Protein–RNA interactions for Protein: Q15477

SKIV2L, Helicase SKI2W, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,246 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKIV2LQ15477 ATP5S-203ENST00000358473 801 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SKIV2LQ15477 MAGOH-202ENST00000371470 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SKIV2LQ15477 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SKIV2LQ15477 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SKIV2LQ15477 PLAC9P1-201ENST00000397540 389 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SKIV2LQ15477 LIF-202ENST00000403987 592 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SKIV2LQ15477 SNHG14-206ENST00000450809 677 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SKIV2LQ15477 AC106047.1-202ENST00000467484 482 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SKIV2LQ15477 DMKN-256ENST00000492341 738 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SKIV2LQ15477 PRR7-AS1-204ENST00000514846 543 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SKIV2LQ15477 AC011773.1-201ENST00000520129 468 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SKIV2LQ15477 RTN4RL2-203ENST00000533205 637 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SKIV2LQ15477 AC008050.1-201ENST00000554926 632 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SKIV2LQ15477 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SKIV2LQ15477 SHBG-210ENST00000572262 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SKIV2LQ15477 SELENOS-201ENST00000398226 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SKIV2LQ15477 OSBP2-201ENST00000332585 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SKIV2LQ15477 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SKIV2LQ15477 LINC00513-201ENST00000447430 1616 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SKIV2LQ15477 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SKIV2LQ15477 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SKIV2LQ15477 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SKIV2LQ15477 GPRASP1-205ENST00000537097 5980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SKIV2LQ15477 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SKIV2LQ15477 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SKIV2LQ15477 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SKIV2LQ15477 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SKIV2LQ15477 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SKIV2LQ15477 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SKIV2LQ15477 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SKIV2LQ15477 SIX4-201ENST00000216513 6285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SKIV2LQ15477 ABCC10-201ENST00000244533 5088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SKIV2LQ15477 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SKIV2LQ15477 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SKIV2LQ15477 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SKIV2LQ15477 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SKIV2LQ15477 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SKIV2LQ15477 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SKIV2LQ15477 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SKIV2LQ15477 MARK2P16-201ENST00000605714 1723 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
SKIV2LQ15477 STX1B-201ENST00000215095 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SKIV2LQ15477 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SKIV2LQ15477 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SKIV2LQ15477 HLA-DQB1-202ENST00000399079 1501 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
SKIV2LQ15477 CHRNA1-203ENST00000409219 1466 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SKIV2LQ15477 TNNT3-201ENST00000278317 1210 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SKIV2LQ15477 FAM3B-201ENST00000357985 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SKIV2LQ15477 RNA5SP359-201ENST00000364838 113 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
SKIV2LQ15477 ZNRD1-203ENST00000376782 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SKIV2LQ15477 TNNT3-207ENST00000381589 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SKIV2LQ15477 AL035696.2-201ENST00000407941 709 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
SKIV2LQ15477 RN7SKP109-201ENST00000410592 316 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
SKIV2LQ15477 AL137058.1-201ENST00000418237 673 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SKIV2LQ15477 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SKIV2LQ15477 AC105254.1-201ENST00000507782 621 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SKIV2LQ15477 POLR2J3-217ENST00000513438 546 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SKIV2LQ15477 AC114947.1-202ENST00000514136 344 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
SKIV2LQ15477 AC109479.3-201ENST00000520163 360 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SKIV2LQ15477 AC100818.1-201ENST00000524167 563 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SKIV2LQ15477 PIGT-208ENST00000545755 1158 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SKIV2LQ15477 AC103808.3-201ENST00000579714 598 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SKIV2LQ15477 MIR3188-201ENST00000583494 85 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
SKIV2LQ15477 AC242426.4-201ENST00000606856 573 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SKIV2LQ15477 AL355338.1-201ENST00000612598 913 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SKIV2LQ15477 AC133540.1-201ENST00000620845 1019 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
SKIV2LQ15477 AC027601.3-201ENST00000622907 509 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
SKIV2LQ15477 TRIM67-202ENST00000444294 9320 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SKIV2LQ15477 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SKIV2LQ15477 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SKIV2LQ15477 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SKIV2LQ15477 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
SKIV2LQ15477 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SKIV2LQ15477 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SKIV2LQ15477 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SKIV2LQ15477 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SKIV2LQ15477 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SKIV2LQ15477 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SKIV2LQ15477 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SKIV2LQ15477 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SKIV2LQ15477 SLIT1-201ENST00000266058 7925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SKIV2LQ15477 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SKIV2LQ15477 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SKIV2LQ15477 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SKIV2LQ15477 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SKIV2LQ15477 FAM45BP-202ENST00000592932 1624 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SKIV2LQ15477 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SKIV2LQ15477 SERPINF1-201ENST00000254722 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SKIV2LQ15477 AC004554.1-201ENST00000422830 1468 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SKIV2LQ15477 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SKIV2LQ15477 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SKIV2LQ15477 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SKIV2LQ15477 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SKIV2LQ15477 PSTPIP1-207ENST00000559295 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SKIV2LQ15477 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SKIV2LQ15477 SPATA8-201ENST00000328504 1083 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SKIV2LQ15477 NACA-202ENST00000393891 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SKIV2LQ15477 CXCL12-205ENST00000395794 1052 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SKIV2LQ15477 PHACTR2-204ENST00000397980 745 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SKIV2LQ15477 AL117339.1-201ENST00000419779 428 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SKIV2LQ15477 AL391361.3-201ENST00000420601 379 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
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