Protein–RNA interactions for Protein: Q16836

HADH, Hydroxyacyl-coenzyme A dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 314 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HADHQ16836 MEOX2-201ENST00000262041 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HADHQ16836 AC007388.1-204ENST00000449569 2517 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HADHQ16836 NAXD-201ENST00000309957 2659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HADHQ16836 PNPLA3-201ENST00000216180 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HADHQ16836 BOLL-203ENST00000392296 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HADHQ16836 ATP2B3-201ENST00000263519 6420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HADHQ16836 RP1L1-202ENST00000382483 7973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HADHQ16836 TMCC3-201ENST00000261226 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HADHQ16836 TBC1D2-203ENST00000375064 3174 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HADHQ16836 EXOC7-213ENST00000467929 2260 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HADHQ16836 RAPGEF3-205ENST00000449771 6061 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HADHQ16836 AC016397.2-201ENST00000624848 1985 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
HADHQ16836 POLL-204ENST00000370168 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HADHQ16836 TCAM1P-207ENST00000485295 1537 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
HADHQ16836 CREB3L3-204ENST00000602147 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HADHQ16836 ADAMTS7P1-201ENST00000613213 4793 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
HADHQ16836 AL359881.3-201ENST00000602640 1721 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
HADHQ16836 SLC26A8-201ENST00000355574 3463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HADHQ16836 GRIN2C-201ENST00000293190 4261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HADHQ16836 AGAP9-201ENST00000452145 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HADHQ16836 RABL6-211ENST00000629216 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HADHQ16836 LINC02551-202ENST00000533812 2203 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HADHQ16836 SPIDR-201ENST00000297423 3988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HADHQ16836 AL445430.1-201ENST00000419796 699 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HADHQ16836 AL583835.2-202ENST00000421363 1104 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HADHQ16836 AC018467.1-201ENST00000421581 717 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HADHQ16836 KRT43P-201ENST00000434019 910 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
HADHQ16836 RAB34-210ENST00000436730 863 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HADHQ16836 TMEM14B-210ENST00000473276 730 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HADHQ16836 TMEM14B-212ENST00000475942 992 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HADHQ16836 AC078785.1-201ENST00000496389 734 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HADHQ16836 AC095060.1-201ENST00000502455 549 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HADHQ16836 KCNK16-205ENST00000507712 889 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HADHQ16836 TROAP-207ENST00000548311 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HADHQ16836 TMEM170A-203ENST00000566980 547 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HADHQ16836 AC093525.1-201ENST00000569317 596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HADHQ16836 SLC35G4-201ENST00000588001 1017 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HADHQ16836 TMEM14B-220ENST00000612333 888 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HADHQ16836 MLLT10-216ENST00000621220 381 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HADHQ16836 AC138951.2-201ENST00000623455 1161 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
HADHQ16836 AC006453.4-201ENST00000636949 1252 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
HADHQ16836 KIRREL1-204ENST00000368173 7519 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HADHQ16836 NFYC-215ENST00000456393 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HADHQ16836 WASHC2C-201ENST00000336378 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HADHQ16836 CHST5-201ENST00000336257 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HADHQ16836 RGS6-217ENST00000555571 1764 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HADHQ16836 BRAT1-201ENST00000340611 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HADHQ16836 LRIG3-201ENST00000320743 4070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HADHQ16836 WNT7B-201ENST00000339464 3919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HADHQ16836 CD27-201ENST00000266557 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HADHQ16836 UBXN11-204ENST00000374217 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HADHQ16836 MUTYH-234ENST00000528013 1662 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HADHQ16836 GALNT4-201ENST00000529983 5399 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HADHQ16836 TTC7A-203ENST00000409245 3033 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HADHQ16836 MYLK-208ENST00000475616 5745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HADHQ16836 LMNA-213ENST00000473598 2015 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HADHQ16836 GAS2L1-209ENST00000618518 3382 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HADHQ16836 AC011498.7-201ENST00000624986 2027 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
HADHQ16836 CSF1-201ENST00000329608 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HADHQ16836 AC008125.1-201ENST00000548488 1538 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HADHQ16836 CASC2-202ENST00000426021 3232 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HADHQ16836 PRKY-203ENST00000528056 7218 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HADHQ16836 F2RL1-201ENST00000296677 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HADHQ16836 LHX6-207ENST00000541397 2942 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HADHQ16836 CDH1-213ENST00000612417 2068 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HADHQ16836 TPO-201ENST00000329066 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HADHQ16836 DMTN-203ENST00000381470 2601 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HADHQ16836 MBP-204ENST00000382582 2281 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HADHQ16836 CYP1A1-203ENST00000395049 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HADHQ16836 HYOU1-218ENST00000614668 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HADHQ16836 AKAP12-204ENST00000402676 8432 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HADHQ16836 CTNS-202ENST00000381870 2470 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HADHQ16836 CFLAR-206ENST00000395148 4415 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HADHQ16836 TMEM47-201ENST00000275954 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HADHQ16836 MEF2C-AS1-210ENST00000514011 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HADHQ16836 OGFOD3-201ENST00000313056 4287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HADHQ16836 BCS1L-205ENST00000412366 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HADHQ16836 PNMA3-202ENST00000593810 1432 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HADHQ16836 LINC01667-202ENST00000623919 1422 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HADHQ16836 RFTN1-203ENST00000432519 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HADHQ16836 AC005523.2-201ENST00000601192 3568 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HADHQ16836 SLC4A7-210ENST00000440156 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HADHQ16836 PXDN-201ENST00000252804 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HADHQ16836 ILDR1-205ENST00000462014 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HADHQ16836 HHEX-202ENST00000472590 1605 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HADHQ16836 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HADHQ16836 NRSN2-201ENST00000382285 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HADHQ16836 AL121983.1-201ENST00000424181 335 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HADHQ16836 AL157832.1-201ENST00000428273 495 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HADHQ16836 SNHG14-209ENST00000456576 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HADHQ16836 AC007551.1-201ENST00000457394 519 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
HADHQ16836 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HADHQ16836 PRPS2-205ENST00000489404 763 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HADHQ16836 BRF2-202ENST00000520601 1192 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HADHQ16836 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
HADHQ16836 AC116456.1-201ENST00000526646 815 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HADHQ16836 RPL8-205ENST00000527914 551 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HADHQ16836 SPATA8-AS1-201ENST00000558722 465 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HADHQ16836 AC009133.1-202ENST00000563806 494 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HADHQ16836 AC025048.1-201ENST00000592317 542 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.7 ms