Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVU3

HERC6, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC6, humanhuman

Predictions only

Length 1,022 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC6Q8IVU3 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
HERC6Q8IVU3 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
HERC6Q8IVU3 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
HERC6Q8IVU3 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HERC6Q8IVU3 ZC3H14-204ENST00000336693 2007 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HERC6Q8IVU3 CERS3-202ENST00000394113 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HERC6Q8IVU3 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HERC6Q8IVU3 BAIAP2-201ENST00000321280 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HERC6Q8IVU3 SIGLEC6-202ENST00000346477 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
HERC6Q8IVU3 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HERC6Q8IVU3 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HERC6Q8IVU3 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
HERC6Q8IVU3 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HERC6Q8IVU3 LINC02021-201ENST00000504808 1608 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
HERC6Q8IVU3 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
HERC6Q8IVU3 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HERC6Q8IVU3 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HERC6Q8IVU3 ACTL7A-201ENST00000333999 1494 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
HERC6Q8IVU3 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HERC6Q8IVU3 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HERC6Q8IVU3 CTSL-201ENST00000340342 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HERC6Q8IVU3 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
HERC6Q8IVU3 AURKB-201ENST00000316199 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HERC6Q8IVU3 TTPAL-203ENST00000372906 1139 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
HERC6Q8IVU3 PTGES3-203ENST00000436399 941 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
HERC6Q8IVU3 SNHG14-209ENST00000456576 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HERC6Q8IVU3 AC026410.1-201ENST00000507366 1101 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
HERC6Q8IVU3 AC051619.5-201ENST00000559003 736 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
HERC6Q8IVU3 TMEM98-205ENST00000578289 806 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
HERC6Q8IVU3 RN7SL596P-201ENST00000582123 288 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
HERC6Q8IVU3 PGPEP1-206ENST00000597431 545 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
HERC6Q8IVU3 AC005041.3-201ENST00000606287 649 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
HERC6Q8IVU3 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HERC6Q8IVU3 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
HERC6Q8IVU3 ZNF619-201ENST00000314686 2233 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
HERC6Q8IVU3 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HERC6Q8IVU3 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
HERC6Q8IVU3 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HERC6Q8IVU3 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HERC6Q8IVU3 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HERC6Q8IVU3 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HERC6Q8IVU3 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
HERC6Q8IVU3 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
HERC6Q8IVU3 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
HERC6Q8IVU3 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
HERC6Q8IVU3 SOWAHA-201ENST00000378693 3211 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HERC6Q8IVU3 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HERC6Q8IVU3 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HERC6Q8IVU3 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HERC6Q8IVU3 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HERC6Q8IVU3 AL513327.1-206ENST00000587696 1432 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HERC6Q8IVU3 MEIKIN-205ENST00000616644 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HERC6Q8IVU3 LINC01815-202ENST00000641468 1409 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
HERC6Q8IVU3 ELP5-203ENST00000396627 1389 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HERC6Q8IVU3 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HERC6Q8IVU3 IMPA1-201ENST00000256108 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HERC6Q8IVU3 MTMR9-202ENST00000526292 1960 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HERC6Q8IVU3 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HERC6Q8IVU3 CALR3-201ENST00000269881 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HERC6Q8IVU3 Metazoa_SRP.6-201ENST00000366384 298 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
HERC6Q8IVU3 CCDC167-201ENST00000373408 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HERC6Q8IVU3 SPIN2B-203ENST00000374910 725 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HERC6Q8IVU3 TRBJ2-6-201ENST00000390418 53 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HERC6Q8IVU3 NDUFS7-203ENST00000414651 841 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HERC6Q8IVU3 AL354893.2-201ENST00000423075 529 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HERC6Q8IVU3 PSMD4P1-201ENST00000433951 1109 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
HERC6Q8IVU3 OR2R1P-201ENST00000441404 914 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
HERC6Q8IVU3 SHANK2-210ENST00000449116 939 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HERC6Q8IVU3 AC024293.1-201ENST00000467930 498 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
HERC6Q8IVU3 LINC02062-201ENST00000513175 478 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HERC6Q8IVU3 RTN4RL2-203ENST00000533205 637 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HERC6Q8IVU3 ANO1-AS2-202ENST00000533327 498 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HERC6Q8IVU3 AC069185.1-202ENST00000533405 471 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HERC6Q8IVU3 AC003686.1-201ENST00000550956 1034 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
HERC6Q8IVU3 AC012645.2-201ENST00000566190 553 ntTSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HERC6Q8IVU3 AC242426.4-201ENST00000606856 573 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HERC6Q8IVU3 AC006158.1-201ENST00000610661 249 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
HERC6Q8IVU3 TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 181 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
HERC6Q8IVU3 PAK4-208ENST00000599386 5735 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HERC6Q8IVU3 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HERC6Q8IVU3 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HERC6Q8IVU3 THUMPD3-AS1-212ENST00000520447 1809 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HERC6Q8IVU3 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
HERC6Q8IVU3 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HERC6Q8IVU3 COL11A2-201ENST00000341947 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HERC6Q8IVU3 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HERC6Q8IVU3 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HERC6Q8IVU3 NOX5-209ENST00000530406 2289 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HERC6Q8IVU3 MPP6-201ENST00000222644 8452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HERC6Q8IVU3 MSTO1-202ENST00000368341 2245 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HERC6Q8IVU3 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HERC6Q8IVU3 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HERC6Q8IVU3 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HERC6Q8IVU3 JKAMP-207ENST00000554271 2137 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HERC6Q8IVU3 TM9SF1-202ENST00000396854 2055 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HERC6Q8IVU3 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HERC6Q8IVU3 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HERC6Q8IVU3 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HERC6Q8IVU3 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HERC6Q8IVU3 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.1 ms