Protein–RNA interactions for Protein: Q3B7T1

EDRF1, Erythroid differentiation-related factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,238 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDRF1Q3B7T1 UHMK1-202ENST00000489294 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
EDRF1Q3B7T1 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
EDRF1Q3B7T1 RANBP1-208ENST00000430524 1389 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
EDRF1Q3B7T1 LATS2-201ENST00000382592 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
EDRF1Q3B7T1 KCNT1-207ENST00000487664 3845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
EDRF1Q3B7T1 ECE1-201ENST00000264205 2381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
EDRF1Q3B7T1 SCML4-201ENST00000369020 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
EDRF1Q3B7T1 PDE9A-208ENST00000398225 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
EDRF1Q3B7T1 SGK2-204ENST00000373100 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
EDRF1Q3B7T1 UROD-201ENST00000246337 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
EDRF1Q3B7T1 KATNA1-201ENST00000335643 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
EDRF1Q3B7T1 AC005523.2-201ENST00000601192 3568 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
EDRF1Q3B7T1 PPM1F-203ENST00000407142 5587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
EDRF1Q3B7T1 MFAP4-202ENST00000395592 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
EDRF1Q3B7T1 KCNJ2-202ENST00000535240 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
EDRF1Q3B7T1 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
EDRF1Q3B7T1 BIN3-205ENST00000519513 1431 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
EDRF1Q3B7T1 NUMB-216ENST00000555394 3037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
EDRF1Q3B7T1 CSF1-201ENST00000329608 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
EDRF1Q3B7T1 PPT2-245ENST00000361568 1759 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
EDRF1Q3B7T1 REXO1L6P-201ENST00000603433 1515 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
EDRF1Q3B7T1 AC211486.1-201ENST00000275590 980 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
EDRF1Q3B7T1 CSRP1-202ENST00000367306 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
EDRF1Q3B7T1 TCEAL1-203ENST00000372626 721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
EDRF1Q3B7T1 SHBG-202ENST00000380450 1271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
EDRF1Q3B7T1 MIR1909-201ENST00000411312 80 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
EDRF1Q3B7T1 RPARP-AS1-201ENST00000473970 1297 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
EDRF1Q3B7T1 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
EDRF1Q3B7T1 ANAPC13-205ENST00000511751 896 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
EDRF1Q3B7T1 AC104989.1-201ENST00000519711 778 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
EDRF1Q3B7T1 SNX29P1-201ENST00000548357 1007 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
EDRF1Q3B7T1 IFI27L1-210ENST00000556381 804 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
EDRF1Q3B7T1 SLC38A7-207ENST00000564391 731 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
EDRF1Q3B7T1 CX3CL1-203ENST00000564948 563 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
EDRF1Q3B7T1 MIR4783-201ENST00000580343 82 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
EDRF1Q3B7T1 KLK3-207ENST00000595952 969 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
EDRF1Q3B7T1 AC234782.2-201ENST00000614615 1240 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
EDRF1Q3B7T1 AC092634.8-201ENST00000639687 773 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
EDRF1Q3B7T1 SLC35C1-201ENST00000314134 4171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
EDRF1Q3B7T1 PLEKHB2-206ENST00000409612 2210 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
EDRF1Q3B7T1 TAF12-201ENST00000263974 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
EDRF1Q3B7T1 OSCP1-204ENST00000433045 1381 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
EDRF1Q3B7T1 NKIRAS2-201ENST00000307641 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
EDRF1Q3B7T1 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
EDRF1Q3B7T1 SPO11-203ENST00000371263 1834 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
EDRF1Q3B7T1 ANKRD42-201ENST00000260047 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
EDRF1Q3B7T1 CCDC186-202ENST00000369286 1928 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
EDRF1Q3B7T1 NELFA-202ENST00000382882 3343 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
EDRF1Q3B7T1 RTFDC1-203ENST00000395881 1572 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
EDRF1Q3B7T1 CDK3-201ENST00000425876 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
EDRF1Q3B7T1 CDK3-202ENST00000448471 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
EDRF1Q3B7T1 PXDNL-201ENST00000356297 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
EDRF1Q3B7T1 AL022313.4-201ENST00000562756 2046 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
EDRF1Q3B7T1 FXYD3-202ENST00000346446 1320 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
EDRF1Q3B7T1 SLC6A12-207ENST00000536824 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
EDRF1Q3B7T1 ATP6V0A1-203ENST00000393829 3028 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
EDRF1Q3B7T1 JPH1-201ENST00000342232 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
EDRF1Q3B7T1 EPN2-210ENST00000571254 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
EDRF1Q3B7T1 TFR2-201ENST00000223051 2888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
EDRF1Q3B7T1 MYRF-203ENST00000389602 2052 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
EDRF1Q3B7T1 TBC1D3-201ENST00000620215 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
EDRF1Q3B7T1 TBC1D3C-201ENST00000622206 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
EDRF1Q3B7T1 NTM-205ENST00000425719 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
EDRF1Q3B7T1 CUEDC1-206ENST00000577830 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
EDRF1Q3B7T1 FLT3LG-201ENST00000204637 1046 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
EDRF1Q3B7T1 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
EDRF1Q3B7T1 AC103563.7-201ENST00000448734 478 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
EDRF1Q3B7T1 FAM167A-AS1-202ENST00000533578 1222 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
EDRF1Q3B7T1 TNNT1-212ENST00000588981 1163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
EDRF1Q3B7T1 AC244157.2-201ENST00000616239 1006 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
EDRF1Q3B7T1 HIST1H4A-201ENST00000617569 312 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
EDRF1Q3B7T1 CRCP-201ENST00000338592 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
EDRF1Q3B7T1 MAMLD1-203ENST00000370401 4854 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
EDRF1Q3B7T1 TAF4B-203ENST00000578121 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
EDRF1Q3B7T1 PTGFRN-201ENST00000393203 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
EDRF1Q3B7T1 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
EDRF1Q3B7T1 ZNF691-206ENST00000372508 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
EDRF1Q3B7T1 MARVELD2-203ENST00000436532 1563 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
EDRF1Q3B7T1 AC004706.4-201ENST00000634965 3537 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
EDRF1Q3B7T1 ZNF664-202ENST00000392404 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
EDRF1Q3B7T1 RBPJ-206ENST00000361572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
EDRF1Q3B7T1 AC244394.1-201ENST00000435000 1665 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
EDRF1Q3B7T1 RTEL1-201ENST00000318100 4676 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
EDRF1Q3B7T1 IRF2BP2-201ENST00000366609 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
EDRF1Q3B7T1 CLEC16A-202ENST00000409552 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
EDRF1Q3B7T1 FBRS-201ENST00000287468 2811 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
EDRF1Q3B7T1 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
EDRF1Q3B7T1 AL008718.2-201ENST00000609206 1313 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
EDRF1Q3B7T1 CHST5-201ENST00000336257 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
EDRF1Q3B7T1 SGK2-201ENST00000341458 2498 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
EDRF1Q3B7T1 KIAA0895L-202ENST00000561621 3500 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
EDRF1Q3B7T1 SPATS2L-209ENST00000409988 2698 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
EDRF1Q3B7T1 CNTNAP3-202ENST00000358144 4885 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
EDRF1Q3B7T1 TMCC2-202ENST00000330675 2780 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
EDRF1Q3B7T1 KDELR2-201ENST00000258739 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
EDRF1Q3B7T1 AC245123.1-202ENST00000612422 1719 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
EDRF1Q3B7T1 ELN-203ENST00000320492 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
EDRF1Q3B7T1 TRIT1-214ENST00000537440 2026 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
EDRF1Q3B7T1 CXorf36-201ENST00000377934 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
EDRF1Q3B7T1 ACSL3-202ENST00000392066 3147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.2 ms