Protein–RNA interactions for Protein: Q15113

PCOLCE, Procollagen C-endopeptidase enhancer 1, humanhuman

Predictions only

Length 449 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCOLCEQ15113 DUX4L50-201ENST00000455245 715 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
PCOLCEQ15113 RN7SL277P-201ENST00000481521 288 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
PCOLCEQ15113 TSHR-205ENST00000554263 1184 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PCOLCEQ15113 TSHR-206ENST00000554435 1089 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PCOLCEQ15113 MIR3677-201ENST00000578964 60 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
PCOLCEQ15113 C19orf25-205ENST00000588427 853 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PCOLCEQ15113 PIN1-207ENST00000588695 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
PCOLCEQ15113 IMPA2-207ENST00000588927 787 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
PCOLCEQ15113 AC008763.1-201ENST00000601797 843 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
PCOLCEQ15113 Z84492.1-201ENST00000606589 408 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
PCOLCEQ15113 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PCOLCEQ15113 CD1E-206ENST00000368161 1689 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PCOLCEQ15113 LINC00963-203ENST00000423918 1654 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
PCOLCEQ15113 BRCC3-201ENST00000330045 2496 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PCOLCEQ15113 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PCOLCEQ15113 AC113367.3-201ENST00000508316 1912 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
PCOLCEQ15113 DIAPH2-202ENST00000355827 3782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
PCOLCEQ15113 LRRTM1-201ENST00000295057 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PCOLCEQ15113 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PCOLCEQ15113 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
PCOLCEQ15113 LRP10-203ENST00000546834 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
PCOLCEQ15113 MICB-201ENST00000252229 2446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PCOLCEQ15113 ERGIC3-203ENST00000357394 1357 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
PCOLCEQ15113 SHOX-202ENST00000381575 1351 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PCOLCEQ15113 CAP2P1-201ENST00000557743 1390 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
PCOLCEQ15113 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
PCOLCEQ15113 NOX5-209ENST00000530406 2289 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PCOLCEQ15113 INTS11-248ENST00000545578 2263 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
PCOLCEQ15113 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PCOLCEQ15113 RHPN1-201ENST00000289013 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PCOLCEQ15113 CCNL1-202ENST00000295926 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PCOLCEQ15113 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
PCOLCEQ15113 ZNF619-201ENST00000314686 2233 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
PCOLCEQ15113 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
PCOLCEQ15113 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PCOLCEQ15113 CICP24-201ENST00000605464 2705 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
PCOLCEQ15113 ITSN1-204ENST00000381285 6107 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
PCOLCEQ15113 HMBS-216ENST00000543090 1347 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
PCOLCEQ15113 AC064801.2-201ENST00000625052 1303 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
PCOLCEQ15113 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
PCOLCEQ15113 WDR25-204ENST00000554175 2055 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PCOLCEQ15113 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
PCOLCEQ15113 SLC52A3-205ENST00000632431 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PCOLCEQ15113 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PCOLCEQ15113 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PCOLCEQ15113 ABI2-215ENST00000430418 1676 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
PCOLCEQ15113 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PCOLCEQ15113 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
PCOLCEQ15113 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PCOLCEQ15113 PPP1R26-204ENST00000604351 4640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
PCOLCEQ15113 SLC41A1-201ENST00000367137 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PCOLCEQ15113 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PCOLCEQ15113 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PCOLCEQ15113 EPHX1-202ENST00000366837 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PCOLCEQ15113 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
PCOLCEQ15113 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PCOLCEQ15113 OR9I1-201ENST00000302610 945 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
PCOLCEQ15113 ZCCHC13-201ENST00000339534 842 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
PCOLCEQ15113 RPL3-202ENST00000401609 1289 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PCOLCEQ15113 CAMKMT-203ENST00000403853 1114 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PCOLCEQ15113 HINT2P1-201ENST00000419438 481 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
PCOLCEQ15113 RNF144A-AS1-203ENST00000426122 579 ntTSL 4 BASIC13.41□□□□□ -0.26
PCOLCEQ15113 LINC00441-201ENST00000433480 1143 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PCOLCEQ15113 AC009487.3-201ENST00000505579 560 ntTSL 4 BASIC13.41□□□□□ -0.26
PCOLCEQ15113 AC019193.1-201ENST00000506678 823 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
PCOLCEQ15113 PAGE3-202ENST00000519203 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PCOLCEQ15113 AC136601.1-201ENST00000521803 666 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
PCOLCEQ15113 AC124301.1-201ENST00000524885 602 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
PCOLCEQ15113 TMEM223-202ENST00000525631 736 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PCOLCEQ15113 LTBR-209ENST00000541102 1084 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
PCOLCEQ15113 AL049833.2-202ENST00000556773 626 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
PCOLCEQ15113 AC093752.3-201ENST00000567343 901 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
PCOLCEQ15113 AC129507.4-201ENST00000570501 411 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
PCOLCEQ15113 AC040162.4-201ENST00000574912 1185 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
PCOLCEQ15113 ZNF286A-219ENST00000585194 607 ntTSL 4 BASIC13.41□□□□□ -0.26
PCOLCEQ15113 AC104506.1-201ENST00000609247 429 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
PCOLCEQ15113 Metazoa_SRP.69-201ENST00000615730 281 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
PCOLCEQ15113 AL353726.2-201ENST00000623259 884 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
PCOLCEQ15113 AC128714.1-201ENST00000637035 887 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
PCOLCEQ15113 EIF4G1-216ENST00000427845 5038 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
PCOLCEQ15113 ERG-207ENST00000398919 1868 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PCOLCEQ15113 KIAA0513-207ENST00000567328 1873 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PCOLCEQ15113 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
PCOLCEQ15113 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PCOLCEQ15113 CNN1-201ENST00000252456 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PCOLCEQ15113 PPIL3-201ENST00000286175 1370 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PCOLCEQ15113 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
PCOLCEQ15113 SUOX-202ENST00000356124 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PCOLCEQ15113 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PCOLCEQ15113 LINC00926-201ENST00000501726 2530 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
PCOLCEQ15113 ZNF174-201ENST00000268655 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PCOLCEQ15113 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PCOLCEQ15113 ZNF77-201ENST00000314531 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PCOLCEQ15113 DTX3-202ENST00000548198 3199 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
PCOLCEQ15113 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PCOLCEQ15113 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
PCOLCEQ15113 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
PCOLCEQ15113 BARHL2-201ENST00000370445 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PCOLCEQ15113 CRYBG2-210ENST00000527815 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
PCOLCEQ15113 RGS9-202ENST00000443584 2078 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
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