21 SPATA6-204ENST00000396199 4964 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SLF2Q8IX21 PCDHGB5-202ENST00000621169 2670 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SLF2Q8IX21 ZNF77-201ENST00000314531 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SLF2Q8IX21 ZNF559-202ENST00000393883 5095 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SLF2Q8IX21 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SLF2Q8IX21 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SLF2Q8IX21 STAG3L2-201ENST00000426587 2130 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SLF2Q8IX21 EBP-205ENST00000495186 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SLF2Q8IX21 MRGPRX4-201ENST00000314254 1444 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SLF2Q8IX21 SNPH-203ENST00000614659 5354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SLF2Q8IX21 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SLF2Q8IX21 BAG4-201ENST00000287322 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLF2Q8IX21 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLF2Q8IX21 TEAD3-202ENST00000402886 2729 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLF2Q8IX21 AP002990.1-202ENST00000496634 5064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLF2Q8IX21 ALDH8A1-204ENST00000367847 1587 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLF2Q8IX21 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLF2Q8IX21 THBS2-206ENST00000617924 5280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLF2Q8IX21 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLF2Q8IX21 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLF2Q8IX21 PORCN-204ENST00000361988 1672 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLF2Q8IX21 LIMS2-209ENST00000410038 1695 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLF2Q8IX21 CRYBB1-201ENST00000215939 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLF2Q8IX21 ZCCHC13-201ENST00000339534 842 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLF2Q8IX21 UBL4A-201ENST00000369653 711 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLF2Q8IX21 ARL16-201ENST00000397498 1227 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLF2Q8IX21 TMEM219-202ENST00000414689 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLF2Q8IX21 MIR4435-2HG-204ENST00000419736 777 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLF2Q8IX21 AL807761.2-201ENST00000422849 729 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
SLF2Q8IX21 LAMA4-208ENST00000431543 1080 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLF2Q8IX21 UBXN7-AS1-201ENST00000442941 386 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLF2Q8IX21 AC009403.1-204ENST00000469539 597 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLF2Q8IX21 AC130709.1-201ENST00000484779 1212 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
SLF2Q8IX21 TMEM218-205ENST00000527271 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLF2Q8IX21 SAP25-201ENST00000538735 837 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLF2Q8IX21 KRT8P1-201ENST00000557533 1207 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
SLF2Q8IX21 TMEM219-204ENST00000566848 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLF2Q8IX21 AC005726.2-204ENST00000577790 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLF2Q8IX21 FBXL12-202ENST00000585379 956 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLF2Q8IX21 AC090386.1-202ENST00000586610 469 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLF2Q8IX21 DYRK1B-208ENST00000601972 772 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLF2Q8IX21 ARL16-214ENST00000621051 1181 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLF2Q8IX21 AC245100.1-201ENST00000452996 1331 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLF2Q8IX21 HMBS-216ENST00000543090 1347 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47 ms