Protein–RNA interactions for Protein: Q13461

FOXE3, Forkhead box protein E3, humanhuman

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Length 319 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXE3Q13461 OCEL1-201ENST00000215061 1133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
FOXE3Q13461 EMC4-201ENST00000249209 852 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
FOXE3Q13461 RPS3-201ENST00000278572 907 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
FOXE3Q13461 FAM86MP-201ENST00000340703 885 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
FOXE3Q13461 MIR326-201ENST00000362220 95 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
FOXE3Q13461 RN7SKP230-201ENST00000365642 335 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
FOXE3Q13461 HIST3H3-201ENST00000366696 481 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
FOXE3Q13461 LAMA4-203ENST00000368638 1061 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
FOXE3Q13461 PRKG1-AS1-201ENST00000420193 971 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
FOXE3Q13461 SAP30L-202ENST00000426761 777 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
FOXE3Q13461 AP000350.4-201ENST00000433835 788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
FOXE3Q13461 GOLGA2P4-201ENST00000441462 777 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
FOXE3Q13461 CCDC153-204ENST00000503566 1295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
FOXE3Q13461 ALG3P1-201ENST00000508806 1114 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
FOXE3Q13461 ABLIM2-213ENST00000514025 2974 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
FOXE3Q13461 AC139099.3-201ENST00000572850 472 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
FOXE3Q13461 AC110285.3-201ENST00000574472 665 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
FOXE3Q13461 AC008825.2-201ENST00000603374 718 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
FOXE3Q13461 AP000229.1-202ENST00000609365 559 ntTSL 4 BASIC11.64□□□□□ -0.55
FOXE3Q13461 MLLT10-216ENST00000621220 381 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
FOXE3Q13461 FP565260.5-201ENST00000623188 479 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
FOXE3Q13461 WASHC2A-202ENST00000314664 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
FOXE3Q13461 OSBPL7-211ENST00000613735 2836 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
FOXE3Q13461 PES1-201ENST00000335214 1988 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
FOXE3Q13461 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
FOXE3Q13461 PLA2G3-201ENST00000215885 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
FOXE3Q13461 HNRNPR-212ENST00000606561 1837 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
FOXE3Q13461 KIAA1468-202ENST00000398130 6178 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
FOXE3Q13461 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
FOXE3Q13461 GLIS2-201ENST00000262366 4469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
FOXE3Q13461 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
FOXE3Q13461 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
FOXE3Q13461 VWCE-202ENST00000335613 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
FOXE3Q13461 PELP1-212ENST00000574876 3465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
FOXE3Q13461 TMEM184C-204ENST00000508208 1528 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
FOXE3Q13461 FBXO41-201ENST00000295133 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
FOXE3Q13461 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
FOXE3Q13461 MINDY1-207ENST00000622754 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
FOXE3Q13461 COL9A1-204ENST00000370496 1372 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
FOXE3Q13461 POMT1-204ENST00000402686 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
FOXE3Q13461 LRIG3-201ENST00000320743 4070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
FOXE3Q13461 ANK1-201ENST00000265709 6379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
FOXE3Q13461 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
FOXE3Q13461 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
FOXE3Q13461 TMEM184B-202ENST00000361906 3611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
FOXE3Q13461 CCDC121-202ENST00000394775 1472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
FOXE3Q13461 CR383656.2-201ENST00000548656 2254 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
FOXE3Q13461 FLI1-205ENST00000527786 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
FOXE3Q13461 LBHD1-201ENST00000354588 1320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
FOXE3Q13461 TLL1-201ENST00000061240 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
FOXE3Q13461 FUK-201ENST00000288078 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
FOXE3Q13461 HAL-202ENST00000538703 2637 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
FOXE3Q13461 DSN1-203ENST00000373750 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
FOXE3Q13461 TNIP1-214ENST00000522226 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
FOXE3Q13461 CLIP2-203ENST00000395060 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
FOXE3Q13461 ZBTB7B-207ENST00000535420 3777 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
FOXE3Q13461 MYH6-202ENST00000405093 5941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
FOXE3Q13461 SEPT7-201ENST00000350320 4350 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
FOXE3Q13461 CORO7-222ENST00000574025 2826 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
FOXE3Q13461 TMEM51-204ENST00000428417 1942 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
FOXE3Q13461 C22orf34-204ENST00000414287 2197 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
FOXE3Q13461 CCDC88B-201ENST00000301897 870 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
FOXE3Q13461 MRPL23-204ENST00000397297 613 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
FOXE3Q13461 TISP43-201ENST00000409793 538 ntTSL 4 BASIC11.63□□□□□ -0.55
FOXE3Q13461 LINC01840-201ENST00000421870 571 ntTSL 4 BASIC11.63□□□□□ -0.55
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FOXE3Q13461 LINC01694-201ENST00000424569 821 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
FOXE3Q13461 AC010745.3-201ENST00000439745 415 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
FOXE3Q13461 RPL35A-205ENST00000448864 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
FOXE3Q13461 HIST2H2BB-201ENST00000449108 381 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
FOXE3Q13461 APOA2-204ENST00000464492 530 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
FOXE3Q13461 AL157935.2-201ENST00000476274 1071 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
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FOXE3Q13461 STMN4-207ENST00000523048 1224 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
FOXE3Q13461 FAM8A2P-201ENST00000528813 1142 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
FOXE3Q13461 USB1-203ENST00000539737 1212 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
FOXE3Q13461 ORAOV1-211ENST00000542341 775 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
FOXE3Q13461 CD63-208ENST00000549117 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
FOXE3Q13461 AL021546.1-201ENST00000551806 552 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
FOXE3Q13461 AC012568.1-201ENST00000558463 472 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
FOXE3Q13461 VPS18-202ENST00000558474 873 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
FOXE3Q13461 KLK3-211ENST00000597483 810 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
FOXE3Q13461 CR381653.1-201ENST00000622961 812 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
FOXE3Q13461 AC114737.3-201ENST00000636708 570 ntTSL 4 BASIC11.63□□□□□ -0.55
FOXE3Q13461 KRT17-201ENST00000311208 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
FOXE3Q13461 PDE3B-202ENST00000455098 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
FOXE3Q13461 PEX26-205ENST00000610387 3924 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
FOXE3Q13461 MED4-201ENST00000258648 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
FOXE3Q13461 PYROXD2-201ENST00000370575 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
FOXE3Q13461 AC104452.1-203ENST00000636166 2266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
FOXE3Q13461 NATD1-201ENST00000611551 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
FOXE3Q13461 MEGF11-204ENST00000422354 5914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
FOXE3Q13461 IL13RA1-202ENST00000371666 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
FOXE3Q13461 USP38-202ENST00000510377 4135 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
FOXE3Q13461 SNPH-203ENST00000614659 5354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
FOXE3Q13461 SPRY2-201ENST00000377102 2708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
FOXE3Q13461 TTC39A-208ENST00000413473 2718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
FOXE3Q13461 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
FOXE3Q13461 IARS2-201ENST00000366922 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
FOXE3Q13461 SLC35A1-202ENST00000369556 1720 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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