Protein–RNA interactions for Protein: Q16204

CCDC6, Coiled-coil domain-containing protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 474 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC6Q16204 AL451050.2-201ENST00000606967 682 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC6Q16204 AC145423.3-201ENST00000615987 467 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC6Q16204 AC128714.1-201ENST00000637035 887 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC6Q16204 CNOT10-201ENST00000328834 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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CCDC6Q16204 TMEM132C-201ENST00000435159 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC6Q16204 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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CCDC6Q16204 HIPK3-202ENST00000379016 7345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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CCDC6Q16204 POLG-201ENST00000268124 4500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC6Q16204 DYNLRB2-201ENST00000305904 497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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CCDC6Q16204 VSIG2-201ENST00000326621 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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CCDC6Q16204 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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CCDC6Q16204 FGD2-201ENST00000274963 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC6Q16204 ANKRD11-201ENST00000301030 9301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
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CCDC6Q16204 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC6Q16204 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC6Q16204 PMPCB-201ENST00000249269 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC6Q16204 CRACR2A-201ENST00000252322 2186 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC6Q16204 MARS-201ENST00000262027 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC6Q16204 PPP2R5E-201ENST00000337537 6659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC6Q16204 TSHR-202ENST00000342443 1281 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC6Q16204 UBXN11-206ENST00000374222 2043 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC6Q16204 P2RY4-201ENST00000374519 1595 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC6Q16204 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC6Q16204 IFITM5-201ENST00000382614 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC6Q16204 TMEM107-203ENST00000431792 455 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC6Q16204 DGCR5-204ENST00000440005 1299 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC6Q16204 PGAP2-214ENST00000465307 1100 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC6Q16204 TSACC-208ENST00000481479 741 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC6Q16204 CHMP4BP1-201ENST00000556017 588 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC6Q16204 AC012645.3-203ENST00000567153 520 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
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