Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVM0

CCDC50, Coiled-coil domain-containing protein 50, humanhuman

Predictions only

Length 306 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC50Q8IVM0 ADAMTS13-202ENST00000356589 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC50Q8IVM0 TBC1D17-201ENST00000221543 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC50Q8IVM0 TBC1D17-209ENST00000622860 2370 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC50Q8IVM0 NEAT1-201ENST00000499732 1811 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC50Q8IVM0 SPATS2-203ENST00000547865 1810 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC50Q8IVM0 RNF157-AS1-204ENST00000590137 1812 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC50Q8IVM0 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC50Q8IVM0 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC50Q8IVM0 C2orf15-202ENST00000409684 1058 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC50Q8IVM0 EIF3FP3-201ENST00000434851 1086 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC50Q8IVM0 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC50Q8IVM0 MYCLP2-201ENST00000449268 967 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC50Q8IVM0 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC50Q8IVM0 AC025442.1-201ENST00000521596 481 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC50Q8IVM0 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC50Q8IVM0 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC50Q8IVM0 CYB5D1-202ENST00000570446 570 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC50Q8IVM0 AC008805.2-201ENST00000590069 435 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC50Q8IVM0 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC50Q8IVM0 DKKL1-202ENST00000594268 524 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC50Q8IVM0 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC50Q8IVM0 AC008894.2-201ENST00000597983 2987 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC50Q8IVM0 METTL26-214ENST00000614890 801 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC50Q8IVM0 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC50Q8IVM0 TRMT11-201ENST00000334379 1565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC50Q8IVM0 CSTB-201ENST00000291568 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC50Q8IVM0 AC092535.1-201ENST00000417557 2165 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC50Q8IVM0 INO80-202ENST00000401393 5991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC50Q8IVM0 CAP2-209ENST00000616440 2776 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC50Q8IVM0 RGMA-202ENST00000425933 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC50Q8IVM0 CDC37-201ENST00000222005 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC50Q8IVM0 KIF1A-213ENST00000498729 9221 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC50Q8IVM0 SLC22A12-202ENST00000377567 2599 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC50Q8IVM0 GP6-201ENST00000310373 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC50Q8IVM0 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC50Q8IVM0 AL136172.1-201ENST00000598590 1394 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC50Q8IVM0 PHTF2-206ENST00000422959 3525 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC50Q8IVM0 MINDY1-207ENST00000622754 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC50Q8IVM0 RPS6KC1-208ENST00000614059 4188 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC50Q8IVM0 DNER-201ENST00000341772 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC50Q8IVM0 SAR1A-204ENST00000373241 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC50Q8IVM0 ARMC8-220ENST00000489213 1714 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC50Q8IVM0 FGD6-203ENST00000546711 4568 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC50Q8IVM0 WDR17-205ENST00000508596 4294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC50Q8IVM0 THY1-206ENST00000528522 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC50Q8IVM0 SLC35C2-201ENST00000243896 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC50Q8IVM0 TGIF2-201ENST00000373872 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC50Q8IVM0 AGER-206ENST00000375070 1463 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC50Q8IVM0 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC50Q8IVM0 COG5-202ENST00000347053 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC50Q8IVM0 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC50Q8IVM0 AC089987.1-201ENST00000551654 2209 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC50Q8IVM0 ZNF576-201ENST00000336564 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC50Q8IVM0 YIPF3-202ENST00000372422 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC50Q8IVM0 KRTAP10-7-201ENST00000609664 1578 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC50Q8IVM0 GLB1L2-205ENST00000535456 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC50Q8IVM0 LINC02346-201ENST00000383019 1967 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC50Q8IVM0 FXR1-214ENST00000480918 1996 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC50Q8IVM0 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC50Q8IVM0 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC50Q8IVM0 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC50Q8IVM0 AC007319.1-202ENST00000412276 829 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC50Q8IVM0 AL121601.1-201ENST00000426367 326 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC50Q8IVM0 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC50Q8IVM0 KRT18P25-201ENST00000508931 1278 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC50Q8IVM0 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC50Q8IVM0 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC50Q8IVM0 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC50Q8IVM0 AC011497.1-201ENST00000596781 561 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC50Q8IVM0 ARHGEF37-201ENST00000333677 4968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC50Q8IVM0 ADCY3-202ENST00000405392 4397 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC50Q8IVM0 GNB1L-201ENST00000329517 6706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC50Q8IVM0 ATP6V1C1-202ENST00000518738 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC50Q8IVM0 KCNJ11-204ENST00000528731 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC50Q8IVM0 NACC2-202ENST00000371753 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC50Q8IVM0 SCUBE2-201ENST00000309263 3727 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC50Q8IVM0 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC50Q8IVM0 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC50Q8IVM0 HES2-201ENST00000377834 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC50Q8IVM0 MCC-202ENST00000408903 3476 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC50Q8IVM0 USP4-203ENST00000415188 1454 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC50Q8IVM0 TMEM184B-202ENST00000361906 3611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CCDC50Q8IVM0 FKBP6-201ENST00000252037 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CCDC50Q8IVM0 FAM189A2-201ENST00000257515 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CCDC50Q8IVM0 FBN3-207ENST00000601739 9086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CCDC50Q8IVM0 ZBTB47-201ENST00000232974 3781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CCDC50Q8IVM0 RNF14-201ENST00000347642 4213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CCDC50Q8IVM0 WNT3A-201ENST00000284523 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CCDC50Q8IVM0 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CCDC50Q8IVM0 PAG1-201ENST00000220597 10744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CCDC50Q8IVM0 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CCDC50Q8IVM0 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC50Q8IVM0 RFTN1-203ENST00000432519 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC50Q8IVM0 RIMBP2-201ENST00000261655 6321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC50Q8IVM0 EDEM3-201ENST00000318130 6898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC50Q8IVM0 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC50Q8IVM0 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC50Q8IVM0 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC50Q8IVM0 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC50Q8IVM0 PLEKHA7-214ENST00000532079 565 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.5 ms