Protein–RNA interactions for Protein: Q17R55

FAM187B, Protein FAM187B, humanhuman

Predictions only

Length 369 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM187BQ17R55 MFSD11-218ENST00000591864 446 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
FAM187BQ17R55 MBD3L2B-201ENST00000636986 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
FAM187BQ17R55 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
FAM187BQ17R55 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
FAM187BQ17R55 GMPR2-204ENST00000420554 1864 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
FAM187BQ17R55 GMPR2-223ENST00000559836 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
FAM187BQ17R55 LAP3-210ENST00000606142 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
FAM187BQ17R55 CEP295NL-205ENST00000619342 1866 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
FAM187BQ17R55 AGPAT1-205ENST00000395497 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
FAM187BQ17R55 PRKRIP1-201ENST00000397912 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
FAM187BQ17R55 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
FAM187BQ17R55 FAM149A-203ENST00000389354 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
FAM187BQ17R55 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
FAM187BQ17R55 AC015909.3-201ENST00000572855 1794 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
FAM187BQ17R55 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
FAM187BQ17R55 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
FAM187BQ17R55 LINC00665-206ENST00000590622 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
FAM187BQ17R55 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
FAM187BQ17R55 NOX5-209ENST00000530406 2289 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
FAM187BQ17R55 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
FAM187BQ17R55 CD1E-206ENST00000368161 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
FAM187BQ17R55 LINC00963-203ENST00000423918 1654 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
FAM187BQ17R55 SCFD2-201ENST00000388940 2221 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
FAM187BQ17R55 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
FAM187BQ17R55 CCDC51-202ENST00000412398 1385 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
FAM187BQ17R55 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
FAM187BQ17R55 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
FAM187BQ17R55 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
FAM187BQ17R55 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
FAM187BQ17R55 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
FAM187BQ17R55 PBX3-203ENST00000373487 2902 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
FAM187BQ17R55 UBXN11-207ENST00000374223 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
FAM187BQ17R55 COLCA2-202ENST00000526216 1332 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
FAM187BQ17R55 AC005264.1-201ENST00000587587 2319 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
FAM187BQ17R55 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
FAM187BQ17R55 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
FAM187BQ17R55 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
FAM187BQ17R55 PRIMA1-201ENST00000316227 1080 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
FAM187BQ17R55 DPCD-202ENST00000370151 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
FAM187BQ17R55 FOLR1-202ENST00000393676 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
FAM187BQ17R55 AL606491.1-201ENST00000412797 483 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
FAM187BQ17R55 LINC00313-205ENST00000427188 967 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
FAM187BQ17R55 PTPA-217ENST00000434095 870 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
FAM187BQ17R55 RAMP3-202ENST00000481345 559 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
FAM187BQ17R55 GUSBP1-202ENST00000508260 1012 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
FAM187BQ17R55 AC008443.1-201ENST00000511331 1000 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
FAM187BQ17R55 PAGE3-202ENST00000519203 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
FAM187BQ17R55 UBE3B-206ENST00000536398 1120 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
FAM187BQ17R55 AC005779.2-201ENST00000593083 550 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
FAM187BQ17R55 ADGRE3-204ENST00000595472 486 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
FAM187BQ17R55 NEAT1-203ENST00000601801 487 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
FAM187BQ17R55 LINC01783-202ENST00000614408 828 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
FAM187BQ17R55 BX284668.2-205ENST00000619677 828 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
FAM187BQ17R55 AP001043.1-205ENST00000623098 1033 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
FAM187BQ17R55 AC015967.2-201ENST00000624092 234 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
FAM187BQ17R55 AC006435.4-201ENST00000625037 234 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
FAM187BQ17R55 CDK7-214ENST00000626796 358 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
FAM187BQ17R55 CDK7-215ENST00000629350 1149 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
FAM187BQ17R55 AL356737.1-201ENST00000634391 234 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
FAM187BQ17R55 LACTB2-201ENST00000276590 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
FAM187BQ17R55 TNFAIP8L3-201ENST00000327536 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
FAM187BQ17R55 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
FAM187BQ17R55 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
FAM187BQ17R55 HPD-204ENST00000543163 1709 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
FAM187BQ17R55 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
FAM187BQ17R55 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
FAM187BQ17R55 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
FAM187BQ17R55 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
FAM187BQ17R55 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
FAM187BQ17R55 ABAT-203ENST00000425191 1923 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
FAM187BQ17R55 MRGPRX4-201ENST00000314254 1444 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
FAM187BQ17R55 FETUB-207ENST00000450521 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
FAM187BQ17R55 LETMD1-201ENST00000262055 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
FAM187BQ17R55 LETMD1-203ENST00000418425 2123 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
FAM187BQ17R55 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
FAM187BQ17R55 BPI-201ENST00000262865 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
FAM187BQ17R55 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
FAM187BQ17R55 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
FAM187BQ17R55 PHTF1-202ENST00000369598 3000 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
FAM187BQ17R55 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
FAM187BQ17R55 SLC7A4-202ENST00000403586 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
FAM187BQ17R55 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
FAM187BQ17R55 AC232323.1-201ENST00000540724 2099 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
FAM187BQ17R55 BRMS1-202ENST00000425825 1363 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
FAM187BQ17R55 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
FAM187BQ17R55 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
FAM187BQ17R55 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
FAM187BQ17R55 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
FAM187BQ17R55 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
FAM187BQ17R55 OARD1-203ENST00000463088 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
FAM187BQ17R55 ZSCAN5A-206ENST00000587492 1542 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
FAM187BQ17R55 FURIN-207ENST00000618099 4345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
FAM187BQ17R55 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
FAM187BQ17R55 RPS16-202ENST00000339471 643 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
FAM187BQ17R55 ADARB2-AS1-201ENST00000381301 625 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
FAM187BQ17R55 RAB1A-201ENST00000398529 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
FAM187BQ17R55 GSTP1-201ENST00000398603 700 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
FAM187BQ17R55 HSPB7-203ENST00000406363 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
FAM187BQ17R55 HLA-DQB2-229ENST00000411527 1059 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
FAM187BQ17R55 BANF1P3-201ENST00000412556 261 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 92.8 ms