Protein–RNA interactions for Protein: Q502W7

CCDC38, Coiled-coil domain-containing protein 38, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC38Q502W7 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC38Q502W7 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC38Q502W7 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC38Q502W7 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC38Q502W7 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC38Q502W7 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC38Q502W7 AC004522.2-201ENST00000456499 680 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC38Q502W7 AC100818.1-201ENST00000524167 563 ntTSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC38Q502W7 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC38Q502W7 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC38Q502W7 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC38Q502W7 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC38Q502W7 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC38Q502W7 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC38Q502W7 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC38Q502W7 CCDC186-202ENST00000369286 1928 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC38Q502W7 ATL3-203ENST00000538786 1920 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC38Q502W7 SLC22A12-202ENST00000377567 2599 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC38Q502W7 SFSWAP-210ENST00000541286 3219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC38Q502W7 ZFP82-201ENST00000392161 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC38Q502W7 AL589740.1-203ENST00000433637 1984 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC38Q502W7 LGR5-201ENST00000266674 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC38Q502W7 PLAT-205ENST00000519510 2030 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC38Q502W7 SCAMP5-202ENST00000425597 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC38Q502W7 SSTR1-201ENST00000267377 4295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC38Q502W7 ECHDC1-220ENST00000528402 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC38Q502W7 AL139260.2-201ENST00000622355 2171 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC38Q502W7 COBL-205ENST00000441453 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC38Q502W7 AC025171.1-202ENST00000499871 2271 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC38Q502W7 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC38Q502W7 CHRDL1-205ENST00000482160 1537 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC38Q502W7 ASH2L-201ENST00000343823 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC38Q502W7 STAM2-201ENST00000263904 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC38Q502W7 CTCFL-205ENST00000423479 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC38Q502W7 ASB10-204ENST00000420175 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC38Q502W7 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC38Q502W7 DEK-202ENST00000397239 3427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCDC38Q502W7 RARG-202ENST00000394426 2640 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCDC38Q502W7 SAMD4B-201ENST00000314471 4519 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCDC38Q502W7 OPN5-202ENST00000371211 1801 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCDC38Q502W7 AL031595.1-201ENST00000623969 4709 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
CCDC38Q502W7 PEG13-201ENST00000631594 5667 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
CCDC38Q502W7 GTF2IRD1-205ENST00000476977 5868 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCDC38Q502W7 KIF22-208ENST00000569382 2020 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCDC38Q502W7 AGGF1P1-201ENST00000509500 2073 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
CCDC38Q502W7 GNAO1-202ENST00000262494 5767 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCDC38Q502W7 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCDC38Q502W7 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCDC38Q502W7 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCDC38Q502W7 MYCLP2-201ENST00000449268 967 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
CCDC38Q502W7 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCDC38Q502W7 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCDC38Q502W7 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCDC38Q502W7 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCDC38Q502W7 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCDC38Q502W7 AC092552.1-201ENST00000547243 906 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
CCDC38Q502W7 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCDC38Q502W7 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCDC38Q502W7 AC124283.3-201ENST00000570869 594 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
CCDC38Q502W7 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
CCDC38Q502W7 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCDC38Q502W7 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
CCDC38Q502W7 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCDC38Q502W7 ZCCHC7-209ENST00000534928 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCDC38Q502W7 SMARCA2-208ENST00000382194 5679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCDC38Q502W7 BRWD1-201ENST00000333229 10141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCDC38Q502W7 B3GNT4-202ENST00000535274 2938 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCDC38Q502W7 SMARCA2-204ENST00000357248 5855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCDC38Q502W7 SPPL2A-201ENST00000261854 7372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCDC38Q502W7 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCDC38Q502W7 RAB5B-202ENST00000448789 1530 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCDC38Q502W7 NUDT16-202ENST00000521288 6108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCDC38Q502W7 CARD10-203ENST00000406271 3127 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCDC38Q502W7 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCDC38Q502W7 RPARP-AS1-202ENST00000492465 1556 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCDC38Q502W7 PSMD13-215ENST00000621534 1572 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCDC38Q502W7 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCDC38Q502W7 PRSS16-203ENST00000421826 1949 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCDC38Q502W7 LINC00479-201ENST00000412102 2033 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCDC38Q502W7 EHD4-201ENST00000220325 6416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCDC38Q502W7 MEGF8-201ENST00000251268 9549 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCDC38Q502W7 USP44-203ENST00000537435 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCDC38Q502W7 RIC8B-202ENST00000392837 5135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCDC38Q502W7 RNASEH2C-201ENST00000308418 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCDC38Q502W7 TGFBRAP1-201ENST00000258449 2827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCDC38Q502W7 PML-203ENST00000354026 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCDC38Q502W7 CES3-201ENST00000303334 3834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCDC38Q502W7 CES3-202ENST00000394037 3817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCDC38Q502W7 AFAP1-204ENST00000420658 7768 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCDC38Q502W7 SSTR3-201ENST00000610913 4100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCDC38Q502W7 KLHL21-201ENST00000377658 4487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCDC38Q502W7 DNM1-212ENST00000627543 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCDC38Q502W7 FASN-206ENST00000634990 8407 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCDC38Q502W7 CCDC47-201ENST00000225726 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCDC38Q502W7 HARS2-201ENST00000230771 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCDC38Q502W7 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCDC38Q502W7 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCDC38Q502W7 CDK20-201ENST00000325303 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCDC38Q502W7 GOLGA8R-201ENST00000327271 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCDC38Q502W7 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms