Protein–RNA interactions for Protein: Q13748

TUBA3C, Tubulin alpha-3C/D chain, humanhuman

Predictions only

Length 450 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBA3CQ13748 AC125603.2-201ENST00000546835 876 ntTSL 3 BASIC14.14□□□□□ -0.15
TUBA3CQ13748 AC090502.1-201ENST00000549905 748 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
TUBA3CQ13748 AC090502.1-204ENST00000551210 469 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
TUBA3CQ13748 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
TUBA3CQ13748 ELOF1-208ENST00000591912 899 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
TUBA3CQ13748 EGLN2-209ENST00000594140 991 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
TUBA3CQ13748 AC145423.3-201ENST00000615987 467 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
TUBA3CQ13748 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
TUBA3CQ13748 AL391650.2-201ENST00000640097 941 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
TUBA3CQ13748 AC015909.5-201ENST00000624336 2266 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
TUBA3CQ13748 PCDHA9-202ENST00000532602 6293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
TUBA3CQ13748 C9orf152-201ENST00000400613 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
TUBA3CQ13748 PLTP-203ENST00000372431 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
TUBA3CQ13748 RGMA-204ENST00000543599 3174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
TUBA3CQ13748 ZBTB2-201ENST00000325144 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
TUBA3CQ13748 ADD3-202ENST00000356080 3081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
TUBA3CQ13748 BRWD1-201ENST00000333229 10141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
TUBA3CQ13748 PPP4R4-201ENST00000304338 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
TUBA3CQ13748 ZFP2-201ENST00000361362 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
TUBA3CQ13748 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
TUBA3CQ13748 KMT2E-201ENST00000257745 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
TUBA3CQ13748 PDE3B-202ENST00000455098 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
TUBA3CQ13748 MAGI2-218ENST00000630991 2349 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
TUBA3CQ13748 TMTC1-207ENST00000552618 3915 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
TUBA3CQ13748 ELP6-201ENST00000296149 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
TUBA3CQ13748 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
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TUBA3CQ13748 ZNF783-202ENST00000434415 4452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
TUBA3CQ13748 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
TUBA3CQ13748 PRKD2-202ENST00000433867 3321 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
TUBA3CQ13748 RWDD4-205ENST00000510968 1551 ntTSL 4 BASIC14.13□□□□□ -0.15
TUBA3CQ13748 AC008894.2-201ENST00000597983 2987 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
TUBA3CQ13748 SAMD4B-201ENST00000314471 4519 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
TUBA3CQ13748 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
TUBA3CQ13748 CDHR5-203ENST00000397542 3489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
TUBA3CQ13748 ADAMTS7P1-201ENST00000613213 4793 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
TUBA3CQ13748 CCDC43-203ENST00000588210 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
TUBA3CQ13748 ITPK1-207ENST00000555495 3035 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
TUBA3CQ13748 MRVI1-204ENST00000527509 2686 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
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TUBA3CQ13748 TRMO-203ENST00000375119 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
TUBA3CQ13748 VGLL3-202ENST00000398399 10400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
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TUBA3CQ13748 YBX1P6-201ENST00000442962 1002 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
TUBA3CQ13748 TMEM225B-203ENST00000453227 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
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TUBA3CQ13748 ZNF747-202ENST00000395094 3504 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
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TUBA3CQ13748 BAK1-202ENST00000374467 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
TUBA3CQ13748 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
TUBA3CQ13748 AP3M2-201ENST00000174653 3661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
TUBA3CQ13748 WNT3A-201ENST00000284523 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
TUBA3CQ13748 DNMT3B-204ENST00000353855 4237 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
TUBA3CQ13748 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
TUBA3CQ13748 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
TUBA3CQ13748 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
TUBA3CQ13748 SMYD5-202ENST00000389501 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
TUBA3CQ13748 AC104836.1-202ENST00000636805 6041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
TUBA3CQ13748 BCAR1-205ENST00000420641 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
TUBA3CQ13748 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
TUBA3CQ13748 AC018442.1-201ENST00000421439 2061 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
TUBA3CQ13748 TOM1L2-205ENST00000478943 2098 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
TUBA3CQ13748 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
TUBA3CQ13748 SPAG11B-203ENST00000359758 612 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
TUBA3CQ13748 GUK1-206ENST00000366723 845 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
TUBA3CQ13748 UBE2T-201ENST00000367274 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
TUBA3CQ13748 CYB5R3-203ENST00000402438 1050 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
TUBA3CQ13748 KLF2P2-201ENST00000416807 1039 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
TUBA3CQ13748 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
TUBA3CQ13748 AL355994.2-201ENST00000447882 704 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
TUBA3CQ13748 AC114812.1-204ENST00000449669 728 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
TUBA3CQ13748 KRBOX4-206ENST00000478600 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
TUBA3CQ13748 SEPT7P9-202ENST00000489259 743 ntTSL 3 BASIC14.12□□□□□ -0.15
TUBA3CQ13748 NME2-206ENST00000513177 692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
TUBA3CQ13748 NME2-207ENST00000514264 850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
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