Protein–RNA interactions for Protein: Q07954

LRP1, Prolow-density lipoprotein receptor-related protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 4,544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRP1Q07954 MBD4-201ENST00000249910 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
LRP1Q07954 TPPP3-205ENST00000564104 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
LRP1Q07954 MTHFR-210ENST00000641407 2387 ntBASIC8.37□□□□□ -1.07
LRP1Q07954 SLC20A2-207ENST00000520179 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
LRP1Q07954 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC8.37□□□□□ -1.07
LRP1Q07954 WDSUB1-201ENST00000358147 1535 ntTSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
LRP1Q07954 ADPRHL1-201ENST00000356501 1877 ntTSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
LRP1Q07954 WDR1-203ENST00000382452 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
LRP1Q07954 NBAT1-201ENST00000566912 1940 ntTSL 2 BASIC8.37□□□□□ -1.07
LRP1Q07954 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
LRP1Q07954 ARHGAP27P1-BPTFP1-KPNA2P3-201ENST00000578492 2732 ntTSL 2 BASIC8.37□□□□□ -1.07
LRP1Q07954 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
LRP1Q07954 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
LRP1Q07954 BEND6-203ENST00000370748 3497 ntTSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
LRP1Q07954 AIF1L-205ENST00000372301 671 ntTSL 2 BASIC8.37□□□□□ -1.07
LRP1Q07954 PLA2G12B-201ENST00000373032 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
LRP1Q07954 NCR3-204ENST00000376073 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
LRP1Q07954 LINC01656-201ENST00000415702 630 ntTSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
LRP1Q07954 AP000244.1-201ENST00000424582 201 ntBASIC8.37□□□□□ -1.07
LRP1Q07954 LINC00399-201ENST00000439008 414 ntTSL 2 BASIC8.37□□□□□ -1.07
LRP1Q07954 AC099328.1-201ENST00000498809 1030 ntBASIC8.37□□□□□ -1.07
LRP1Q07954 AL357143.1-203ENST00000639750 881 ntBASIC8.37□□□□□ -1.07
LRP1Q07954 AL589740.1-203ENST00000433637 1984 ntTSL 2 BASIC8.37□□□□□ -1.07
LRP1Q07954 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC8.37□□□□□ -1.07
LRP1Q07954 TMEM145-203ENST00000598766 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.36□□□□□ -1.07
LRP1Q07954 RAB37-216ENST00000613645 1653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
LRP1Q07954 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
LRP1Q07954 CIART-201ENST00000290363 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
LRP1Q07954 POLR3K-201ENST00000293860 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
LRP1Q07954 SNX2-201ENST00000379516 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
LRP1Q07954 PDCD6-201ENST00000264933 1135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
LRP1Q07954 KRTAP10-9-201ENST00000397911 1171 ntAPPRIS P2 BASIC8.36□□□□□ -1.07
LRP1Q07954 Z95624.1-201ENST00000413528 628 ntTSL 5 BASIC8.36□□□□□ -1.07
LRP1Q07954 NRADDP-201ENST00000437305 691 ntBASIC8.36□□□□□ -1.07
LRP1Q07954 AC008494.1-201ENST00000497612 796 ntBASIC8.36□□□□□ -1.07
LRP1Q07954 C12orf73-210ENST00000552940 685 ntTSL 2 BASIC8.36□□□□□ -1.07
LRP1Q07954 SRP54-AS1-204ENST00000556705 580 ntTSL 2 BASIC8.36□□□□□ -1.07
LRP1Q07954 SHBG-217ENST00000576478 639 ntTSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
LRP1Q07954 AC005786.2-201ENST00000592368 369 ntTSL 3 BASIC8.36□□□□□ -1.07
LRP1Q07954 DDX49-214ENST00000629999 1912 ntTSL 5 BASIC8.36□□□□□ -1.07
LRP1Q07954 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
LRP1Q07954 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC8.36□□□□□ -1.07
LRP1Q07954 OASL-202ENST00000339275 1492 ntTSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
LRP1Q07954 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC8.36□□□□□ -1.07
LRP1Q07954 RSPH6A-203ENST00000600188 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.36□□□□□ -1.07
LRP1Q07954 AIFM1-209ENST00000535724 2468 ntTSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
