Protein–RNA interactions for Protein: Q06124

PTPN11, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 11, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 597 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN11Q06124 AP001184.1-201ENST00000637936 376 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
PTPN11Q06124 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PTPN11Q06124 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PTPN11Q06124 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PTPN11Q06124 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PTPN11Q06124 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PTPN11Q06124 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PTPN11Q06124 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PTPN11Q06124 AC005726.3-202ENST00000577814 1316 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PTPN11Q06124 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PTPN11Q06124 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PTPN11Q06124 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PTPN11Q06124 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PTPN11Q06124 RASGEF1B-202ENST00000335927 1756 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PTPN11Q06124 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PTPN11Q06124 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PTPN11Q06124 ZNF619-201ENST00000314686 2233 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PTPN11Q06124 SLC35G3-201ENST00000297307 2004 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTPN11Q06124 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTPN11Q06124 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTPN11Q06124 TMEM144-209ENST00000509278 1633 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTPN11Q06124 NOX5-209ENST00000530406 2289 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTPN11Q06124 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTPN11Q06124 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTPN11Q06124 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTPN11Q06124 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTPN11Q06124 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTPN11Q06124 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTPN11Q06124 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTPN11Q06124 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTPN11Q06124 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTPN11Q06124 MARK2P16-201ENST00000605714 1723 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
PTPN11Q06124 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTPN11Q06124 ATP5H-201ENST00000301587 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTPN11Q06124 ADARB2-AS1-201ENST00000381301 625 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTPN11Q06124 CD300A-204ENST00000392625 1163 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTPN11Q06124 AC114488.1-201ENST00000435872 591 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTPN11Q06124 ST13P19-201ENST00000442505 1124 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
PTPN11Q06124 ORAOV1P1-201ENST00000503108 395 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
PTPN11Q06124 IGHVIII-5-2-201ENST00000522505 261 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
PTPN11Q06124 AC025154.2-201ENST00000550530 445 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTPN11Q06124 MESP2-203ENST00000560219 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTPN11Q06124 DRG2-220ENST00000583355 891 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTPN11Q06124 PRMT5-AS1-206ENST00000599580 847 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTPN11Q06124 ZNF350-AS1-202ENST00000600253 577 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTPN11Q06124 MIR6858-201ENST00000620733 67 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
PTPN11Q06124 CHCHD7-202ENST00000355315 1535 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTPN11Q06124 TEX264-201ENST00000341333 1340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTPN11Q06124 PCBP1-AS1-214ENST00000419542 1309 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTPN11Q06124 ZNF691-206ENST00000372508 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTPN11Q06124 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTPN11Q06124 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTPN11Q06124 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTPN11Q06124 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTPN11Q06124 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTPN11Q06124 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTPN11Q06124 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTPN11Q06124 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTPN11Q06124 KCNN3-202ENST00000358505 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTPN11Q06124 BTBD8-201ENST00000342818 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTPN11Q06124 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTPN11Q06124 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTPN11Q06124 TMEM230-201ENST00000202834 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTPN11Q06124 GPSM3-209ENST00000487761 1460 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTPN11Q06124 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTPN11Q06124 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTPN11Q06124 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTPN11Q06124 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTPN11Q06124 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTPN11Q06124 TOM1L2-205ENST00000478943 2098 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTPN11Q06124 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTPN11Q06124 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTPN11Q06124 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTPN11Q06124 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTPN11Q06124 NR0B2-201ENST00000254227 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTPN11Q06124 PON3-201ENST00000265627 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTPN11Q06124 MAD2L2-206ENST00000376672 1002 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTPN11Q06124 SMIM29-202ENST00000394990 792 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTPN11Q06124 SAPCD1-208ENST00000415669 916 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTPN11Q06124 MPC1L-201ENST00000423387 571 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTPN11Q06124 GAS5-209ENST00000430245 723 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTPN11Q06124 AL512330.1-201ENST00000456701 349 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTPN11Q06124 AC025154.2-202ENST00000552379 592 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTPN11Q06124 AC124068.2-202ENST00000562356 612 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTPN11Q06124 AC124068.2-201ENST00000569473 1109 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
PTPN11Q06124 AC103808.5-201ENST00000577797 462 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTPN11Q06124 RNASEK-210ENST00000593646 566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTPN11Q06124 BCL2L12-204ENST00000594157 620 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTPN11Q06124 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTPN11Q06124 C12orf76-209ENST00000615315 1580 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTPN11Q06124 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTPN11Q06124 AC139712.1-201ENST00000378256 1875 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
PTPN11Q06124 MAEA-207ENST00000505177 1340 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTPN11Q06124 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTPN11Q06124 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTPN11Q06124 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTPN11Q06124 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTPN11Q06124 ZNF586-202ENST00000396150 1977 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTPN11Q06124 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTPN11Q06124 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.2 ms