Protein–RNA interactions for Protein: Q13838

DDX39B, Spliceosome RNA helicase DDX39B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 428 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX39BQ13838 WASHC2A-209ENST00000611324 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
DDX39BQ13838 ATE1-202ENST00000369040 4803 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
DDX39BQ13838 ALDH7A1-201ENST00000409134 4964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
DDX39BQ13838 VTI1B-204ENST00000554659 5351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
DDX39BQ13838 ITGB4-203ENST00000450894 5645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
DDX39BQ13838 FKBP6-201ENST00000252037 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
DDX39BQ13838 RPUSD2-201ENST00000315616 2358 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
DDX39BQ13838 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
DDX39BQ13838 ELAC2-201ENST00000338034 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
DDX39BQ13838 IL9R-202ENST00000369423 2032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
DDX39BQ13838 NDUFB8-202ENST00000370320 684 ntTSL 3 BASIC14.28□□□□□ -0.12
DDX39BQ13838 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
DDX39BQ13838 AC005229.1-201ENST00000392885 409 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
DDX39BQ13838 SERF2-209ENST00000409646 559 ntTSL 4 BASIC14.28□□□□□ -0.12
DDX39BQ13838 LINC01759-201ENST00000412639 985 ntTSL 3 BASIC14.28□□□□□ -0.12
DDX39BQ13838 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
DDX39BQ13838 LIMS3-201ENST00000437679 1220 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
DDX39BQ13838 SIGLEC9-202ENST00000440804 1960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
DDX39BQ13838 AC007388.1-204ENST00000449569 2517 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
DDX39BQ13838 DERL3-208ENST00000476077 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
DDX39BQ13838 MESTP3-201ENST00000503460 968 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
DDX39BQ13838 AC131206.1-201ENST00000538078 1211 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
DDX39BQ13838 GPR132-203ENST00000539291 2779 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
DDX39BQ13838 SLC8B1-202ENST00000546737 1656 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
DDX39BQ13838 TROAP-207ENST00000548311 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
DDX39BQ13838 C12orf10-204ENST00000548632 988 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
DDX39BQ13838 COX14-203ENST00000550487 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
DDX39BQ13838 ALDOA-209ENST00000563060 1550 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
DDX39BQ13838 COQ7-209ENST00000569127 2575 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
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DDX39BQ13838 C17orf62-239ENST00000585080 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
DDX39BQ13838 EGLN2-209ENST00000594140 991 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
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DDX39BQ13838 AL022328.1-201ENST00000610050 478 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
DDX39BQ13838 MAGEA2-204ENST00000611674 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
DDX39BQ13838 AC244517.11-204ENST00000624424 760 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
DDX39BQ13838 LINC01759-203ENST00000635271 888 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
DDX39BQ13838 MTMR3-204ENST00000401950 6018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
DDX39BQ13838 IKZF1-218ENST00000615491 5637 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
DDX39BQ13838 SYT12-201ENST00000393946 4534 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
DDX39BQ13838 COL9A2-202ENST00000372748 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
DDX39BQ13838 GATB-201ENST00000263985 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
DDX39BQ13838 FBN3-205ENST00000600128 9362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
DDX39BQ13838 LINC02551-202ENST00000533812 2203 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
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DDX39BQ13838 LETMD1-203ENST00000418425 2123 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.12
DDX39BQ13838 SMPDL3A-201ENST00000368440 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
DDX39BQ13838 SGTB-201ENST00000381007 5469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
DDX39BQ13838 LRRC34-208ENST00000522830 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
DDX39BQ13838 GRIK5-201ENST00000262895 3493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
DDX39BQ13838 NFIX-208ENST00000587260 1537 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
DDX39BQ13838 AC148477.2-201ENST00000537762 3039 ntTSL 3 BASIC14.27□□□□□ -0.12
DDX39BQ13838 CAMK2A-203ENST00000398376 1493 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
DDX39BQ13838 GPBAR1-203ENST00000521462 1465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.12
DDX39BQ13838 BCS1L-205ENST00000412366 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
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DDX39BQ13838 CARMIL2-202ENST00000545661 4119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
DDX39BQ13838 CREB3L3-204ENST00000602147 1382 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
DDX39BQ13838 PTK7-203ENST00000345201 4071 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
DDX39BQ13838 MROH2A-201ENST00000389758 5355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
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DDX39BQ13838 SS18L1-202ENST00000370848 1238 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
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DDX39BQ13838 ANXA2R-202ENST00000616064 1265 ntAPPRIS P1 BASIC14.27□□□□□ -0.13
DDX39BQ13838 C9orf50-202ENST00000619117 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
DDX39BQ13838 AC044839.1-204ENST00000634777 1058 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
DDX39BQ13838 SYT5-201ENST00000354308 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
DDX39BQ13838 SLC44A2-201ENST00000335757 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
DDX39BQ13838 KIAA1257-204ENST00000511438 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
DDX39BQ13838 AC012617.1-204ENST00000586340 2305 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
DDX39BQ13838 AL031280.1-201ENST00000436991 2224 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
DDX39BQ13838 CCT3-201ENST00000295688 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
DDX39BQ13838 AC112229.3-201ENST00000603767 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
DDX39BQ13838 AC013271.1-201ENST00000640669 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
DDX39BQ13838 SMARCA4-204ENST00000444061 4938 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
DDX39BQ13838 ATP6AP2-213ENST00000636251 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
DDX39BQ13838 GLIS2-202ENST00000433375 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
DDX39BQ13838 ADAM11-201ENST00000200557 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
DDX39BQ13838 HIPK1-205ENST00000369558 8157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
DDX39BQ13838 MEF2C-AS1-210ENST00000514011 1754 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
DDX39BQ13838 ACAN-202ENST00000439576 8840 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
DDX39BQ13838 ZFP28-204ENST00000591844 3475 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
DDX39BQ13838 GRK6-211ENST00000528793 2571 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
DDX39BQ13838 SLC40A1-201ENST00000261024 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
DDX39BQ13838 EPHB3-201ENST00000330394 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
DDX39BQ13838 MUTYH-234ENST00000528013 1662 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
DDX39BQ13838 ARHGAP45-202ENST00000539243 4184 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
DDX39BQ13838 TIGD6-201ENST00000296736 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
DDX39BQ13838 LINC02273-201ENST00000499452 1592 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
DDX39BQ13838 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
DDX39BQ13838 SELENOS-201ENST00000398226 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
DDX39BQ13838 CHI3L2-212ENST00000524472 1435 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
DDX39BQ13838 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
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