Protein–RNA interactions for Protein: Q08397

LOXL1, Lysyl oxidase homolog 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 574 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LOXL1Q08397 FAS-202ENST00000352159 1722 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
LOXL1Q08397 ZNF385A-205ENST00000546970 2494 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
LOXL1Q08397 TAF4B-203ENST00000578121 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
LOXL1Q08397 C3orf33-205ENST00000534941 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
LOXL1Q08397 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
LOXL1Q08397 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
LOXL1Q08397 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
LOXL1Q08397 TARSL2-201ENST00000335968 3610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
LOXL1Q08397 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
LOXL1Q08397 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
LOXL1Q08397 PON3-201ENST00000265627 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
LOXL1Q08397 ATP5H-201ENST00000301587 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
LOXL1Q08397 CNR1-201ENST00000362094 1252 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
LOXL1Q08397 RNA5SP359-201ENST00000364838 113 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
LOXL1Q08397 SIAH2-AS1-201ENST00000461943 441 ntTSL 4 BASIC12.12□□□□□ -0.47
LOXL1Q08397 RN7SL81P-201ENST00000493781 261 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
LOXL1Q08397 RHEB-207ENST00000496004 744 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
LOXL1Q08397 AC097103.2-201ENST00000504670 602 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
LOXL1Q08397 ANXA5-210ENST00000515017 1190 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
LOXL1Q08397 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
LOXL1Q08397 AC007326.1-201ENST00000604539 458 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
LOXL1Q08397 AC009560.1-201ENST00000620208 434 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
LOXL1Q08397 AC009084.3-201ENST00000623356 437 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
LOXL1Q08397 SLC12A5-216ENST00000626701 617 ntTSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
LOXL1Q08397 FAM214B-202ENST00000378557 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
LOXL1Q08397 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
LOXL1Q08397 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
LOXL1Q08397 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
LOXL1Q08397 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
LOXL1Q08397 CICP24-201ENST00000605464 2705 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
LOXL1Q08397 CEP63-212ENST00000513612 2903 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
LOXL1Q08397 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
LOXL1Q08397 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
LOXL1Q08397 LRRTM1-201ENST00000295057 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
LOXL1Q08397 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
LOXL1Q08397 TEX264-201ENST00000341333 1340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
LOXL1Q08397 MRPL37P1-201ENST00000592451 1337 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
LOXL1Q08397 AC009093.10-201ENST00000641956 1442 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
LOXL1Q08397 CNN1-201ENST00000252456 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
LOXL1Q08397 RBM4B-206ENST00000531036 1646 ntTSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
LOXL1Q08397 MAU2-201ENST00000262815 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
LOXL1Q08397 AC025271.4-201ENST00000621477 1726 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
LOXL1Q08397 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
LOXL1Q08397 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
LOXL1Q08397 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
LOXL1Q08397 FBXO5-202ENST00000367241 2221 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
LOXL1Q08397 RSPO1-202ENST00000401068 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
LOXL1Q08397 OSBPL5-210ENST00000525498 2733 ntTSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
LOXL1Q08397 CRHR2-208ENST00000506074 3109 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
LOXL1Q08397 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
LOXL1Q08397 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
LOXL1Q08397 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
LOXL1Q08397 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
LOXL1Q08397 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
LOXL1Q08397 BTBD11-204ENST00000420571 3478 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
LOXL1Q08397 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
LOXL1Q08397 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
LOXL1Q08397 GOLGA8DP-202ENST00000341390 2184 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
LOXL1Q08397 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
LOXL1Q08397 XKR9-203ENST00000520030 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
LOXL1Q08397 OGFOD1-209ENST00000568397 1681 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
LOXL1Q08397 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
LOXL1Q08397 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
LOXL1Q08397 PLAC8L1-201ENST00000311450 638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
LOXL1Q08397 PRIMA1-201ENST00000316227 1080 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
LOXL1Q08397 CD300A-204ENST00000392625 1163 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
LOXL1Q08397 C1QA-202ENST00000402322 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
LOXL1Q08397 AL118508.1-202ENST00000411595 709 ntTSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
LOXL1Q08397 LAMA4-208ENST00000431543 1080 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
LOXL1Q08397 AL591242.1-203ENST00000434329 374 ntTSL 3 BASIC12.11□□□□□ -0.47
LOXL1Q08397 AC004869.1-201ENST00000440935 540 ntTSL 4 BASIC12.11□□□□□ -0.47
LOXL1Q08397 AC092535.3-201ENST00000504969 468 ntTSL 3 BASIC12.11□□□□□ -0.47
LOXL1Q08397 IGHV3-37-201ENST00000518544 340 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
LOXL1Q08397 LINC01224-201ENST00000593573 798 ntTSL 4 BASIC12.11□□□□□ -0.47
LOXL1Q08397 RNASEK-210ENST00000593646 566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
LOXL1Q08397 HIST1H4A-201ENST00000617569 312 ntAPPRIS P1 BASIC12.11□□□□□ -0.47
LOXL1Q08397 SRSF3-208ENST00000620941 869 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.11□□□□□ -0.47
LOXL1Q08397 DNAJC14-201ENST00000317269 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
LOXL1Q08397 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
LOXL1Q08397 COCH-202ENST00000396618 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
LOXL1Q08397 AC005264.1-201ENST00000587587 2319 ntTSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
LOXL1Q08397 ARHGEF16-201ENST00000378371 2219 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
LOXL1Q08397 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
LOXL1Q08397 RASSF5-201ENST00000577571 3496 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
LOXL1Q08397 TRAK1-208ENST00000484786 2008 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
LOXL1Q08397 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
LOXL1Q08397 SMYD1-203ENST00000444564 1816 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
LOXL1Q08397 THUMPD3-AS1-212ENST00000520447 1809 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
LOXL1Q08397 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
LOXL1Q08397 TAF1C-216ENST00000566732 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
LOXL1Q08397 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
LOXL1Q08397 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
LOXL1Q08397 KRBOX4-202ENST00000344302 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
LOXL1Q08397 ALOX15-202ENST00000570836 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
LOXL1Q08397 SPAG8-209ENST00000484764 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
LOXL1Q08397 ALG1-204ENST00000588623 2671 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
LOXL1Q08397 CHCHD7-202ENST00000355315 1535 ntTSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
LOXL1Q08397 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
LOXL1Q08397 RAMP3-201ENST00000242249 1323 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
LOXL1Q08397 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 91.9 ms