Protein–RNA interactions for Protein: Q09470

KCNA1, Potassium voltage-gated channel subfamily A member 1, humanhuman

Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNA1Q09470 AC007376.2-201ENST00000556271 540 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
KCNA1Q09470 C14orf132-204ENST00000556728 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
KCNA1Q09470 AC105020.3-201ENST00000566036 560 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
KCNA1Q09470 AC120498.3-201ENST00000568884 542 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
KCNA1Q09470 AC021594.1-201ENST00000587174 636 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
KCNA1Q09470 MIR6720-201ENST00000611664 98 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
KCNA1Q09470 AC234782.2-201ENST00000614615 1240 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
KCNA1Q09470 LINC00623-205ENST00000621058 767 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KCNA1Q09470 SYNE2-228ENST00000639659 1290 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KCNA1Q09470 Z98259.2-201ENST00000641583 609 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
KCNA1Q09470 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KCNA1Q09470 PCDHA3-202ENST00000532566 4594 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
KCNA1Q09470 RSPRY1-202ENST00000537866 3586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
KCNA1Q09470 FAM219A-209ENST00000445726 3644 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
KCNA1Q09470 CTNND2-202ENST00000458100 1962 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
KCNA1Q09470 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KCNA1Q09470 TUSC3-201ENST00000382020 3683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KCNA1Q09470 CLASP2-203ENST00000359576 7141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
KCNA1Q09470 PYROXD2-201ENST00000370575 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KCNA1Q09470 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
KCNA1Q09470 EIF4G1-206ENST00000392537 5229 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
KCNA1Q09470 P4HA1-205ENST00000440381 2790 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
KCNA1Q09470 AGPAT1-205ENST00000395497 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
KCNA1Q09470 AL139260.2-201ENST00000622355 2171 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
KCNA1Q09470 LRRC41-201ENST00000343304 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
KCNA1Q09470 RAD51D-203ENST00000394589 2287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
KCNA1Q09470 XKR5-201ENST00000618742 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
KCNA1Q09470 TARSL2-201ENST00000335968 3610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
KCNA1Q09470 PCOLCE-201ENST00000223061 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
KCNA1Q09470 PAX7-202ENST00000400661 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
KCNA1Q09470 AL928921.2-201ENST00000641325 2442 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
KCNA1Q09470 ZBED1-202ENST00000381222 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
KCNA1Q09470 CEP170B-204ENST00000556508 6683 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
KCNA1Q09470 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
KCNA1Q09470 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
KCNA1Q09470 FBXL7-203ENST00000510662 1758 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
KCNA1Q09470 SDCBP2-AS1-201ENST00000446423 1811 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
KCNA1Q09470 ATG2A-201ENST00000377264 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
KCNA1Q09470 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
KCNA1Q09470 GAS2L1-209ENST00000618518 3382 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
KCNA1Q09470 ATE1-203ENST00000369043 4900 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KCNA1Q09470 DUS2-201ENST00000358896 1933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KCNA1Q09470 CATSPER4-202ENST00000456354 1912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KCNA1Q09470 AMT-239ENST00000636865 1914 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KCNA1Q09470 CLASRP-204ENST00000544944 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KCNA1Q09470 TMCO3-207ENST00000474393 2843 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KCNA1Q09470 SLC44A2-201ENST00000335757 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KCNA1Q09470 IGFBP5-201ENST00000233813 6215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KCNA1Q09470 HSPA8P5-201ENST00000456928 2069 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
KCNA1Q09470 CNTNAP2-225ENST00000639247 2064 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KCNA1Q09470 CAB39-201ENST00000258418 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KCNA1Q09470 KLK1-201ENST00000301420 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KCNA1Q09470 HIST1H1B-201ENST00000331442 681 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KCNA1Q09470 AL021707.3-201ENST00000418803 527 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KCNA1Q09470 AL451065.1-201ENST00000428958 238 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KCNA1Q09470 SHANK2-210ENST00000449116 939 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KCNA1Q09470 RASA3-IT1-201ENST00000454005 380 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KCNA1Q09470 LYRM9-204ENST00000503642 432 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KCNA1Q09470 AP003096.1-203ENST00000564469 563 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KCNA1Q09470 AC132872.1-201ENST00000566986 1195 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
KCNA1Q09470 TXNDC17-202ENST00000570330 459 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KCNA1Q09470 AC005695.3-201ENST00000614522 232 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
KCNA1Q09470 CR381653.1-201ENST00000622961 812 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KCNA1Q09470 TUBB1P2-201ENST00000422712 1306 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
KCNA1Q09470 TUBB1P1-201ENST00000503144 1300 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
KCNA1Q09470 CYP26A1-202ENST00000371531 2245 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KCNA1Q09470 BAX-201ENST00000293288 1358 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KCNA1Q09470 OSCP1-204ENST00000433045 1381 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KCNA1Q09470 TCL1A-203ENST00000554012 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KCNA1Q09470 SLC18A1-203ENST00000381608 1419 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KCNA1Q09470 KCNC3-202ENST00000474951 3347 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KCNA1Q09470 AC009093.10-201ENST00000641956 1442 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
KCNA1Q09470 RPL13-204ENST00000452368 1455 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KCNA1Q09470 COQ7-209ENST00000569127 2575 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KCNA1Q09470 AC093520.1-201ENST00000567545 1767 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KCNA1Q09470 SLC6A9-203ENST00000372306 1926 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KCNA1Q09470 MCRS1-211ENST00000550165 1936 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KCNA1Q09470 SIGLEC9-202ENST00000440804 1960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KCNA1Q09470 PPP1R26-204ENST00000604351 4640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KCNA1Q09470 MPP2-214ENST00000523501 2121 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KCNA1Q09470 MAX-219ENST00000618858 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KCNA1Q09470 RPS6KL1-201ENST00000354625 5195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KCNA1Q09470 PLEKHB2-206ENST00000409612 2210 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KCNA1Q09470 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KCNA1Q09470 CDH20-201ENST00000262717 3882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KCNA1Q09470 SLC35C2-201ENST00000243896 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KCNA1Q09470 PLPPR1-201ENST00000374874 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KCNA1Q09470 ZNF800-201ENST00000265827 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KCNA1Q09470 ZNF30-202ENST00000439785 2651 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KCNA1Q09470 RGPD6-202ENST00000330331 2848 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KCNA1Q09470 RGPD8-202ENST00000330575 2848 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KCNA1Q09470 LHX6-207ENST00000541397 2942 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KCNA1Q09470 GGA1-206ENST00000406772 3205 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KCNA1Q09470 EMC4-201ENST00000249209 852 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KCNA1Q09470 BEX5-201ENST00000333643 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KCNA1Q09470 MIR663B-201ENST00000408361 115 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
KCNA1Q09470 BTBD6P1-201ENST00000412176 1267 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
KCNA1Q09470 LINC01694-201ENST00000424569 821 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KCNA1Q09470 Z82198.1-201ENST00000447396 437 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KCNA1Q09470 AL591846.1-201ENST00000451736 433 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 112.4 ms