Protein–RNA interactions for Protein: Q16656

NRF1, Nuclear respiratory factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRF1Q16656 AGAP5-201ENST00000374094 2394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
NRF1Q16656 PRDM10-204ENST00000423662 5998 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
NRF1Q16656 ALDH8A1-204ENST00000367847 1587 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
NRF1Q16656 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
NRF1Q16656 RPARP-AS1-202ENST00000492465 1556 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
NRF1Q16656 RHOH-224ENST00000622175 2254 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.13□□□□□ -0.15
NRF1Q16656 PLXNB2-207ENST00000449103 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
NRF1Q16656 GRIK4-208ENST00000638419 3593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
NRF1Q16656 PGBD2-202ENST00000355360 2879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
NRF1Q16656 AC098936.1-201ENST00000442318 2885 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
NRF1Q16656 ZDHHC6-202ENST00000369405 2170 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
NRF1Q16656 TET2-207ENST00000513237 10166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
NRF1Q16656 TET2-209ENST00000540549 10166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
NRF1Q16656 PSMC1-201ENST00000261303 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
NRF1Q16656 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
NRF1Q16656 SERTAD2-201ENST00000313349 5549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
NRF1Q16656 MAGEA4-201ENST00000276344 1724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
NRF1Q16656 DOK1-202ENST00000340004 1722 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
NRF1Q16656 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
NRF1Q16656 SYDE1-201ENST00000342784 3264 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
NRF1Q16656 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
NRF1Q16656 SATB2-211ENST00000614512 4972 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
NRF1Q16656 KDR-201ENST00000263923 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
NRF1Q16656 AC239799.1-201ENST00000612520 3411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
NRF1Q16656 FBXL12-201ENST00000247977 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
NRF1Q16656 RFESD-201ENST00000311364 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
NRF1Q16656 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
NRF1Q16656 CROT-203ENST00000419147 2959 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
NRF1Q16656 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
NRF1Q16656 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC14.13□□□□□ -0.15
NRF1Q16656 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
NRF1Q16656 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
NRF1Q16656 BCAR3-210ENST00000539242 2114 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
NRF1Q16656 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
NRF1Q16656 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
NRF1Q16656 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC14.13□□□□□ -0.15
NRF1Q16656 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC14.13□□□□□ -0.15
NRF1Q16656 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
NRF1Q16656 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
NRF1Q16656 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
NRF1Q16656 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC14.13□□□□□ -0.15
NRF1Q16656 DHTKD1-201ENST00000263035 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
NRF1Q16656 FKBP6-201ENST00000252037 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
NRF1Q16656 TMEM130-203ENST00000416379 2881 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
NRF1Q16656 AC023632.2-201ENST00000523011 1789 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
NRF1Q16656 TCHH-202ENST00000614923 6995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
NRF1Q16656 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
NRF1Q16656 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC14.13□□□□□ -0.15
NRF1Q16656 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
NRF1Q16656 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
NRF1Q16656 TAGLN-207ENST00000532870 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
NRF1Q16656 DCHS1-201ENST00000299441 10765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
NRF1Q16656 ADAMTS13-202ENST00000356589 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
NRF1Q16656 HPS1-215ENST00000613394 3714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
NRF1Q16656 MAN2C1-216ENST00000563622 2961 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
NRF1Q16656 TIPARP-201ENST00000295924 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
NRF1Q16656 SEC14L3-204ENST00000403066 2474 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
NRF1Q16656 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
NRF1Q16656 BORCS5-202ENST00000314565 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
NRF1Q16656 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
NRF1Q16656 MPP2-214ENST00000523501 2121 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
NRF1Q16656 ANKRD42-201ENST00000260047 2514 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
NRF1Q16656 TBC1D8-202ENST00000409318 3803 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
NRF1Q16656 GRIK4-202ENST00000438375 4214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
NRF1Q16656 ELOA2-202ENST00000620522 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
NRF1Q16656 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
NRF1Q16656 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
NRF1Q16656 DRD2-201ENST00000346454 2433 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
NRF1Q16656 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
NRF1Q16656 TGM6-202ENST00000381423 2158 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
NRF1Q16656 IFNA6-202ENST00000380210 1544 ntAPPRIS P1 BASIC14.12□□□□□ -0.15
NRF1Q16656 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
NRF1Q16656 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
NRF1Q16656 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
NRF1Q16656 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC14.12□□□□□ -0.15
NRF1Q16656 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC14.12□□□□□ -0.15
NRF1Q16656 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC14.12□□□□□ -0.15
NRF1Q16656 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
NRF1Q16656 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
NRF1Q16656 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
NRF1Q16656 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
NRF1Q16656 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC14.12□□□□□ -0.15
NRF1Q16656 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
NRF1Q16656 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC14.12□□□□□ -0.15
NRF1Q16656 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC14.12□□□□□ -0.15
NRF1Q16656 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
NRF1Q16656 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC14.12□□□□□ -0.15
NRF1Q16656 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.12□□□□□ -0.15
NRF1Q16656 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
NRF1Q16656 SGMS1-202ENST00000361781 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
NRF1Q16656 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
NRF1Q16656 DENND1B-211ENST00000620048 8378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
NRF1Q16656 CPNE5-202ENST00000393189 2542 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
NRF1Q16656 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC14.12□□□□□ -0.15
NRF1Q16656 AC099548.2-204ENST00000481651 2106 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
NRF1Q16656 HIPK1-205ENST00000369558 8157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
NRF1Q16656 MKL1-201ENST00000355630 4496 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
NRF1Q16656 HLA-DPA1-242ENST00000419277 1704 ntAPPRIS P2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
NRF1Q16656 C11orf21-201ENST00000381153 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
NRF1Q16656 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.8 ms