Protein–RNA interactions for Protein: Q14722

KCNAB1, Voltage-gated potassium channel subunit beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 419 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNAB1Q14722 SIPA1-203ENST00000527525 3235 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
KCNAB1Q14722 CYB561-219ENST00000584031 3200 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
KCNAB1Q14722 BX005266.2-201ENST00000450704 1549 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
KCNAB1Q14722 SPERT-204ENST00000610924 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
KCNAB1Q14722 FLI1-207ENST00000534087 3859 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
KCNAB1Q14722 ATP2A3-204ENST00000397035 4182 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
KCNAB1Q14722 SAFB-205ENST00000588852 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
KCNAB1Q14722 SLC41A3-211ENST00000508835 1480 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
KCNAB1Q14722 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
KCNAB1Q14722 AFAP1-204ENST00000420658 7768 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
KCNAB1Q14722 DNAJA1-201ENST00000330899 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
KCNAB1Q14722 BIRC2-214ENST00000621637 3331 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
KCNAB1Q14722 CAMSAP3-202ENST00000446248 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
KCNAB1Q14722 PPP2R5C-204ENST00000422945 4481 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
KCNAB1Q14722 ID2-203ENST00000396290 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
KCNAB1Q14722 TNF-208ENST00000449264 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
KCNAB1Q14722 MLF1-217ENST00000619577 2290 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
KCNAB1Q14722 AC007686.3-201ENST00000619017 3487 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
KCNAB1Q14722 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
KCNAB1Q14722 TGOLN2-203ENST00000398263 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
KCNAB1Q14722 SELPLG-202ENST00000388962 1613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
KCNAB1Q14722 PDE3B-202ENST00000455098 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
KCNAB1Q14722 CDK5RAP3-201ENST00000338399 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
KCNAB1Q14722 TBC1D2-201ENST00000342112 3046 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
KCNAB1Q14722 CHPF2-204ENST00000495645 2709 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
KCNAB1Q14722 MAP2K3-201ENST00000316920 1246 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
KCNAB1Q14722 EDF1-202ENST00000371648 809 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
KCNAB1Q14722 PRTFDC1-202ENST00000376376 741 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
KCNAB1Q14722 UBE4B-203ENST00000377153 1273 ntTSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
KCNAB1Q14722 HLA-DQB2-229ENST00000411527 1059 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
KCNAB1Q14722 AL391119.1-201ENST00000416563 271 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
KCNAB1Q14722 AC079807.2-203ENST00000417692 656 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
KCNAB1Q14722 AC080129.2-201ENST00000418353 430 ntTSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
KCNAB1Q14722 BMS1P17-203ENST00000444357 552 ntTSL 4 BASIC13.98□□□□□ -0.17
KCNAB1Q14722 BX324167.1-201ENST00000451118 805 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
KCNAB1Q14722 AP002387.1-201ENST00000529369 680 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
KCNAB1Q14722 MFSD11-218ENST00000591864 446 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
KCNAB1Q14722 ZIM2-AS1-201ENST00000595954 2129 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
KCNAB1Q14722 AL133499.1-201ENST00000596207 608 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
KCNAB1Q14722 AC006064.4-201ENST00000602946 422 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
KCNAB1Q14722 BMS1P22-203ENST00000609679 552 ntTSL 4 BASIC13.98□□□□□ -0.17
KCNAB1Q14722 NDUFB5-216ENST00000611971 951 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
KCNAB1Q14722 AC133540.1-201ENST00000620845 1019 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
KCNAB1Q14722 AC092299.1-201ENST00000632679 757 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
KCNAB1Q14722 HM13-201ENST00000335574 1809 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
KCNAB1Q14722 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
KCNAB1Q14722 SCAP-206ENST00000428413 3749 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
KCNAB1Q14722 ALAS2-202ENST00000335854 1795 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
KCNAB1Q14722 CD68-202ENST00000380498 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
KCNAB1Q14722 TRAF6-201ENST00000348124 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
KCNAB1Q14722 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
KCNAB1Q14722 ANO10-213ENST00000451430 2019 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
KCNAB1Q14722 KRT8P21-201ENST00000430398 1491 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
KCNAB1Q14722 KRT8P19-201ENST00000551916 1455 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
KCNAB1Q14722 C18orf25-203ENST00000615052 5462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
KCNAB1Q14722 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
KCNAB1Q14722 CCT4-201ENST00000394440 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
KCNAB1Q14722 MLST8-201ENST00000301724 1735 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
KCNAB1Q14722 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
KCNAB1Q14722 MX1-218ENST00000619682 1980 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
KCNAB1Q14722 IRF8-201ENST00000268638 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
KCNAB1Q14722 STUM-202ENST00000366789 4093 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
KCNAB1Q14722 GPSM1-202ENST00000354753 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
KCNAB1Q14722 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
KCNAB1Q14722 CPEB2-205ENST00000442003 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
KCNAB1Q14722 UBE2D1-201ENST00000373910 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
KCNAB1Q14722 GLUL-202ENST00000331872 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
KCNAB1Q14722 BCAS4-201ENST00000358791 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
KCNAB1Q14722 KAT5-216ENST00000534650 1875 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
KCNAB1Q14722 MTHFR-210ENST00000641407 2387 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
KCNAB1Q14722 AK4-202ENST00000395334 6998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
KCNAB1Q14722 AC005264.1-201ENST00000587587 2319 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
KCNAB1Q14722 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
KCNAB1Q14722 OSTF1-201ENST00000346234 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
KCNAB1Q14722 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
KCNAB1Q14722 TEAD3-201ENST00000338863 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
KCNAB1Q14722 ASIC4-202ENST00000358078 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
KCNAB1Q14722 FGR-203ENST00000374005 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
KCNAB1Q14722 DCTN1-203ENST00000409240 4365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
KCNAB1Q14722 RAI14-202ENST00000428746 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
KCNAB1Q14722 ARNT2-204ENST00000527771 2458 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
KCNAB1Q14722 COCH-203ENST00000460581 2688 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
KCNAB1Q14722 OSBPL10-201ENST00000396556 6600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
KCNAB1Q14722 OR1J1-201ENST00000259357 969 ntAPPRIS P1 BASIC13.97□□□□□ -0.17
KCNAB1Q14722 BORCS5-201ENST00000298571 549 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
KCNAB1Q14722 TAF8-202ENST00000372978 794 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
KCNAB1Q14722 UQCRQ-203ENST00000378670 839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
KCNAB1Q14722 AC245369.1-201ENST00000390634 434 ntAPPRIS P1 BASIC13.97□□□□□ -0.17
KCNAB1Q14722 AMPD3-203ENST00000396554 3806 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
KCNAB1Q14722 TEX33-202ENST00000402860 986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
KCNAB1Q14722 Z82214.1-201ENST00000419643 988 ntTSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
KCNAB1Q14722 DGUOK-AS1-202ENST00000439192 563 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
KCNAB1Q14722 FKBP11-202ENST00000444214 630 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
KCNAB1Q14722 AC073150.1-201ENST00000450406 1084 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
KCNAB1Q14722 AC135178.1-201ENST00000458568 537 ntTSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
KCNAB1Q14722 SUPT4H1P2-201ENST00000501248 353 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
KCNAB1Q14722 C14orf132-202ENST00000553782 536 ntTSL 4 BASIC13.97□□□□□ -0.17
KCNAB1Q14722 FOS-206ENST00000555347 1280 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
KCNAB1Q14722 AC103988.2-201ENST00000561804 725 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
KCNAB1Q14722 GEMIN7-204ENST00000591747 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms