Protein–RNA interactions for Protein: Q01628

IFITM3, Interferon-induced transmembrane protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFITM3Q01628 MAP7D3-201ENST00000316077 4567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
IFITM3Q01628 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
IFITM3Q01628 ALOXE3-201ENST00000318227 3053 ntTSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
IFITM3Q01628 CPT1C-217ENST00000598293 2767 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
IFITM3Q01628 GLB1L-203ENST00000409640 2042 ntTSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
IFITM3Q01628 HADHB-209ENST00000545822 1870 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
IFITM3Q01628 KCNH1-202ENST00000367007 3445 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
IFITM3Q01628 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
IFITM3Q01628 PAX8-203ENST00000348715 3966 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
IFITM3Q01628 ELFN2-201ENST00000402918 8361 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.66□□□□□ -0.38
IFITM3Q01628 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
IFITM3Q01628 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
IFITM3Q01628 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
IFITM3Q01628 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
IFITM3Q01628 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
IFITM3Q01628 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
IFITM3Q01628 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC12.66□□□□□ -0.38
IFITM3Q01628 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
IFITM3Q01628 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC12.66□□□□□ -0.38
IFITM3Q01628 AC100818.1-201ENST00000524167 563 ntTSL 4 BASIC12.66□□□□□ -0.38
IFITM3Q01628 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
IFITM3Q01628 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC12.66□□□□□ -0.38
IFITM3Q01628 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
IFITM3Q01628 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
IFITM3Q01628 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
IFITM3Q01628 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
IFITM3Q01628 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.66□□□□□ -0.38
IFITM3Q01628 MIR193BHG-211ENST00000641433 5365 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
IFITM3Q01628 CHIAP2-201ENST00000369743 2829 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
IFITM3Q01628 GRIK4-202ENST00000438375 4214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
IFITM3Q01628 LGR5-202ENST00000536515 2664 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
IFITM3Q01628 UBE3A-207ENST00000614096 8741 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
IFITM3Q01628 ANP32E-210ENST00000629042 3054 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
IFITM3Q01628 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
IFITM3Q01628 PI4KA-201ENST00000255882 6752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
IFITM3Q01628 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC12.66□□□□□ -0.38
IFITM3Q01628 ACIN1-201ENST00000262710 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
IFITM3Q01628 PKP4P1-201ENST00000426801 2158 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
IFITM3Q01628 AC087164.2-201ENST00000624514 3130 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
IFITM3Q01628 PDCD6IPP2-206ENST00000566178 3351 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
IFITM3Q01628 WDR60-202ENST00000407559 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
IFITM3Q01628 DBIL5P-203ENST00000536214 2677 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
IFITM3Q01628 PHYHIP-201ENST00000321613 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
IFITM3Q01628 GABRB3-219ENST00000636466 4509 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
IFITM3Q01628 CCT6P3-201ENST00000419314 3702 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
IFITM3Q01628 FAM156B-201ENST00000416841 2537 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
IFITM3Q01628 UBA3-201ENST00000349511 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
IFITM3Q01628 A1CF-204ENST00000373997 2116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
IFITM3Q01628 OXA1L-201ENST00000285848 1719 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
IFITM3Q01628 GBP1P1-201ENST00000394662 1740 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
IFITM3Q01628 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
IFITM3Q01628 CCNY-203ENST00000374704 3960 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
IFITM3Q01628 PHKB-208ENST00000566044 3829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
IFITM3Q01628 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
IFITM3Q01628 USP19-208ENST00000453664 4719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
IFITM3Q01628 ZNF302-203ENST00000457781 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
IFITM3Q01628 PIK3R5-220ENST00000623421 4318 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
IFITM3Q01628 APOBR-201ENST00000431282 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
IFITM3Q01628 GRIN1-205ENST00000371555 4003 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
IFITM3Q01628 MKRN2-201ENST00000170447 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
IFITM3Q01628 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
IFITM3Q01628 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
IFITM3Q01628 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
IFITM3Q01628 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
IFITM3Q01628 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
IFITM3Q01628 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
IFITM3Q01628 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
IFITM3Q01628 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
IFITM3Q01628 SORD2P-201ENST00000558556 1069 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
IFITM3Q01628 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
IFITM3Q01628 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
IFITM3Q01628 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
IFITM3Q01628 RPS15-202ENST00000585665 467 ntTSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
IFITM3Q01628 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
IFITM3Q01628 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC12.65□□□□□ -0.38
IFITM3Q01628 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
IFITM3Q01628 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
IFITM3Q01628 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
IFITM3Q01628 GAB2-202ENST00000361507 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
IFITM3Q01628 ELN-216ENST00000429192 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
IFITM3Q01628 AC009336.2-201ENST00000468418 3521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
IFITM3Q01628 ORMDL2-201ENST00000243045 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
IFITM3Q01628 DRG2-202ENST00000395726 1897 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
IFITM3Q01628 INHBA-203ENST00000442711 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
IFITM3Q01628 IKZF1-206ENST00000359197 3487 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
IFITM3Q01628 TMEM123-202ENST00000398136 3579 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
IFITM3Q01628 TMEM132C-201ENST00000435159 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
IFITM3Q01628 SLC23A1-202ENST00000353963 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
IFITM3Q01628 TMPRSS7-201ENST00000419127 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
IFITM3Q01628 LINC00442-202ENST00000456737 2063 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
IFITM3Q01628 C1QTNF6-201ENST00000337843 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
IFITM3Q01628 POPDC2-208ENST00000493094 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.39
IFITM3Q01628 GDAP2-201ENST00000369442 2436 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
IFITM3Q01628 RFWD3-202ENST00000571750 3033 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
IFITM3Q01628 BHMT-201ENST00000274353 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
IFITM3Q01628 CTRC-201ENST00000375943 3147 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
IFITM3Q01628 PI4KAP2-211ENST00000486209 3213 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
IFITM3Q01628 STAT3-202ENST00000389272 2615 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
IFITM3Q01628 FMO1-203ENST00000402921 2003 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
IFITM3Q01628 RGPD5-203ENST00000393283 3304 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.5 ms