LRP1Q07954 RFX8-201ENST00000428343 1686 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.36□□□□□ -1.07
LRP1Q07954 XPNPEP1-218ENST00000502935 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
LRP1Q07954 ATXN3-201ENST00000340660 1205 ntTSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
LRP1Q07954 OR7E12P-201ENST00000344740 973 ntBASIC8.36□□□□□ -1.07
LRP1Q07954 U73169.1-201ENST00000395152 367 ntBASIC8.36□□□□□ -1.07
LRP1Q07954 AC015795.2-201ENST00000512720 575 ntTSL 3 BASIC8.36□□□□□ -1.07
LRP1Q07954 SMUG1-221ENST00000514196 553 ntTSL 4 BASIC8.36□□□□□ -1.07
LRP1Q07954 ACY3-202ENST00000529256 933 ntTSL 3 BASIC8.36□□□□□ -1.07
LRP1Q07954 MAX-218ENST00000557746 571 ntTSL 4 BASIC8.36□□□□□ -1.07
LRP1Q07954 AC120498.5-201ENST00000561757 299 ntBASIC8.36□□□□□ -1.07
LRP1Q07954 SNORD3B-1-201ENST00000577988 758 ntBASIC8.36□□□□□ -1.07
LRP1Q07954 GGNBP1-204ENST00000613113 887 ntBASIC8.36□□□□□ -1.07
LRP1Q07954 ALDH8A1-204ENST00000367847 1587 ntTSL 2 BASIC8.36□□□□□ -1.07
LRP1Q07954 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
LRP1Q07954 GMEB1-202ENST00000361872 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
LRP1Q07954 AC064801.2-201ENST00000625052 1303 ntBASIC8.36□□□□□ -1.07
LRP1Q07954 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
LRP1Q07954 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
LRP1Q07954 AC022007.1-201ENST00000383808 1897 ntTSL 2 BASIC8.36□□□□□ -1.07
LRP1Q07954 AC022080.1-201ENST00000366255 781 ntBASIC8.36□□□□□ -1.07
LRP1Q07954 Z82188.2-201ENST00000419128 630 ntTSL 5 BASIC8.36□□□□□ -1.07
LRP1Q07954 AC000077.1-201ENST00000420012 953 ntBASIC8.36□□□□□ -1.07
LRP1Q07954 BUD23-204ENST00000423497 1219 ntTSL 5 BASIC8.36□□□□□ -1.07
LRP1Q07954 AL356000.1-201ENST00000441073 1238 ntBASIC8.36□□□□□ -1.07
LRP1Q07954 AL359219.1-201ENST00000556311 934 ntBASIC8.36□□□□□ -1.07
LRP1Q07954 AC145285.5-201ENST00000562217 361 ntBASIC8.36□□□□□ -1.07
LRP1Q07954 DERL2-206ENST00000572834 589 ntTSL 3 BASIC8.36□□□□□ -1.07
LRP1Q07954 ZNF235-203ENST00000589248 532 ntTSL 3 BASIC8.36□□□□□ -1.07
LRP1Q07954 FAAP24-203ENST00000589646 836 ntTSL 3 BASIC8.36□□□□□ -1.07
LRP1Q07954 SMAD7-208ENST00000591805 1152 ntTSL 2 BASIC8.36□□□□□ -1.07
LRP1Q07954 AL451165.2-201ENST00000606971 718 ntTSL 2 BASIC8.36□□□□□ -1.07
LRP1Q07954 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC8.36□□□□□ -1.07
LRP1Q07954 SLC29A4-203ENST00000406453 2734 ntTSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
LRP1Q07954 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.36□□□□□ -1.07
LRP1Q07954 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
LRP1Q07954 SCYL1-201ENST00000270176 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
LRP1Q07954 ADI1-201ENST00000327435 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
LRP1Q07954 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
LRP1Q07954 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
LRP1Q07954 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
LRP1Q07954 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
LRP1Q07954 KRT8P38-201ENST00000441370 1430 ntBASIC8.35□□□□□ -1.07
LRP1Q07954 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
LRP1Q07954 AC092295.1-201ENST00000446262 434 ntTSL 3 BASIC8.35□□□□□ -1.07
LRP1Q07954 B9D1-206ENST00000461069 923 ntTSL 2 BASIC8.35□□□□□ -1.07
LRP1Q07954 ALG1L15P-201ENST00000482834 794 ntBASIC8.35□□□□□ -1.07
LRP1Q07954 AC107464.2-201ENST00000502923 569 ntTSL 2 BASIC8.35□□□□□ -1.07
LRP1Q07954 AP006248.1-201ENST00000610471 67 ntBASIC8.35□□□□□ -1.07
LRP1Q07954 PRIMPOL-211ENST00000515774 2007 ntTSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
LRP1Q07954 OR2V1-204ENST00000641551 2423 ntAPPRIS P1 BASIC8.35□□□□□ -1.07
LRP1Q07954 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.35□□□□□ -1.07
LRP1Q07954 MAD2L1BP-201ENST00000372171 1301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
LRP1Q07954 RPL4P6-201ENST00000438116 1304 ntBASIC8.35□□□□□ -1.07
LRP1Q07954 STRADA-243ENST00000640086 1925 ntTSL 5 BASIC8.35□□□□□ -1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.8 ms