Protein–RNA interactions for Protein: Q6IPU0

CENPP, Centromere protein P, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPPQ6IPU0 ZNF417-203ENST00000595559 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CENPPQ6IPU0 TRIM23-202ENST00000274327 1829 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CENPPQ6IPU0 DDX41-208ENST00000507955 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CENPPQ6IPU0 COL6A2-202ENST00000310645 3446 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CENPPQ6IPU0 OGFOD1-209ENST00000568397 1681 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
CENPPQ6IPU0 SNX14-203ENST00000369627 3111 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
CENPPQ6IPU0 ELN-203ENST00000320492 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CENPPQ6IPU0 AC010547.4-201ENST00000561754 1378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CENPPQ6IPU0 SYT13-201ENST00000020926 5144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CENPPQ6IPU0 KCNT1-207ENST00000487664 3845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CENPPQ6IPU0 FKBP5-203ENST00000539068 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CENPPQ6IPU0 DDR1-271ENST00000513240 2882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CENPPQ6IPU0 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CENPPQ6IPU0 GPD1L-201ENST00000282541 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CENPPQ6IPU0 STYXL1-201ENST00000248600 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CENPPQ6IPU0 TARSL2-201ENST00000335968 3610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CENPPQ6IPU0 FAM219A-209ENST00000445726 3644 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CENPPQ6IPU0 FBXL7-203ENST00000510662 1758 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CENPPQ6IPU0 CBY1-201ENST00000216029 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CENPPQ6IPU0 PRM2-201ENST00000241808 680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CENPPQ6IPU0 MUC1-202ENST00000338684 1107 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CENPPQ6IPU0 LAMA4-203ENST00000368638 1061 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CENPPQ6IPU0 CDKN1A-202ENST00000373711 793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CENPPQ6IPU0 NRSN2-201ENST00000382285 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CENPPQ6IPU0 MB-205ENST00000406324 582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CENPPQ6IPU0 AF274855.1-203ENST00000424126 800 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CENPPQ6IPU0 PTPA-215ENST00000432124 567 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CENPPQ6IPU0 PRM2-202ENST00000435245 723 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CENPPQ6IPU0 AL356489.1-201ENST00000449144 1144 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CENPPQ6IPU0 VGLL4-214ENST00000451674 938 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CENPPQ6IPU0 CICP12-201ENST00000455801 843 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CENPPQ6IPU0 SNHG12-210ENST00000483436 682 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CENPPQ6IPU0 AC108725.1-201ENST00000495472 409 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CENPPQ6IPU0 PFN2-215ENST00000497148 743 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CENPPQ6IPU0 LYRM9-204ENST00000503642 432 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CENPPQ6IPU0 AC104596.1-201ENST00000507826 579 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CENPPQ6IPU0 AC020659.2-202ENST00000512295 513 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CENPPQ6IPU0 RAB40B-202ENST00000538809 704 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CENPPQ6IPU0 CD63-208ENST00000549117 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CENPPQ6IPU0 AL583722.2-201ENST00000557223 663 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CENPPQ6IPU0 C19orf70-204ENST00000587950 655 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CENPPQ6IPU0 COPS9-205ENST00000607357 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CENPPQ6IPU0 CUX1-214ENST00000550008 4350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CENPPQ6IPU0 CBX6-201ENST00000216083 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CENPPQ6IPU0 TRAFD1-201ENST00000257604 3178 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CENPPQ6IPU0 PAPSS2-202ENST00000456849 3856 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CENPPQ6IPU0 ASPH-214ENST00000519234 2874 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CENPPQ6IPU0 LINC00882-204ENST00000484698 2718 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CENPPQ6IPU0 AC090643.2-201ENST00000623442 2029 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CENPPQ6IPU0 TTC6-206ENST00000553443 5833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CENPPQ6IPU0 MED20-201ENST00000265350 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CENPPQ6IPU0 ZNF800-201ENST00000265827 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CENPPQ6IPU0 WDR5-201ENST00000358625 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CENPPQ6IPU0 KLF4-201ENST00000374672 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CENPPQ6IPU0 AC004890.2-205ENST00000416232 2804 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CENPPQ6IPU0 TMEM237-202ENST00000409444 5592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CENPPQ6IPU0 CCT7-201ENST00000258091 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CENPPQ6IPU0 CCDC186-202ENST00000369286 1928 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CENPPQ6IPU0 TCL1A-203ENST00000554012 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CENPPQ6IPU0 NUMB-216ENST00000555394 3037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CENPPQ6IPU0 CSRP1-202ENST00000367306 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CENPPQ6IPU0 MARK2-206ENST00000425897 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CENPPQ6IPU0 SLC6A12-207ENST00000536824 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CENPPQ6IPU0 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CENPPQ6IPU0 ANKRD42-201ENST00000260047 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CENPPQ6IPU0 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CENPPQ6IPU0 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CENPPQ6IPU0 ECE1-201ENST00000264205 2381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CENPPQ6IPU0 LOXL3-202ENST00000393937 2398 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CENPPQ6IPU0 CLASRP-204ENST00000544944 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CENPPQ6IPU0 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CENPPQ6IPU0 ARHGEF1-201ENST00000337665 3171 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CENPPQ6IPU0 USP47-207ENST00000527733 4525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CENPPQ6IPU0 CHIT1-202ENST00000367229 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CENPPQ6IPU0 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CENPPQ6IPU0 CTHRC1-201ENST00000330295 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CENPPQ6IPU0 ATP6V1E1-202ENST00000399796 1208 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CENPPQ6IPU0 AC010141.1-201ENST00000411585 623 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CENPPQ6IPU0 CHMP1AP1-201ENST00000445563 662 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CENPPQ6IPU0 AL035414.1-201ENST00000451327 857 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CENPPQ6IPU0 TMEM198B-204ENST00000484016 896 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CENPPQ6IPU0 NR2C2AP-207ENST00000544883 899 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CENPPQ6IPU0 HNRNPA1P48-202ENST00000565308 961 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CENPPQ6IPU0 AC108134.4-201ENST00000570700 302 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CENPPQ6IPU0 AP002360.2-202ENST00000572035 738 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CENPPQ6IPU0 AC145343.1-201ENST00000579629 650 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CENPPQ6IPU0 AC025048.1-201ENST00000592317 542 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CENPPQ6IPU0 AC104506.1-201ENST00000609247 429 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CENPPQ6IPU0 AC027601.3-201ENST00000622907 509 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CENPPQ6IPU0 SEPT12-201ENST00000268231 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CENPPQ6IPU0 LEF1-216ENST00000510624 1472 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CENPPQ6IPU0 TPD52L2-206ENST00000358548 2275 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CENPPQ6IPU0 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CENPPQ6IPU0 SMTN-202ENST00000347557 3130 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CENPPQ6IPU0 FAM163A-201ENST00000341785 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CENPPQ6IPU0 PDPR-202ENST00000398122 2734 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CENPPQ6IPU0 LILRP2-201ENST00000413439 2127 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CENPPQ6IPU0 AL354989.2-201ENST00000435838 1540 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CENPPQ6IPU0 ZNF750-202ENST00000572562 1513 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CENPPQ6IPU0 AL109910.1-201ENST00000452071 1330 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.1 ms