Protein–RNA interactions for Protein: P63145

ERVK-24, Endogenous retrovirus group K member 24 Gag polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 666 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVK-24P63145 FAM219A-204ENST00000379081 3543 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ERVK-24P63145 CEP78-203ENST00000376598 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ERVK-24P63145 SNX14-202ENST00000346348 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ERVK-24P63145 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ERVK-24P63145 PHTF1-202ENST00000369598 3000 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ERVK-24P63145 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ERVK-24P63145 CCDC51-201ENST00000395694 1560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ERVK-24P63145 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ERVK-24P63145 ERN2-202ENST00000457008 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ERVK-24P63145 CCDC116-201ENST00000292779 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ERVK-24P63145 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ERVK-24P63145 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ERVK-24P63145 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ERVK-24P63145 PDZD4-201ENST00000164640 3689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ERVK-24P63145 PDE7A-203ENST00000401827 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ERVK-24P63145 KCNT1-211ENST00000491806 3678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ERVK-24P63145 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ERVK-24P63145 USP35-204ENST00000530267 2419 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ERVK-24P63145 ABHD4-201ENST00000216327 716 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ERVK-24P63145 AL355334.1-201ENST00000417713 215 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
ERVK-24P63145 RPS9P1-201ENST00000419943 583 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
ERVK-24P63145 LINC00322-201ENST00000450205 699 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ERVK-24P63145 AC011773.1-201ENST00000520129 468 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ERVK-24P63145 FOS-204ENST00000554617 796 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ERVK-24P63145 ANP32A-210ENST00000560303 724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ERVK-24P63145 FAM104A-206ENST00000583024 417 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ERVK-24P63145 FBXL12-202ENST00000585379 956 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ERVK-24P63145 AC111170.1-201ENST00000591110 1132 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ERVK-24P63145 AP005264.3-201ENST00000592370 485 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ERVK-24P63145 HPN-206ENST00000597419 1212 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ERVK-24P63145 MIR6842-201ENST00000612539 65 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
ERVK-24P63145 ITGA9-AS1-213ENST00000614028 913 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ERVK-24P63145 AC242376.2-201ENST00000619355 883 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
ERVK-24P63145 ALKBH2-208ENST00000619381 895 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ERVK-24P63145 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ERVK-24P63145 C1orf159-202ENST00000379320 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ERVK-24P63145 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ERVK-24P63145 SLC22A7-202ENST00000372585 2555 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ERVK-24P63145 MSTO1-202ENST00000368341 2245 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ERVK-24P63145 BCL10-201ENST00000370580 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ERVK-24P63145 HORMAD1-201ENST00000322343 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ERVK-24P63145 VARS2-211ENST00000541562 3566 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ERVK-24P63145 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ERVK-24P63145 DDX50-206ENST00000610822 2510 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ERVK-24P63145 ILF2-205ENST00000615950 1906 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ERVK-24P63145 RHD-202ENST00000342055 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ERVK-24P63145 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ERVK-24P63145 PAK1IP1-201ENST00000379568 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ERVK-24P63145 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ERVK-24P63145 FSIP1-201ENST00000350221 2805 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ERVK-24P63145 SLC52A3-202ENST00000381944 3060 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ERVK-24P63145 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ERVK-24P63145 TNFSF13-201ENST00000338784 1971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ERVK-24P63145 CSRP1-201ENST00000340006 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ERVK-24P63145 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ERVK-24P63145 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ERVK-24P63145 GCK-204ENST00000403799 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ERVK-24P63145 CHFR-204ENST00000443047 2990 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ERVK-24P63145 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ERVK-24P63145 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ERVK-24P63145 SMTNL1-202ENST00000527972 1649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ERVK-24P63145 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ERVK-24P63145 GREM1-202ENST00000560830 2648 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ERVK-24P63145 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ERVK-24P63145 ALAS2-202ENST00000335854 1795 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ERVK-24P63145 AC015909.3-201ENST00000572855 1794 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
ERVK-24P63145 SERP1-201ENST00000239944 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ERVK-24P63145 MUC1-203ENST00000342482 537 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ERVK-24P63145 AP000356.3-201ENST00000382243 753 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
ERVK-24P63145 HPGD-203ENST00000422112 805 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ERVK-24P63145 AL606489.1-201ENST00000443515 486 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ERVK-24P63145 AC246817.2-203ENST00000517357 569 ntTSL 4 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ERVK-24P63145 AC246817.2-202ENST00000519393 564 ntTSL 4 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ERVK-24P63145 RBM8B-201ENST00000555532 525 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
ERVK-24P63145 PHBP15-201ENST00000574228 665 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
ERVK-24P63145 AC005726.2-204ENST00000577790 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ERVK-24P63145 LINC01783-202ENST00000614408 828 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
ERVK-24P63145 WT1-AS_6.1-201ENST00000614919 121 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
ERVK-24P63145 BX284668.2-205ENST00000619677 828 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
ERVK-24P63145 IFI27-215ENST00000621160 644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ERVK-24P63145 DDX5-235ENST00000630471 473 ntTSL 4 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ERVK-24P63145 FOS-201ENST00000303562 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ERVK-24P63145 HVCN1-202ENST00000356742 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ERVK-24P63145 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ERVK-24P63145 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ERVK-24P63145 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ERVK-24P63145 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ERVK-24P63145 GTF2H2C-210ENST00000510979 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ERVK-24P63145 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
ERVK-24P63145 FAM110C-201ENST00000327669 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ERVK-24P63145 C5orf66-206ENST00000624272 2479 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ERVK-24P63145 SLC1A7-206ENST00000620347 2873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ERVK-24P63145 DUS4L-201ENST00000265720 2220 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ERVK-24P63145 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
ERVK-24P63145 TMCC2-202ENST00000330675 2780 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ERVK-24P63145 JKAMP-207ENST00000554271 2137 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ERVK-24P63145 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ERVK-24P63145 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ERVK-24P63145 XRCC1-201ENST00000262887 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ERVK-24P63145 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms