Protein–RNA interactions for Protein: Q14258

TRIM25, E3 ubiquitin/ISG15 ligase TRIM25, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 630 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM25Q14258 PTK7-203ENST00000345201 4071 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
TRIM25Q14258 SLC4A7-211ENST00000445684 4061 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
TRIM25Q14258 KHSRPP1-201ENST00000427983 1768 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
TRIM25Q14258 LDLRAD2-201ENST00000344642 4012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
TRIM25Q14258 BCKDHB-201ENST00000320393 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
TRIM25Q14258 ADCYAP1R1-201ENST00000304166 6487 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
TRIM25Q14258 CDH16-204ENST00000565796 2694 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
TRIM25Q14258 LINC00665-206ENST00000590622 1749 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
TRIM25Q14258 IL1RAPL2-202ENST00000372582 2985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
TRIM25Q14258 DDX31-202ENST00000372153 3285 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
TRIM25Q14258 KIF3A-201ENST00000378735 3266 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
TRIM25Q14258 AL359643.2-201ENST00000606227 3273 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
TRIM25Q14258 FAM224A-201ENST00000419557 2031 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
TRIM25Q14258 RPN2-202ENST00000373622 2348 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
TRIM25Q14258 PBRM1-204ENST00000394830 5071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
TRIM25Q14258 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
TRIM25Q14258 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
TRIM25Q14258 GAS6-AS1-201ENST00000458001 7169 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
TRIM25Q14258 PSMC1-201ENST00000261303 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
TRIM25Q14258 REM1-201ENST00000201979 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
TRIM25Q14258 LARP7-202ENST00000344442 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
TRIM25Q14258 FBLIM1-203ENST00000375771 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
TRIM25Q14258 SLC9B2-202ENST00000394785 3126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
TRIM25Q14258 WARS2-201ENST00000235521 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
TRIM25Q14258 RUBCNL-212ENST00000631139 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
TRIM25Q14258 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
TRIM25Q14258 RNF41-202ENST00000394013 2452 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
TRIM25Q14258 CPN1-201ENST00000370418 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
TRIM25Q14258 GRHL1-202ENST00000405379 1881 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
TRIM25Q14258 LINC02076-201ENST00000577684 1871 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
TRIM25Q14258 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC13.98□□□□□ -0.17
TRIM25Q14258 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
TRIM25Q14258 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
TRIM25Q14258 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
TRIM25Q14258 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
TRIM25Q14258 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
TRIM25Q14258 GUSBP11-206ENST00000455485 3816 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
TRIM25Q14258 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC13.98□□□□□ -0.17
TRIM25Q14258 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
TRIM25Q14258 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
TRIM25Q14258 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
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TRIM25Q14258 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
TRIM25Q14258 SMIM24-203ENST00000587847 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
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TRIM25Q14258 SEPT6-201ENST00000343984 2693 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
TRIM25Q14258 SUOX-204ENST00000394115 2394 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
TRIM25Q14258 HPCAL4-201ENST00000372844 4856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
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TRIM25Q14258 HAGLR-202ENST00000416928 4235 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
TRIM25Q14258 SLC22A2-202ENST00000366953 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
TRIM25Q14258 SLC16A1-201ENST00000369626 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
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TRIM25Q14258 ABI2-203ENST00000261018 6638 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
TRIM25Q14258 LMAN2L-202ENST00000377079 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
TRIM25Q14258 ENO2-205ENST00000535366 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
TRIM25Q14258 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
TRIM25Q14258 INTS11-248ENST00000545578 2263 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
TRIM25Q14258 RXRG-204ENST00000619224 2252 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
TRIM25Q14258 HIF3A-206ENST00000472815 1709 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
TRIM25Q14258 IGF2BP1-201ENST00000290341 8274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
TRIM25Q14258 AC011899.2-202ENST00000438047 4302 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
TRIM25Q14258 INTS5-201ENST00000330574 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
TRIM25Q14258 PPHLN1-206ENST00000395580 1693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
TRIM25Q14258 STAR-201ENST00000276449 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
TRIM25Q14258 LINC01285-204ENST00000634601 1947 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
TRIM25Q14258 PSIP1-204ENST00000380738 3364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
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TRIM25Q14258 AP002761.4-201ENST00000565433 3361 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
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TRIM25Q14258 KIAA1614-201ENST00000367587 3309 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
TRIM25Q14258 S100PBP-203ENST00000373476 3320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
TRIM25Q14258 CDC45-205ENST00000437685 2072 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
TRIM25Q14258 YIPF3-202ENST00000372422 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
TRIM25Q14258 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
TRIM25Q14258 RNF220-203ENST00000361799 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
TRIM25Q14258 RNF220-204ENST00000372247 3010 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
TRIM25Q14258 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
TRIM25Q14258 C16orf82-201ENST00000418886 2268 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
TRIM25Q14258 LIG1-203ENST00000536218 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
TRIM25Q14258 NCF2-201ENST00000367535 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
TRIM25Q14258 C2orf15-202ENST00000409684 1058 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
TRIM25Q14258 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
TRIM25Q14258 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
TRIM25Q14258 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
TRIM25Q14258 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
TRIM25Q14258 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
TRIM25Q14258 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
TRIM25Q14258 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
TRIM25Q14258 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
TRIM25Q14258 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC13.97□□□□□ -0.17
TRIM25Q14258 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
TRIM25Q14258 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
TRIM25Q14258 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
TRIM25Q14258 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
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