Protein–RNA interactions for Protein: Q676U5

ATG16L1, Autophagy-related protein 16-1, humanhuman

Predictions only

Length 607 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG16L1Q676U5 GDPD2-204ENST00000536730 2171 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ATG16L1Q676U5 ANKMY1-208ENST00000405002 3304 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ATG16L1Q676U5 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ATG16L1Q676U5 ALCAM-201ENST00000306107 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ATG16L1Q676U5 DAZL-201ENST00000250863 3104 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ATG16L1Q676U5 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
ATG16L1Q676U5 C1orf43-205ENST00000368519 1163 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ATG16L1Q676U5 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ATG16L1Q676U5 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ATG16L1Q676U5 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ATG16L1Q676U5 SERF2-209ENST00000409646 559 ntTSL 4 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ATG16L1Q676U5 LSM5-207ENST00000410044 687 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ATG16L1Q676U5 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ATG16L1Q676U5 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ATG16L1Q676U5 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ATG16L1Q676U5 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ATG16L1Q676U5 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
ATG16L1Q676U5 AC026434.2-201ENST00000506094 1078 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
ATG16L1Q676U5 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ATG16L1Q676U5 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ATG16L1Q676U5 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ATG16L1Q676U5 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ATG16L1Q676U5 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ATG16L1Q676U5 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ATG16L1Q676U5 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ATG16L1Q676U5 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
ATG16L1Q676U5 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ATG16L1Q676U5 AC068760.1-201ENST00000493579 1953 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
ATG16L1Q676U5 SH3TC2-202ENST00000502274 2681 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ATG16L1Q676U5 DLL4-201ENST00000249749 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ATG16L1Q676U5 MIR9-3HG-201ENST00000536780 4778 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ATG16L1Q676U5 AC072061.1-201ENST00000569710 2234 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
ATG16L1Q676U5 PLEKHB2-205ENST00000409279 2488 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ATG16L1Q676U5 C19orf57-204ENST00000586783 2454 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ATG16L1Q676U5 NOP58-201ENST00000264279 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ATG16L1Q676U5 SDHAF2-201ENST00000301761 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ATG16L1Q676U5 CERS3-202ENST00000394113 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ATG16L1Q676U5 TUBB8P4-201ENST00000511806 1324 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
ATG16L1Q676U5 RTFDC1-203ENST00000395881 1572 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ATG16L1Q676U5 POU2F2-202ENST00000389341 6901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ATG16L1Q676U5 LAMB1-201ENST00000222399 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ATG16L1Q676U5 ERICH6-201ENST00000295910 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ATG16L1Q676U5 LINC01792-201ENST00000452787 2050 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ATG16L1Q676U5 CNTN2-201ENST00000331830 7999 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ATG16L1Q676U5 AC114271.1-201ENST00000612689 2813 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
ATG16L1Q676U5 FRMD4B-201ENST00000398540 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ATG16L1Q676U5 SCNN1A-201ENST00000228916 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ATG16L1Q676U5 B4GALT6-201ENST00000237019 2128 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ATG16L1Q676U5 SYCP2L-201ENST00000283141 3130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ATG16L1Q676U5 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ATG16L1Q676U5 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ATG16L1Q676U5 IL20RA-207ENST00000541547 3382 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ATG16L1Q676U5 FHOD3-206ENST00000590592 4869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ATG16L1Q676U5 ZIM2-AS1-201ENST00000595954 2129 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ATG16L1Q676U5 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ATG16L1Q676U5 HNRNPLL-209ENST00000449105 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ATG16L1Q676U5 USP17L2-201ENST00000333796 1910 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.07
ATG16L1Q676U5 RUBCNL-212ENST00000631139 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
ATG16L1Q676U5 CLCN7-201ENST00000262318 3717 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
ATG16L1Q676U5 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
ATG16L1Q676U5 LRP5L-202ENST00000402859 1661 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
ATG16L1Q676U5 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
ATG16L1Q676U5 FAM109A-201ENST00000361483 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.07
ATG16L1Q676U5 SF3A1-201ENST00000215793 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
ATG16L1Q676U5 SGSM1-206ENST00000610372 5991 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
ATG16L1Q676U5 MYADM-202ENST00000391768 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
ATG16L1Q676U5 AC138894.1-201ENST00000635887 2824 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
ATG16L1Q676U5 EPHX2-207ENST00000521400 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
ATG16L1Q676U5 NUP160-201ENST00000378460 5376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
ATG16L1Q676U5 OCRL-201ENST00000357121 5138 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
ATG16L1Q676U5 CYB561D2-202ENST00000418577 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
ATG16L1Q676U5 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
ATG16L1Q676U5 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC14.58□□□□□ -0.08
ATG16L1Q676U5 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
ATG16L1Q676U5 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
ATG16L1Q676U5 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
ATG16L1Q676U5 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
ATG16L1Q676U5 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
ATG16L1Q676U5 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
ATG16L1Q676U5 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
ATG16L1Q676U5 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
ATG16L1Q676U5 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
ATG16L1Q676U5 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
ATG16L1Q676U5 ACSM2A-202ENST00000396104 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
ATG16L1Q676U5 HEPACAM-201ENST00000298251 3602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
ATG16L1Q676U5 GAP43-202ENST00000393780 1901 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
ATG16L1Q676U5 TCN2-202ENST00000405742 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
ATG16L1Q676U5 AL356258.1-201ENST00000605929 2246 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
ATG16L1Q676U5 TMCC2-201ENST00000329800 2818 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
ATG16L1Q676U5 ZDHHC8-203ENST00000405930 3112 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
ATG16L1Q676U5 SCAMP5-202ENST00000425597 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
ATG16L1Q676U5 ANGPTL2-202ENST00000373425 3707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
ATG16L1Q676U5 MFSD2B-201ENST00000338315 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
ATG16L1Q676U5 TRDMT1-203ENST00000377799 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
ATG16L1Q676U5 PTPRS-204ENST00000587303 6353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
ATG16L1Q676U5 LMNA-213ENST00000473598 2015 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
ATG16L1Q676U5 MAGEA2-203ENST00000611557 2024 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
ATG16L1Q676U5 DMTN-214ENST00000519907 2658 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
ATG16L1Q676U5 SUOX-208ENST00000548274 2352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
ATG16L1Q676U5 TBC1D3-201ENST00000620215 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.6 ms