Protein–RNA interactions for Protein: P78337

PITX1, Pituitary homeobox 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITX1P78337 CAB39-201ENST00000258418 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PITX1P78337 ZNF248-202ENST00000374648 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PITX1P78337 CLIC1-206ENST00000375779 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PITX1P78337 MIR1247-201ENST00000408206 136 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
PITX1P78337 LIMS1-206ENST00000414829 439 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PITX1P78337 VAMP8-203ENST00000432071 664 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PITX1P78337 ST13P19-201ENST00000442505 1124 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
PITX1P78337 AC004898.1-201ENST00000451057 766 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
PITX1P78337 OARD1-212ENST00000482515 832 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PITX1P78337 LIMS3-205ENST00000487150 782 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PITX1P78337 UCHL1-207ENST00000508768 827 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PITX1P78337 PLEKHB1-206ENST00000535129 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PITX1P78337 TGIF1-218ENST00000551402 1089 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PITX1P78337 AL021546.1-201ENST00000551806 552 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PITX1P78337 SNORD3B-2-202ENST00000571722 791 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
PITX1P78337 AC127024.2-201ENST00000581019 789 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PITX1P78337 PRCD-210ENST00000592014 462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PITX1P78337 HNF4G-201ENST00000354370 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PITX1P78337 PTBP1-201ENST00000349038 3155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PITX1P78337 GATA3-202ENST00000379328 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PITX1P78337 FGGY-203ENST00000371212 1640 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PITX1P78337 CNOT3-201ENST00000221232 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PITX1P78337 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PITX1P78337 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PITX1P78337 RBFOX2-201ENST00000262829 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PITX1P78337 ALOX15-202ENST00000570836 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PITX1P78337 PSG4-203ENST00000433626 1887 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PITX1P78337 TNIP1-214ENST00000522226 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PITX1P78337 MPP2-214ENST00000523501 2121 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PITX1P78337 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PITX1P78337 ABI2-215ENST00000430418 1676 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PITX1P78337 ACTL8-202ENST00000617065 1670 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PITX1P78337 B4GALNT3-201ENST00000266383 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PITX1P78337 ZNF691-206ENST00000372508 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PITX1P78337 KCNC3-202ENST00000474951 3347 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PITX1P78337 SRSF8-201ENST00000587424 4028 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PITX1P78337 APBB1-220ENST00000609331 1574 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PITX1P78337 DMTN-205ENST00000432128 2508 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PITX1P78337 CCNB1-201ENST00000256442 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PITX1P78337 ATP2A3-204ENST00000397035 4182 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PITX1P78337 TRIM23-202ENST00000274327 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PITX1P78337 FAM149A-203ENST00000389354 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PITX1P78337 SLC51A-201ENST00000296327 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PITX1P78337 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PITX1P78337 HIF3A-206ENST00000472815 1709 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PITX1P78337 SHISA9-201ENST00000423335 4043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PITX1P78337 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PITX1P78337 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PITX1P78337 C1orf123-201ENST00000294360 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PITX1P78337 C3orf22-201ENST00000318225 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PITX1P78337 FCRLB-201ENST00000336830 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PITX1P78337 CSH2-201ENST00000336844 1173 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PITX1P78337 CSH2-202ENST00000345366 598 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PITX1P78337 MRPL55-214ENST00000366741 603 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PITX1P78337 MRPL55-218ENST00000366747 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PITX1P78337 ETV2-201ENST00000379023 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PITX1P78337 CSH2-203ENST00000392886 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PITX1P78337 AL391119.1-201ENST00000416563 271 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PITX1P78337 AL450469.2-201ENST00000427132 499 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PITX1P78337 AC244250.1-201ENST00000438185 451 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PITX1P78337 ROPN1B-210ENST00000514116 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PITX1P78337 AC003686.1-201ENST00000550956 1034 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
PITX1P78337 CSH2-206ENST00000560142 749 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PITX1P78337 JMJD8-203ENST00000562824 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PITX1P78337 AC008133.1-201ENST00000584688 557 ntTSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PITX1P78337 AL358473.2-201ENST00000610411 556 ntTSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PITX1P78337 AC092299.1-201ENST00000632679 757 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
PITX1P78337 KRAS-202ENST00000311936 5765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PITX1P78337 MCHR2-201ENST00000281806 2368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PITX1P78337 ASGR1-201ENST00000269299 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PITX1P78337 ATXN10-202ENST00000381061 3135 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PITX1P78337 CUEDC1-206ENST00000577830 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PITX1P78337 NFS1-203ENST00000374092 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PITX1P78337 HSPA7-201ENST00000445535 1927 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
PITX1P78337 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PITX1P78337 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PITX1P78337 STK33-203ENST00000396672 2558 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PITX1P78337 LINC02396-202ENST00000550636 2324 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PITX1P78337 SDCBP2-AS1-201ENST00000446423 1811 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PITX1P78337 PAF1-204ENST00000595564 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PITX1P78337 MAGEA4-205ENST00000393920 1721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PITX1P78337 HPD-204ENST00000543163 1709 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PITX1P78337 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PITX1P78337 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PITX1P78337 SEMA3G-201ENST00000231721 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PITX1P78337 AC109466.1-209ENST00000486913 1618 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PITX1P78337 OR3A2-205ENST00000641164 2033 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PITX1P78337 ID2-203ENST00000396290 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PITX1P78337 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PITX1P78337 ATL2-210ENST00000452935 2199 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PITX1P78337 AL139260.2-201ENST00000622355 2171 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PITX1P78337 FGD5-AS1-202ENST00000424349 3792 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PITX1P78337 AC008125.1-201ENST00000548488 1538 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PITX1P78337 TKT-201ENST00000296289 1931 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PITX1P78337 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PITX1P78337 CCDC88B-201ENST00000301897 870 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PITX1P78337 ZNF138-201ENST00000307355 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PITX1P78337 EIF4EBP3-201ENST00000310331 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PITX1P78337 VSIG2-201ENST00000326621 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PITX1P78337 FRMD3-202ENST00000328788 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.4 ms