Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3S7

CACNA2D4, Voltage-dependent calcium channel subunit alpha-2/delta-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA2D4Q7Z3S7 AC011447.5-201ENST00000616168 564 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
CACNA2D4Q7Z3S7 AL603764.1-201ENST00000636452 321 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
CACNA2D4Q7Z3S7 PRELP-201ENST00000343110 5747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CACNA2D4Q7Z3S7 SEPT6-204ENST00000360156 2609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CACNA2D4Q7Z3S7 TEAD3-202ENST00000402886 2729 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CACNA2D4Q7Z3S7 CPSF1-212ENST00000616140 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CACNA2D4Q7Z3S7 NUP153-203ENST00000613258 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CACNA2D4Q7Z3S7 AIPL1-207ENST00000574506 2074 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CACNA2D4Q7Z3S7 SC5D-202ENST00000392789 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CACNA2D4Q7Z3S7 ARHGEF26-203ENST00000465817 2353 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CACNA2D4Q7Z3S7 GPN1-201ENST00000264718 2496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CACNA2D4Q7Z3S7 UVRAG-201ENST00000356136 4123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CACNA2D4Q7Z3S7 ZBTB1-201ENST00000358738 4119 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CACNA2D4Q7Z3S7 PDE4D-203ENST00000340635 8232 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CACNA2D4Q7Z3S7 AC010327.5-201ENST00000586923 3061 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
CACNA2D4Q7Z3S7 ITGB4-203ENST00000450894 5645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CACNA2D4Q7Z3S7 HACD3-202ENST00000442729 1332 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CACNA2D4Q7Z3S7 KDM6B-201ENST00000254846 6713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CACNA2D4Q7Z3S7 PAPPA-201ENST00000328252 10959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CACNA2D4Q7Z3S7 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CACNA2D4Q7Z3S7 NEU3-206ENST00000532963 1643 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CACNA2D4Q7Z3S7 ANK1-205ENST00000347528 8237 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CACNA2D4Q7Z3S7 SELPLG-201ENST00000228463 1704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CACNA2D4Q7Z3S7 DLEU2-201ENST00000235290 1739 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CACNA2D4Q7Z3S7 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CACNA2D4Q7Z3S7 SDCBP2-AS1-201ENST00000446423 1811 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CACNA2D4Q7Z3S7 LDHA-203ENST00000379412 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CACNA2D4Q7Z3S7 NUBPL-201ENST00000281081 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CACNA2D4Q7Z3S7 SGK2-201ENST00000341458 2498 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CACNA2D4Q7Z3S7 CSTB-201ENST00000291568 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CACNA2D4Q7Z3S7 STX1A-201ENST00000222812 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CACNA2D4Q7Z3S7 STX1A-204ENST00000395156 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CACNA2D4Q7Z3S7 THY1-206ENST00000528522 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CACNA2D4Q7Z3S7 PTPN23-201ENST00000265562 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CACNA2D4Q7Z3S7 ZNF395-201ENST00000344423 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CACNA2D4Q7Z3S7 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CACNA2D4Q7Z3S7 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CACNA2D4Q7Z3S7 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CACNA2D4Q7Z3S7 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CACNA2D4Q7Z3S7 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CACNA2D4Q7Z3S7 TPM1-207ENST00000403994 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CACNA2D4Q7Z3S7 ACTBP11-201ENST00000436287 1126 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
CACNA2D4Q7Z3S7 STARD4-205ENST00000505803 803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CACNA2D4Q7Z3S7 STARD4-207ENST00000509887 1186 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CACNA2D4Q7Z3S7 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CACNA2D4Q7Z3S7 ANAPC11-216ENST00000579133 563 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CACNA2D4Q7Z3S7 RN7SL219P-201ENST00000582872 296 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
CACNA2D4Q7Z3S7 ANKS3-227ENST00000592711 580 ntTSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CACNA2D4Q7Z3S7 BTNL10-201ENST00000595971 695 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
CACNA2D4Q7Z3S7 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CACNA2D4Q7Z3S7 NRXN1-222ENST00000625672 8113 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CACNA2D4Q7Z3S7 STRC-205ENST00000450892 5680 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CACNA2D4Q7Z3S7 ANKMY1-204ENST00000391987 3221 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CACNA2D4Q7Z3S7 TRIM46-202ENST00000368382 3127 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CACNA2D4Q7Z3S7 AC148477.2-201ENST00000537762 3039 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CACNA2D4Q7Z3S7 IKZF1-218ENST00000615491 5637 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CACNA2D4Q7Z3S7 POM121-201ENST00000358357 5320 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CACNA2D4Q7Z3S7 ACER2-201ENST00000340967 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CACNA2D4Q7Z3S7 SREBF1-205ENST00000395757 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CACNA2D4Q7Z3S7 STAG3L2-201ENST00000426587 2130 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CACNA2D4Q7Z3S7 GRIK5-201ENST00000262895 3493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CACNA2D4Q7Z3S7 BEND3P1-201ENST00000421591 1944 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
CACNA2D4Q7Z3S7 TFR2-201ENST00000223051 2888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CACNA2D4Q7Z3S7 KIF17-203ENST00000400463 3731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CACNA2D4Q7Z3S7 HSD17B6-201ENST00000322165 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CACNA2D4Q7Z3S7 AC112229.3-201ENST00000603767 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CACNA2D4Q7Z3S7 AC013271.1-201ENST00000640669 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CACNA2D4Q7Z3S7 ATE1-202ENST00000369040 4803 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CACNA2D4Q7Z3S7 CEP295NL-201ENST00000322630 2090 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CACNA2D4Q7Z3S7 C10orf71-201ENST00000374144 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CACNA2D4Q7Z3S7 DNAJC27-207ENST00000534855 4831 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CACNA2D4Q7Z3S7 YIPF3-202ENST00000372422 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CACNA2D4Q7Z3S7 ATP6V1C1-202ENST00000518738 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CACNA2D4Q7Z3S7 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CACNA2D4Q7Z3S7 CAMK2A-203ENST00000398376 1493 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CACNA2D4Q7Z3S7 PRPH-201ENST00000257860 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CACNA2D4Q7Z3S7 DRC3-203ENST00000399187 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CACNA2D4Q7Z3S7 TNK2-202ENST00000381916 4223 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CACNA2D4Q7Z3S7 LTB4R-203ENST00000396789 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CACNA2D4Q7Z3S7 AKR1A1-202ENST00000372070 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CACNA2D4Q7Z3S7 PRM2-201ENST00000241808 680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CACNA2D4Q7Z3S7 B9D1-201ENST00000261499 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CACNA2D4Q7Z3S7 PDE6D-201ENST00000287600 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CACNA2D4Q7Z3S7 NCR1-201ENST00000291890 1155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CACNA2D4Q7Z3S7 CSF2-201ENST00000296871 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CACNA2D4Q7Z3S7 NCR1-202ENST00000338835 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CACNA2D4Q7Z3S7 NCR1-203ENST00000350790 739 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CACNA2D4Q7Z3S7 UBE2T-201ENST00000367274 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CACNA2D4Q7Z3S7 PFDN6-202ENST00000374607 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CACNA2D4Q7Z3S7 PFDN6-203ENST00000374610 521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CACNA2D4Q7Z3S7 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CACNA2D4Q7Z3S7 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CACNA2D4Q7Z3S7 B9D1-203ENST00000395615 805 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CACNA2D4Q7Z3S7 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CACNA2D4Q7Z3S7 SGK2-207ENST00000426287 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CACNA2D4Q7Z3S7 PRM2-202ENST00000435245 723 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CACNA2D4Q7Z3S7 AC099754.1-201ENST00000435884 454 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CACNA2D4Q7Z3S7 LRRC74B-201ENST00000442047 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CACNA2D4Q7Z3S7 CR769775.1-201ENST00000443347 931 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CACNA2D4Q7Z3S7 LINC01939-201ENST00000445279 694 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.4 ms