Protein–RNA interactions for Protein: Q15437

SEC23B, Protein transport protein Sec23B, humanhuman

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Length 767 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC23BQ15437 SPG11-210ENST00000558319 6426 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
SEC23BQ15437 SRP54-202ENST00000546080 2187 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
SEC23BQ15437 AL157996.1-201ENST00000624684 2299 ntBASIC13.52□□□□□ -0.24
SEC23BQ15437 PPT1-213ENST00000641319 2388 ntBASIC13.52□□□□□ -0.24
SEC23BQ15437 AGAP10P-201ENST00000454844 2418 ntBASIC13.52□□□□□ -0.24
SEC23BQ15437 ACSL1-208ENST00000507295 2490 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
SEC23BQ15437 AATBC-201ENST00000400385 4598 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
SEC23BQ15437 PGLYRP2-201ENST00000292609 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
SEC23BQ15437 GJB4-201ENST00000339480 2840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
SEC23BQ15437 MYD88-201ENST00000396334 2850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
SEC23BQ15437 CD6-201ENST00000313421 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
SEC23BQ15437 FBXL16-201ENST00000324361 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SEC23BQ15437 MEX3B-201ENST00000329713 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SEC23BQ15437 SEMA4B-201ENST00000332496 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SEC23BQ15437 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SEC23BQ15437 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SEC23BQ15437 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SEC23BQ15437 NCR3-201ENST00000340027 1042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SEC23BQ15437 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
SEC23BQ15437 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SEC23BQ15437 ACTBP8-201ENST00000403258 1108 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
SEC23BQ15437 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
SEC23BQ15437 ADAMTSL1-210ENST00000431052 824 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
SEC23BQ15437 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
SEC23BQ15437 GALT-202ENST00000450095 1280 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
SEC23BQ15437 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SEC23BQ15437 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
SEC23BQ15437 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
SEC23BQ15437 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
SEC23BQ15437 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
SEC23BQ15437 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
SEC23BQ15437 AC103988.2-201ENST00000561804 725 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
SEC23BQ15437 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
SEC23BQ15437 AP005019.2-201ENST00000615104 511 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
SEC23BQ15437 AP001002.3-201ENST00000623482 206 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
SEC23BQ15437 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SEC23BQ15437 WNT7B-201ENST00000339464 3919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SEC23BQ15437 NMBR-201ENST00000258042 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SEC23BQ15437 PDZD7-206ENST00000619208 4135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
SEC23BQ15437 AC009690.1-201ENST00000379915 4374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
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SEC23BQ15437 GPBAR1-203ENST00000521462 1465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
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SEC23BQ15437 MROH2A-201ENST00000389758 5355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
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SEC23BQ15437 THUMPD3-AS1-202ENST00000468186 3253 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SEC23BQ15437 SHPK-201ENST00000225519 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SEC23BQ15437 PLD2-201ENST00000263088 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
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SEC23BQ15437 NFATC1-205ENST00000427363 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
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SEC23BQ15437 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
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SEC23BQ15437 PFDN6-203ENST00000374610 521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SEC23BQ15437 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SEC23BQ15437 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SEC23BQ15437 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SEC23BQ15437 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SEC23BQ15437 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SEC23BQ15437 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SEC23BQ15437 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SEC23BQ15437 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SEC23BQ15437 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
SEC23BQ15437 AC015819.2-201ENST00000618730 555 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SEC23BQ15437 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SEC23BQ15437 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SEC23BQ15437 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SEC23BQ15437 ITGB4-202ENST00000449880 5689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SEC23BQ15437 FAM13B-201ENST00000033079 5465 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SEC23BQ15437 TMPRSS6-203ENST00000406725 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SEC23BQ15437 KIFC3-202ENST00000421376 3128 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SEC23BQ15437 HELLS-202ENST00000348459 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
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