Protein–RNA interactions for Protein: Q08554

DSC1, Desmocollin-1, humanhuman

Predictions only

Length 894 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSC1Q08554 AC093627.2-201ENST00000497017 568 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
DSC1Q08554 IKBKB-212ENST00000519735 1166 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DSC1Q08554 TMCO5B-205ENST00000530020 894 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
DSC1Q08554 NME1-NME2-203ENST00000555572 1193 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
DSC1Q08554 AC005696.1-201ENST00000572876 443 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
DSC1Q08554 RPL19-207ENST00000582193 792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
DSC1Q08554 MIR4649-201ENST00000582839 64 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
DSC1Q08554 AC087392.5-201ENST00000612517 489 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
DSC1Q08554 HIST1H4I-201ENST00000615353 1294 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
DSC1Q08554 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
DSC1Q08554 ZSCAN5A-206ENST00000587492 1542 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
DSC1Q08554 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DSC1Q08554 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DSC1Q08554 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DSC1Q08554 ARMCX6-208ENST00000539247 1928 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
DSC1Q08554 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
DSC1Q08554 TM4SF19-203ENST00000446879 1582 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DSC1Q08554 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
DSC1Q08554 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
DSC1Q08554 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
DSC1Q08554 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
DSC1Q08554 METTL17-201ENST00000339374 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
DSC1Q08554 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
DSC1Q08554 ZNF587-203ENST00000423137 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
DSC1Q08554 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
DSC1Q08554 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
DSC1Q08554 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
DSC1Q08554 MRM2-201ENST00000242257 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
DSC1Q08554 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
DSC1Q08554 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
DSC1Q08554 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
DSC1Q08554 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
DSC1Q08554 GABRB2-205ENST00000517901 1779 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
DSC1Q08554 PGAP2-227ENST00000496834 1530 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
DSC1Q08554 AC138761.4-201ENST00000578881 1514 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
DSC1Q08554 TMEM208-201ENST00000304800 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
DSC1Q08554 COX14-201ENST00000317943 708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
DSC1Q08554 S100A2-203ENST00000368709 457 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
DSC1Q08554 SNRPC-202ENST00000374017 1054 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
DSC1Q08554 IGHV4-39-201ENST00000390619 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
DSC1Q08554 HLA-DMA-203ENST00000395305 777 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
DSC1Q08554 TMEM177-203ENST00000409951 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
DSC1Q08554 AC022447.6-201ENST00000515522 438 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
DSC1Q08554 ALG1L13P-202ENST00000519320 584 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
DSC1Q08554 ALG1L13P-204ENST00000523017 765 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
DSC1Q08554 WDYHV1-206ENST00000523356 869 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
DSC1Q08554 SDHAF2-206ENST00000542074 835 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
DSC1Q08554 FAM227B-210ENST00000560246 911 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
DSC1Q08554 SKA2-205ENST00000580541 689 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
DSC1Q08554 AC008736.2-201ENST00000587554 516 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
DSC1Q08554 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
DSC1Q08554 YIPF3-213ENST00000506469 1444 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
DSC1Q08554 LINC01815-202ENST00000641468 1409 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
DSC1Q08554 CCDC169-SOHLH2-201ENST00000511166 2051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
DSC1Q08554 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
DSC1Q08554 RARS2-201ENST00000369536 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
DSC1Q08554 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
DSC1Q08554 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
DSC1Q08554 WHRN-202ENST00000362057 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
DSC1Q08554 TMPRSS3-202ENST00000398397 1342 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
DSC1Q08554 GALNTL6-205ENST00000511251 2905 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
DSC1Q08554 MAPK7-203ENST00000395602 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
DSC1Q08554 SARS2-202ENST00000430193 1886 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
DSC1Q08554 CDK16-211ENST00000518022 2022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
DSC1Q08554 EIF4E2-201ENST00000258416 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
DSC1Q08554 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
DSC1Q08554 CYP4F11-202ENST00000326742 2877 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
DSC1Q08554 TIGD4-201ENST00000304337 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
DSC1Q08554 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
DSC1Q08554 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
DSC1Q08554 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
DSC1Q08554 CCT8L1P-201ENST00000465400 1674 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
DSC1Q08554 AGAP4-208ENST00000618171 2387 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
DSC1Q08554 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
DSC1Q08554 ACYP1-201ENST00000238618 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
DSC1Q08554 TCL1B-201ENST00000340722 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
DSC1Q08554 TMEM216-202ENST00000398979 908 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
DSC1Q08554 AL512306.1-201ENST00000432698 848 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
DSC1Q08554 RPL18AP8-201ENST00000486071 528 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
DSC1Q08554 C12orf10-207ENST00000549488 840 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
DSC1Q08554 MT3-203ENST00000565838 421 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
DSC1Q08554 AP000894.2-204ENST00000577358 473 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
DSC1Q08554 MIR4750-201ENST00000584564 56 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
DSC1Q08554 LGALS9C-215ENST00000584941 1104 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
DSC1Q08554 TMEM205-216ENST00000593256 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
DSC1Q08554 AC242426.4-201ENST00000606856 573 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
DSC1Q08554 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
DSC1Q08554 LINC01746-201ENST00000621390 449 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
DSC1Q08554 AC005618.3-201ENST00000624928 458 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
DSC1Q08554 LINC00969-294ENST00000627609 992 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
DSC1Q08554 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
DSC1Q08554 ALDOA-209ENST00000563060 1550 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
DSC1Q08554 CHPF2-204ENST00000495645 2709 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
DSC1Q08554 SLC26A11-202ENST00000411502 2872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
DSC1Q08554 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
DSC1Q08554 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
DSC1Q08554 APTX-211ENST00000463596 1345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
DSC1Q08554 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
DSC1Q08554 OPRM1-201ENST00000229768 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
DSC1Q08554 VAMP2-202ENST00000404970 1479 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.9 ms