Protein–RNA interactions for Protein: Q07343

PDE4B, cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 4B, humanhuman

Predictions only

Length 736 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4BQ07343 CAMK2D-205ENST00000394524 5294 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PDE4BQ07343 POLR2B-205ENST00000441246 3839 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PDE4BQ07343 SGCE-204ENST00000428696 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PDE4BQ07343 MIR762HG-203ENST00000570025 1429 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PDE4BQ07343 POMK-201ENST00000331373 1865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PDE4BQ07343 ANKRD46-205ENST00000520311 3270 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PDE4BQ07343 PMM2-201ENST00000268261 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PDE4BQ07343 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PDE4BQ07343 RNF166-210ENST00000568683 1768 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PDE4BQ07343 HILPDA-201ENST00000257696 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PDE4BQ07343 CTSW-204ENST00000528419 1341 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PDE4BQ07343 GOSR2-203ENST00000415811 2171 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PDE4BQ07343 SLC1A6-201ENST00000221742 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PDE4BQ07343 KIAA1468-201ENST00000256858 5579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PDE4BQ07343 INO80-201ENST00000361937 6439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PDE4BQ07343 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PDE4BQ07343 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PDE4BQ07343 TEX13B-201ENST00000302917 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PDE4BQ07343 SERPINE3-201ENST00000400389 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PDE4BQ07343 VAMP1-203ENST00000400911 1068 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PDE4BQ07343 SPATA24-205ENST00000509959 641 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PDE4BQ07343 IGHVIII-5-2-201ENST00000522505 261 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
PDE4BQ07343 FADS2-212ENST00000522639 360 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PDE4BQ07343 BCL9L-202ENST00000526143 5514 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PDE4BQ07343 FADS2-215ENST00000574708 385 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PDE4BQ07343 MUC1-226ENST00000614519 1093 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PDE4BQ07343 AC133540.1-201ENST00000620845 1019 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
PDE4BQ07343 MBD3L2B-202ENST00000637800 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PDE4BQ07343 MFRP-201ENST00000360167 1663 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PDE4BQ07343 TNF-208ENST00000449264 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PDE4BQ07343 C21orf58-204ENST00000397682 2941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PDE4BQ07343 GPR17-201ENST00000272644 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PDE4BQ07343 MFNG-202ENST00000416983 2034 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PDE4BQ07343 LMNA-213ENST00000473598 2015 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PDE4BQ07343 MAP7D1-203ENST00000373150 3238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PDE4BQ07343 LPAR1-203ENST00000374431 3637 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PDE4BQ07343 TMBIM1-201ENST00000258412 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PDE4BQ07343 AC009053.1-204ENST00000429810 2355 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PDE4BQ07343 CA12-202ENST00000344366 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PDE4BQ07343 AP000552.1-203ENST00000416615 1930 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PDE4BQ07343 AC026992.2-202ENST00000565312 1934 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PDE4BQ07343 RBFOX2-201ENST00000262829 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PDE4BQ07343 WASHC2A-202ENST00000314664 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PDE4BQ07343 WDR83-201ENST00000418543 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PDE4BQ07343 PDYN-AS1-201ENST00000446562 1802 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PDE4BQ07343 IRF2BP2-201ENST00000366609 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PDE4BQ07343 MYADML-201ENST00000474610 2147 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
PDE4BQ07343 ACTN2-206ENST00000542672 4906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PDE4BQ07343 ZBTB7C-213ENST00000588982 4949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PDE4BQ07343 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PDE4BQ07343 GGT1-201ENST00000248923 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PDE4BQ07343 LDLR-202ENST00000455727 2333 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PDE4BQ07343 AKT1S1-205ENST00000391833 3640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PDE4BQ07343 HHEX-202ENST00000472590 1605 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PDE4BQ07343 MAOB-201ENST00000378069 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PDE4BQ07343 SLC6A9-203ENST00000372306 1926 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PDE4BQ07343 MRPS12-201ENST00000308018 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PDE4BQ07343 RHCE-202ENST00000340849 1087 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PDE4BQ07343 NFYC-202ENST00000372651 1202 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PDE4BQ07343 CRYBA2-202ENST00000392096 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PDE4BQ07343 AC016825.1-201ENST00000433600 778 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PDE4BQ07343 AL162742.1-201ENST00000434792 954 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PDE4BQ07343 HIST2H2BC-201ENST00000498492 580 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
PDE4BQ07343 AP002387.1-201ENST00000529369 680 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PDE4BQ07343 AC009779.1-201ENST00000551138 283 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
PDE4BQ07343 AC046168.2-201ENST00000560590 875 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PDE4BQ07343 AC027237.1-201ENST00000560942 655 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
PDE4BQ07343 AL645939.5-201ENST00000606834 243 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
PDE4BQ07343 AC026740.1-201ENST00000607068 791 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
PDE4BQ07343 AC100757.4-201ENST00000626934 759 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
PDE4BQ07343 AC079325.2-202ENST00000641031 462 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PDE4BQ07343 AKAP2-203ENST00000434623 4400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PDE4BQ07343 PRNP-203ENST00000430350 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PDE4BQ07343 FXYD5-201ENST00000342879 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PDE4BQ07343 ZBED1-201ENST00000381218 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PDE4BQ07343 PDE8B-203ENST00000340978 3426 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PDE4BQ07343 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PDE4BQ07343 BCKDHA-201ENST00000269980 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PDE4BQ07343 CBX3-201ENST00000337620 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PDE4BQ07343 ATP6V1C1-202ENST00000518738 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PDE4BQ07343 KATNBL1-201ENST00000256544 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PDE4BQ07343 STAM-202ENST00000377524 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PDE4BQ07343 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PDE4BQ07343 UBTF-201ENST00000302904 4997 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PDE4BQ07343 LINC00667-206ENST00000582363 2935 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PDE4BQ07343 DCUN1D2-201ENST00000332592 2626 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PDE4BQ07343 FBXL19-202ENST00000380310 3796 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PDE4BQ07343 CDK16-211ENST00000518022 2022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PDE4BQ07343 PCCB-215ENST00000482086 1436 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PDE4BQ07343 KDM5C-205ENST00000404049 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PDE4BQ07343 WASH2P-202ENST00000538033 2800 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PDE4BQ07343 ZNF587-203ENST00000423137 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PDE4BQ07343 SPATA6-204ENST00000396199 4964 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PDE4BQ07343 NMBR-201ENST00000258042 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PDE4BQ07343 LCMT1-203ENST00000399069 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PDE4BQ07343 CAVIN1-201ENST00000357037 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PDE4BQ07343 IQCE-203ENST00000402050 6844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PDE4BQ07343 CSTB-201ENST00000291568 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PDE4BQ07343 PRMT9-201ENST00000322396 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PDE4BQ07343 GPSM1-202ENST00000354753 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.3 ms