Protein–RNA interactions for Protein: Q13547

HDAC1, Histone deacetylase 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 482 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC1Q13547 ARMCX3-203ENST00000471229 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HDAC1Q13547 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HDAC1Q13547 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HDAC1Q13547 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HDAC1Q13547 GPX3-201ENST00000388825 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HDAC1Q13547 NTM-205ENST00000425719 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HDAC1Q13547 GPR37-201ENST00000303921 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HDAC1Q13547 LETMD1-235ENST00000552739 1713 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HDAC1Q13547 PAX3-203ENST00000344493 3109 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HDAC1Q13547 RNF41-202ENST00000394013 2452 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HDAC1Q13547 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HDAC1Q13547 PLXNC1-202ENST00000545312 1813 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HDAC1Q13547 GTF3C2-214ENST00000622534 1858 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HDAC1Q13547 CASP8-202ENST00000264275 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HDAC1Q13547 OSBP2-201ENST00000332585 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HDAC1Q13547 C8orf49-201ENST00000525043 1968 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
HDAC1Q13547 ZFHX2-205ENST00000615307 1972 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HDAC1Q13547 HBP1-201ENST00000222574 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HDAC1Q13547 ANO10-202ENST00000350459 2039 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HDAC1Q13547 AC211486.1-201ENST00000275590 980 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HDAC1Q13547 MXI1-205ENST00000393134 889 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HDAC1Q13547 PEMT-203ENST00000395782 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HDAC1Q13547 AL157392.1-201ENST00000412388 373 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HDAC1Q13547 KIF9-205ENST00000432493 633 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HDAC1Q13547 SVIL-AS1-208ENST00000446807 1007 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HDAC1Q13547 GGTLC2-202ENST00000448514 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HDAC1Q13547 NDRG1-209ENST00000518176 888 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HDAC1Q13547 CEP57L1-208ENST00000519095 908 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HDAC1Q13547 MSRB3-206ENST00000535664 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HDAC1Q13547 MIR6720-201ENST00000611664 98 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
HDAC1Q13547 SPIN2A-203ENST00000614076 966 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HDAC1Q13547 RAB34-222ENST00000625712 994 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HDAC1Q13547 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HDAC1Q13547 SUOX-208ENST00000548274 2352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HDAC1Q13547 MYADM-202ENST00000391768 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HDAC1Q13547 WDR83-201ENST00000418543 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HDAC1Q13547 AC244394.1-201ENST00000435000 1665 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
HDAC1Q13547 AP1M2-201ENST00000250244 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HDAC1Q13547 BNIP3-201ENST00000368636 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HDAC1Q13547 SMTN-223ENST00000619644 3227 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
HDAC1Q13547 AC008429.1-202ENST00000518818 2067 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
HDAC1Q13547 PRKCSH-212ENST00000591462 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
HDAC1Q13547 GPD1L-201ENST00000282541 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HDAC1Q13547 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HDAC1Q13547 UBE2I-201ENST00000325437 2832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
HDAC1Q13547 NUTM2G-201ENST00000354649 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
HDAC1Q13547 MYD88-203ENST00000417037 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HDAC1Q13547 AL359075.1-201ENST00000476232 2921 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HDAC1Q13547 RMDN3-201ENST00000260385 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HDAC1Q13547 SGK3-208ENST00000521198 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HDAC1Q13547 BST2-201ENST00000252593 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HDAC1Q13547 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
HDAC1Q13547 LAMA4-203ENST00000368638 1061 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
HDAC1Q13547 HIST1H2BPS3-201ENST00000419683 341 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
HDAC1Q13547 AC092800.1-201ENST00000449492 579 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
HDAC1Q13547 HOMER2P2-201ENST00000451621 847 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
HDAC1Q13547 LAMA4-209ENST00000453937 645 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HDAC1Q13547 AP002992.1-201ENST00000527519 491 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
HDAC1Q13547 CD63-214ENST00000552692 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HDAC1Q13547 H2BFM-203ENST00000598335 465 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
HDAC1Q13547 IFNL3-202ENST00000613087 734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HDAC1Q13547 AC234782.2-201ENST00000614615 1240 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
HDAC1Q13547 RANBP1-208ENST00000430524 1389 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
HDAC1Q13547 TMEM87A-201ENST00000307216 1598 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HDAC1Q13547 MAGEA1-201ENST00000356661 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HDAC1Q13547 AP003555.1-202ENST00000511013 1755 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HDAC1Q13547 AC072061.1-201ENST00000569710 2234 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
HDAC1Q13547 TGOLN2-204ENST00000409015 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HDAC1Q13547 RPS6KA4-202ENST00000528057 3121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HDAC1Q13547 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
HDAC1Q13547 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
HDAC1Q13547 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HDAC1Q13547 PLEKHO2-201ENST00000323544 3720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HDAC1Q13547 VLDLR-202ENST00000382099 3240 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HDAC1Q13547 AC005899.8-201ENST00000625127 3153 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
HDAC1Q13547 AGFG1-204ENST00000409315 2912 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
HDAC1Q13547 ALDH3B1-201ENST00000342456 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HDAC1Q13547 ZMYND15-202ENST00000433935 2411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
HDAC1Q13547 FAM90A12P-201ENST00000519497 2375 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
HDAC1Q13547 FAM90A24P-201ENST00000520792 2369 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
HDAC1Q13547 TP73-205ENST00000378285 2117 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HDAC1Q13547 B4GALT3-201ENST00000319769 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HDAC1Q13547 DLK1-201ENST00000331224 1324 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HDAC1Q13547 AC099850.1-201ENST00000451775 1338 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
HDAC1Q13547 PSMD8-209ENST00000602911 1330 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HDAC1Q13547 DUSP23-202ENST00000368108 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HDAC1Q13547 THEMIS2-204ENST00000373927 1082 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HDAC1Q13547 CLCN6-207ENST00000376497 814 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
HDAC1Q13547 UCHL3-201ENST00000377595 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HDAC1Q13547 VCX3B-202ENST00000381032 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
HDAC1Q13547 DSCR3-202ENST00000398998 988 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
HDAC1Q13547 KCNQ1-AS1-201ENST00000440887 1084 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
HDAC1Q13547 AC097103.2-201ENST00000504670 602 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
HDAC1Q13547 UEVLD-212ENST00000541984 755 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
HDAC1Q13547 PAM16-211ENST00000575848 518 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
HDAC1Q13547 PAM16-214ENST00000576217 493 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
HDAC1Q13547 NAT9-212ENST00000581136 1011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
HDAC1Q13547 Z98259.2-201ENST00000641583 609 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
HDAC1Q13547 TRIM65-201ENST00000269383 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HDAC1Q13547 HOXC12-201ENST00000243103 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
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