Protein–RNA interactions for Protein: Q08378

GOLGA3, Golgin subfamily A member 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,498 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA3Q08378 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
GOLGA3Q08378 AK1-202ENST00000373156 757 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
GOLGA3Q08378 SPIN2B-203ENST00000374910 725 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
GOLGA3Q08378 TMEM220-AS1-207ENST00000584714 541 ntTSL 4 BASIC23.29■■□□□ 1.32
GOLGA3Q08378 IRF3-225ENST00000600022 882 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GOLGA3Q08378 ANXA8L1-206ENST00000619162 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GOLGA3Q08378 AC104333.4-201ENST00000632866 554 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
GOLGA3Q08378 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
GOLGA3Q08378 TNFSF13-201ENST00000338784 1971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GOLGA3Q08378 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GOLGA3Q08378 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GOLGA3Q08378 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GOLGA3Q08378 AC093520.1-201ENST00000567545 1767 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
GOLGA3Q08378 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GOLGA3Q08378 LILRA2-203ENST00000391737 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GOLGA3Q08378 PRSS8-201ENST00000317508 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GOLGA3Q08378 AC007388.1-204ENST00000449569 2517 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
GOLGA3Q08378 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GOLGA3Q08378 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GOLGA3Q08378 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GOLGA3Q08378 AC232323.1-201ENST00000540724 2099 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
GOLGA3Q08378 AL513327.1-206ENST00000587696 1432 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
GOLGA3Q08378 IL9RP3-201ENST00000442856 1674 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
GOLGA3Q08378 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
GOLGA3Q08378 AC084030.1-201ENST00000455068 561 ntTSL 4 BASIC23.28■■□□□ 1.32
GOLGA3Q08378 ALG1L13P-202ENST00000519320 584 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
GOLGA3Q08378 AC138701.2-201ENST00000553634 226 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
GOLGA3Q08378 AC011481.2-201ENST00000585408 426 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
GOLGA3Q08378 ASNSD1-206ENST00000607062 968 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
GOLGA3Q08378 CRHR2-208ENST00000506074 3109 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GOLGA3Q08378 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
GOLGA3Q08378 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GOLGA3Q08378 PHTF1-202ENST00000369598 3000 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
GOLGA3Q08378 AC092506.1-201ENST00000634580 2275 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
GOLGA3Q08378 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
GOLGA3Q08378 FCHO1-206ENST00000594202 3214 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
GOLGA3Q08378 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GOLGA3Q08378 PPP1R1B-202ENST00000394265 1419 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GOLGA3Q08378 AC097359.2-201ENST00000604992 2389 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
GOLGA3Q08378 TTC39A-216ENST00000530004 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GOLGA3Q08378 IL18BP-205ENST00000393705 1549 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GOLGA3Q08378 LINC00552-201ENST00000625151 2579 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
GOLGA3Q08378 TRBJ2-6-201ENST00000390418 53 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
GOLGA3Q08378 PHACTR2-204ENST00000397980 745 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
GOLGA3Q08378 AC073869.2-201ENST00000417338 1026 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
GOLGA3Q08378 TXNRD2-206ENST00000462330 1129 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
GOLGA3Q08378 RTN4RL2-203ENST00000533205 637 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
GOLGA3Q08378 AL355916.2-201ENST00000556543 593 ntTSL 4 BASIC23.27■■□□□ 1.32
GOLGA3Q08378 AC008687.1-201ENST00000591656 786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
GOLGA3Q08378 YME1L1-202ENST00000375972 2517 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GOLGA3Q08378 TBRG4-215ENST00000494076 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
GOLGA3Q08378 EP400-203ENST00000333577 3092 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GOLGA3Q08378 DBF4-201ENST00000265728 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GOLGA3Q08378 TTC7A-203ENST00000409245 3033 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
GOLGA3Q08378 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
GOLGA3Q08378 RELL1-201ENST00000314117 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
GOLGA3Q08378 STK40-204ENST00000373132 3621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GOLGA3Q08378 MAP2K4-201ENST00000353533 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GOLGA3Q08378 TRMT1-201ENST00000221504 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GOLGA3Q08378 PRKRIP1-201ENST00000397912 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GOLGA3Q08378 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GOLGA3Q08378 C15orf52-206ENST00000559313 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GOLGA3Q08378 LINC002481-201ENST00000499502 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GOLGA3Q08378 BX640514.1-201ENST00000583223 1918 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
GOLGA3Q08378 CALR3-201ENST00000269881 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GOLGA3Q08378 TNNT2-203ENST00000367315 1083 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GOLGA3Q08378 BGLAP-201ENST00000368272 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GOLGA3Q08378 Z69890.1-201ENST00000382990 339 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
GOLGA3Q08378 MIR1227-201ENST00000408484 88 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
GOLGA3Q08378 NDUFS7-203ENST00000414651 841 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GOLGA3Q08378 AC092265.1-201ENST00000422638 498 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GOLGA3Q08378 IZUMO1R-202ENST00000440961 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GOLGA3Q08378 TNNT2-214ENST00000458432 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GOLGA3Q08378 ATP6V0A2-207ENST00000544833 1013 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GOLGA3Q08378 RN7SL470P-201ENST00000583069 259 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
GOLGA3Q08378 AC242426.4-201ENST00000606856 573 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GOLGA3Q08378 ANXA8L1-202ENST00000611655 1398 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GOLGA3Q08378 APBB3-205ENST00000412920 1455 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GOLGA3Q08378 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GOLGA3Q08378 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GOLGA3Q08378 AC022007.1-201ENST00000383808 1897 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GOLGA3Q08378 ABCB8-221ENST00000498578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GOLGA3Q08378 LIMK2-204ENST00000406516 2657 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GOLGA3Q08378 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GOLGA3Q08378 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GOLGA3Q08378 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GOLGA3Q08378 TUBB8P4-201ENST00000511806 1324 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
GOLGA3Q08378 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GOLGA3Q08378 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GOLGA3Q08378 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GOLGA3Q08378 HYOU1-218ENST00000614668 1569 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GOLGA3Q08378 ACTL7A-201ENST00000333999 1494 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GOLGA3Q08378 RASSF6-202ENST00000335049 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GOLGA3Q08378 C8G-201ENST00000224181 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GOLGA3Q08378 LY86-201ENST00000230568 559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GOLGA3Q08378 AL139008.1-201ENST00000437894 228 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
GOLGA3Q08378 OR2T27-202ENST00000460972 1136 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GOLGA3Q08378 ALG1L6P-201ENST00000515248 758 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
GOLGA3Q08378 AC009163.3-201ENST00000563554 852 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GOLGA3Q08378 MAFTRR-203ENST00000567993 685 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.2 ms