Protein–RNA interactions for Protein: Q00994

BEX3, Protein BEX3, humanhuman

Predictions only

Length 111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BEX3Q00994 ATF4-202ENST00000396680 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
BEX3Q00994 ANKMY1-210ENST00000406958 2396 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
BEX3Q00994 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
BEX3Q00994 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
BEX3Q00994 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
BEX3Q00994 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
BEX3Q00994 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
BEX3Q00994 AC138761.4-201ENST00000578881 1514 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
BEX3Q00994 OXA1L-212ENST00000604262 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
BEX3Q00994 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
BEX3Q00994 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
BEX3Q00994 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
BEX3Q00994 CYP20A1-203ENST00000429815 1812 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
BEX3Q00994 MSI2-202ENST00000322684 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
BEX3Q00994 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
BEX3Q00994 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
BEX3Q00994 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
BEX3Q00994 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
BEX3Q00994 LTF-202ENST00000417439 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
BEX3Q00994 NDRG2-226ENST00000554104 2146 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
BEX3Q00994 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
BEX3Q00994 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
BEX3Q00994 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
BEX3Q00994 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
BEX3Q00994 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
BEX3Q00994 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
BEX3Q00994 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
BEX3Q00994 AMZ1-201ENST00000312371 5516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
BEX3Q00994 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
BEX3Q00994 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
BEX3Q00994 LIMS1-201ENST00000332345 1235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
BEX3Q00994 MYMK-201ENST00000339996 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
BEX3Q00994 Z97652.1-201ENST00000415176 329 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
BEX3Q00994 MIR503HG-202ENST00000440570 760 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
BEX3Q00994 AL121845.1-201ENST00000447343 464 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
BEX3Q00994 ZAP70-202ENST00000451498 1085 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
BEX3Q00994 AC108462.1-201ENST00000457467 850 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
BEX3Q00994 AL691482.3-201ENST00000504773 987 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
BEX3Q00994 AC020659.1-202ENST00000564432 531 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
BEX3Q00994 MIR2392-201ENST00000584881 84 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
BEX3Q00994 AC021016.3-201ENST00000608367 477 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
BEX3Q00994 AC090386.2-201ENST00000623010 1039 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
BEX3Q00994 AC138466.4-201ENST00000623965 852 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
BEX3Q00994 LINC02537-201ENST00000635943 1367 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
BEX3Q00994 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
BEX3Q00994 RBP1-205ENST00000492918 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
BEX3Q00994 ASB15-207ENST00000540573 1651 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
BEX3Q00994 LINC01864-201ENST00000587218 1661 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
BEX3Q00994 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
BEX3Q00994 GMPR2-204ENST00000420554 1864 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
BEX3Q00994 GMPR2-223ENST00000559836 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
BEX3Q00994 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
BEX3Q00994 MYRF-203ENST00000389602 2052 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
BEX3Q00994 AGGF1P1-201ENST00000509500 2073 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
BEX3Q00994 NBPF3-205ENST00000454000 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
BEX3Q00994 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
BEX3Q00994 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
BEX3Q00994 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
BEX3Q00994 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
BEX3Q00994 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
BEX3Q00994 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
BEX3Q00994 ZBTB7C-204ENST00000586438 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
BEX3Q00994 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
BEX3Q00994 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
BEX3Q00994 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
BEX3Q00994 TIMP2-201ENST00000262768 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
BEX3Q00994 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
BEX3Q00994 PNMA1-201ENST00000316836 2590 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
BEX3Q00994 GDAP1L1-207ENST00000612599 2585 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
BEX3Q00994 CCT4-201ENST00000394440 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
BEX3Q00994 AC018442.1-201ENST00000421439 2061 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
BEX3Q00994 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
BEX3Q00994 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
BEX3Q00994 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
BEX3Q00994 AC010096.1-201ENST00000443897 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
BEX3Q00994 LINC02021-201ENST00000504808 1608 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
BEX3Q00994 CCDC51-206ENST00000447018 1461 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
BEX3Q00994 BMP1-203ENST00000354870 3989 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
BEX3Q00994 TEKT4P2-202ENST00000559466 1312 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
BEX3Q00994 Metazoa_SRP.4-201ENST00000366232 298 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
BEX3Q00994 TNNT2-203ENST00000367315 1083 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
BEX3Q00994 CCDC167-201ENST00000373408 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
BEX3Q00994 LIF-202ENST00000403987 592 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
BEX3Q00994 NDUFS7-203ENST00000414651 841 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
BEX3Q00994 LINC01433-201ENST00000419003 697 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
BEX3Q00994 POLR2H-203ENST00000430783 1159 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
BEX3Q00994 AL392046.1-202ENST00000457255 521 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
BEX3Q00994 RPS23-204ENST00000507980 836 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
BEX3Q00994 RPS25-202ENST00000527673 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
BEX3Q00994 OR5BD1P-201ENST00000532527 817 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
BEX3Q00994 DNAJB13-203ENST00000537753 912 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
BEX3Q00994 AC005357.2-202ENST00000590507 1060 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
BEX3Q00994 SIGLEC22P-202ENST00000602065 544 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
BEX3Q00994 EAF1-AS1-208ENST00000608408 770 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
BEX3Q00994 AC114296.1-204ENST00000637197 1173 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
BEX3Q00994 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
BEX3Q00994 AC018529.2-202ENST00000611482 3087 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
BEX3Q00994 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
BEX3Q00994 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
BEX3Q00994 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms