Protein–RNA interactions for Protein: Q3LI61

KRTAP20-2, Keratin-associated protein 20-2, humanhuman

Predictions only

Length 65 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP20-2Q3LI61 RUFY1-204ENST00000437570 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.1□□□□□ -1.75
KRTAP20-2Q3LI61 ZNF570-202ENST00000586475 1985 ntTSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
KRTAP20-2Q3LI61 TUBA3GP-201ENST00000410028 1325 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
KRTAP20-2Q3LI61 AC124944.3-201ENST00000607976 1304 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
KRTAP20-2Q3LI61 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
KRTAP20-2Q3LI61 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
KRTAP20-2Q3LI61 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
KRTAP20-2Q3LI61 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
KRTAP20-2Q3LI61 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
KRTAP20-2Q3LI61 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.1□□□□□ -1.75
KRTAP20-2Q3LI61 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC4.1□□□□□ -1.75
KRTAP20-2Q3LI61 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
KRTAP20-2Q3LI61 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC4.1□□□□□ -1.75
KRTAP20-2Q3LI61 MPZL3-204ENST00000527472 1381 ntTSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
KRTAP20-2Q3LI61 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
KRTAP20-2Q3LI61 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
KRTAP20-2Q3LI61 CWC27-201ENST00000381070 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
KRTAP20-2Q3LI61 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.1□□□□□ -1.75
KRTAP20-2Q3LI61 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.1□□□□□ -1.75
KRTAP20-2Q3LI61 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
KRTAP20-2Q3LI61 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
KRTAP20-2Q3LI61 TMEM186-201ENST00000333050 1448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
KRTAP20-2Q3LI61 KRT8P38-201ENST00000441370 1430 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
KRTAP20-2Q3LI61 SERPINE3-203ENST00000521255 1439 ntTSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
KRTAP20-2Q3LI61 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.1□□□□□ -1.75
KRTAP20-2Q3LI61 CRACR2A-201ENST00000252322 2186 ntTSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
KRTAP20-2Q3LI61 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC4.1□□□□□ -1.75
KRTAP20-2Q3LI61 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.1□□□□□ -1.75
KRTAP20-2Q3LI61 CEBPZOS-203ENST00000397226 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.1□□□□□ -1.75
KRTAP20-2Q3LI61 NR1H3-203ENST00000405853 1480 ntTSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
KRTAP20-2Q3LI61 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
KRTAP20-2Q3LI61 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
KRTAP20-2Q3LI61 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
KRTAP20-2Q3LI61 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.1□□□□□ -1.75
KRTAP20-2Q3LI61 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC4.1□□□□□ -1.75
KRTAP20-2Q3LI61 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
KRTAP20-2Q3LI61 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
KRTAP20-2Q3LI61 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
KRTAP20-2Q3LI61 WDSUB1-201ENST00000358147 1535 ntTSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
KRTAP20-2Q3LI61 FAM96A-203ENST00000557835 1536 ntTSL 2 BASIC4.1□□□□□ -1.75
KRTAP20-2Q3LI61 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
KRTAP20-2Q3LI61 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
KRTAP20-2Q3LI61 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.1□□□□□ -1.75
KRTAP20-2Q3LI61 RPARP-AS1-202ENST00000492465 1556 ntTSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
KRTAP20-2Q3LI61 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC4.1□□□□□ -1.75
KRTAP20-2Q3LI61 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC4.1□□□□□ -1.75
KRTAP20-2Q3LI61 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
KRTAP20-2Q3LI61 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
KRTAP20-2Q3LI61 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
KRTAP20-2Q3LI61 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC4.1□□□□□ -1.75
KRTAP20-2Q3LI61 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
KRTAP20-2Q3LI61 ZC3H8-201ENST00000272570 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
KRTAP20-2Q3LI61 NME1-209ENST00000511355 1645 ntTSL 5 BASIC4.1□□□□□ -1.75
KRTAP20-2Q3LI61 AC015688.4-201ENST00000580780 1647 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
KRTAP20-2Q3LI61 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC4.1□□□□□ -1.75
KRTAP20-2Q3LI61 PDE8B-205ENST00000346042 3276 ntTSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
KRTAP20-2Q3LI61 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
KRTAP20-2Q3LI61 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
KRTAP20-2Q3LI61 DLX4-206ENST00000611342 1662 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
KRTAP20-2Q3LI61 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.09□□□□□ -1.75
KRTAP20-2Q3LI61 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.75
KRTAP20-2Q3LI61 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.75
KRTAP20-2Q3LI61 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC4.09□□□□□ -1.75
KRTAP20-2Q3LI61 OXA1L-202ENST00000358043 1750 ntTSL 2 BASIC4.09□□□□□ -1.75
KRTAP20-2Q3LI61 SFPQP1-201ENST00000446621 1786 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
KRTAP20-2Q3LI61 CLN8-204ENST00000519254 1769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.09□□□□□ -1.75
KRTAP20-2Q3LI61 TUBB8-206ENST00000568584 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.75
KRTAP20-2Q3LI61 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.75
KRTAP20-2Q3LI61 Z98885.3-201ENST00000624882 1757 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
KRTAP20-2Q3LI61 HPSE2-206ENST00000628193 1760 ntTSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.75
KRTAP20-2Q3LI61 AMT-256ENST00000638063 1783 ntTSL 5 BASIC4.09□□□□□ -1.75
KRTAP20-2Q3LI61 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC4.09□□□□□ -1.75
KRTAP20-2Q3LI61 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.75
KRTAP20-2Q3LI61 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.75
KRTAP20-2Q3LI61 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.75
KRTAP20-2Q3LI61 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC4.09□□□□□ -1.75
KRTAP20-2Q3LI61 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.75
KRTAP20-2Q3LI61 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.75
KRTAP20-2Q3LI61 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.75
KRTAP20-2Q3LI61 ABAT-203ENST00000425191 1923 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.09□□□□□ -1.75
KRTAP20-2Q3LI61 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.75
KRTAP20-2Q3LI61 RAB40A-201ENST00000304236 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.09□□□□□ -1.75
KRTAP20-2Q3LI61 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC4.09□□□□□ -1.75
KRTAP20-2Q3LI61 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.09□□□□□ -1.75
KRTAP20-2Q3LI61 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.75
KRTAP20-2Q3LI61 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.75
KRTAP20-2Q3LI61 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC4.09□□□□□ -1.75
KRTAP20-2Q3LI61 OR3A2-205ENST00000641164 2033 ntAPPRIS P1 BASIC4.09□□□□□ -1.75
KRTAP20-2Q3LI61 RRM1-214ENST00000534285 2075 ntTSL 5 BASIC4.09□□□□□ -1.75
KRTAP20-2Q3LI61 CBX3-201ENST00000337620 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.75
KRTAP20-2Q3LI61 PDP1-203ENST00000517764 2140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC4.09□□□□□ -1.75
KRTAP20-2Q3LI61 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.75
KRTAP20-2Q3LI61 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.09□□□□□ -1.75
KRTAP20-2Q3LI61 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.75
KRTAP20-2Q3LI61 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.75
KRTAP20-2Q3LI61 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC4.09□□□□□ -1.75
KRTAP20-2Q3LI61 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.75
KRTAP20-2Q3LI61 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC4.09□□□□□ -1.75
KRTAP20-2Q3LI61 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.75
KRTAP20-2Q3LI61 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.9 ms