Protein–RNA interactions for Protein: Q16849

PTPRN, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase-like N, humanhuman

Predictions only

Length 979 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRNQ16849 RGS10-202ENST00000369103 804 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
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PTPRNQ16849 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
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PTPRNQ16849 AIFM1-209ENST00000535724 2468 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PTPRNQ16849 AC015656.1-201ENST00000624209 3578 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
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