Protein–RNA interactions for Protein: P58512

LINC01547, Uncharacterized protein encoded by LINC01547, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 204 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC01547P58512 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
LINC01547P58512 FNTB-201ENST00000246166 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
LINC01547P58512 LRSAM1-203ENST00000373322 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
LINC01547P58512 TVP23C-CDRT4-203ENST00000522212 2833 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.33□□□□□ -0.92
LINC01547P58512 TOLLIP-203ENST00000525159 3429 ntTSL 2 BASIC9.33□□□□□ -0.92
LINC01547P58512 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
LINC01547P58512 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC9.33□□□□□ -0.92
LINC01547P58512 DCAF10-202ENST00000377724 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
LINC01547P58512 PIK3CG-205ENST00000496166 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
LINC01547P58512 HMOX2-216ENST00000613539 1703 ntTSL 5 BASIC9.33□□□□□ -0.92
LINC01547P58512 EXOC3-201ENST00000315013 2682 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.33□□□□□ -0.92
LINC01547P58512 SLC35E2-202ENST00000355439 2078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
LINC01547P58512 HPS1-215ENST00000613394 3714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.33□□□□□ -0.92
LINC01547P58512 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
LINC01547P58512 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC9.33□□□□□ -0.92
LINC01547P58512 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
LINC01547P58512 MTSS1-216ENST00000524090 2166 ntTSL 2 BASIC9.33□□□□□ -0.92
LINC01547P58512 ELAVL1-201ENST00000407627 6015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
LINC01547P58512 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC9.33□□□□□ -0.92
LINC01547P58512 USP19-206ENST00000417901 4706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
LINC01547P58512 RPARP-AS1-202ENST00000492465 1556 ntTSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
LINC01547P58512 ATL3-203ENST00000538786 1920 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.33□□□□□ -0.92
LINC01547P58512 MVK-214ENST00000629016 1591 ntTSL 5 BASIC9.33□□□□□ -0.92
LINC01547P58512 AHCY-205ENST00000538132 2366 ntTSL 2 BASIC9.32□□□□□ -0.92
LINC01547P58512 CACNA1G-232ENST00000515411 6960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
LINC01547P58512 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC9.32□□□□□ -0.92
LINC01547P58512 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
LINC01547P58512 INTS5-201ENST00000330574 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
LINC01547P58512 AP002851.1-201ENST00000640504 2130 ntTSL 5 BASIC9.32□□□□□ -0.92
LINC01547P58512 ANGPTL2-202ENST00000373425 3707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
LINC01547P58512 AC023632.2-201ENST00000523011 1789 ntTSL 2 BASIC9.32□□□□□ -0.92
LINC01547P58512 MYADM-201ENST00000336967 3047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.32□□□□□ -0.92
LINC01547P58512 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC9.32□□□□□ -0.92
LINC01547P58512 DBNDD1-203ENST00000392973 2689 ntTSL 2 BASIC9.32□□□□□ -0.92
LINC01547P58512 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC9.32□□□□□ -0.92
LINC01547P58512 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC9.32□□□□□ -0.92
LINC01547P58512 PATL2-208ENST00000560780 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.32□□□□□ -0.92
LINC01547P58512 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
LINC01547P58512 FOXP3-204ENST00000455775 2448 ntTSL 5 BASIC9.32□□□□□ -0.92
LINC01547P58512 ARPIN-201ENST00000357484 7591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
LINC01547P58512 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC9.32□□□□□ -0.92
LINC01547P58512 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC9.32□□□□□ -0.92
LINC01547P58512 MNT-201ENST00000174618 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
LINC01547P58512 ARHGEF1-201ENST00000337665 3171 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
LINC01547P58512 ITSN1-208ENST00000399349 5191 ntTSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
LINC01547P58512 TMBIM6-203ENST00000423828 3254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.32□□□□□ -0.92
LINC01547P58512 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
LINC01547P58512 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
LINC01547P58512 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC9.32□□□□□ -0.92
LINC01547P58512 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
LINC01547P58512 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC9.32□□□□□ -0.92
LINC01547P58512 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC9.32□□□□□ -0.92
LINC01547P58512 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC9.32□□□□□ -0.92
LINC01547P58512 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC9.32□□□□□ -0.92
LINC01547P58512 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
LINC01547P58512 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC9.32□□□□□ -0.92
LINC01547P58512 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC9.32□□□□□ -0.92
LINC01547P58512 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC9.32□□□□□ -0.92
LINC01547P58512 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC9.32□□□□□ -0.92
LINC01547P58512 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC9.32□□□□□ -0.92
LINC01547P58512 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC9.32□□□□□ -0.92
LINC01547P58512 AKR1A1-202ENST00000372070 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
LINC01547P58512 NFKBIZ-202ENST00000326172 3923 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
LINC01547P58512 FNIP1-205ENST00000615660 6589 ntTSL 5 BASIC9.32□□□□□ -0.92
LINC01547P58512 LINC00940-201ENST00000418006 2350 ntTSL 2 BASIC9.32□□□□□ -0.92
LINC01547P58512 TIAM1-201ENST00000286827 7200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.32□□□□□ -0.92
LINC01547P58512 ZNF341-202ENST00000375200 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
LINC01547P58512 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.32□□□□□ -0.92
LINC01547P58512 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
LINC01547P58512 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC9.32□□□□□ -0.92
LINC01547P58512 LRSAM1-201ENST00000300417 3146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
LINC01547P58512 ATG13-215ENST00000529655 2566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.32□□□□□ -0.92
LINC01547P58512 CACNA2D4-220ENST00000585732 2566 ntTSL 5 BASIC9.32□□□□□ -0.92
LINC01547P58512 CDH1-201ENST00000261769 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
LINC01547P58512 BLCAP-205ENST00000397137 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
LINC01547P58512 ZNF239-203ENST00000426961 2027 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.32□□□□□ -0.92
LINC01547P58512 ELK1-201ENST00000247161 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
LINC01547P58512 ABCG8-201ENST00000272286 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
LINC01547P58512 PFKP-203ENST00000381125 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
LINC01547P58512 CRACR2A-203ENST00000440314 2697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.32□□□□□ -0.92
LINC01547P58512 BCAR3-210ENST00000539242 2114 ntTSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
LINC01547P58512 SOGA3-207ENST00000481848 11464 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.32□□□□□ -0.92
LINC01547P58512 RHD-202ENST00000342055 1557 ntTSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
LINC01547P58512 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
LINC01547P58512 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC9.32□□□□□ -0.92
LINC01547P58512 C9orf47-203ENST00000375851 4837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
LINC01547P58512 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC9.32□□□□□ -0.92
LINC01547P58512 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC9.32□□□□□ -0.92
LINC01547P58512 TMEM25-201ENST00000313236 2409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
LINC01547P58512 SPOCK2-201ENST00000317376 5328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
LINC01547P58512 EML4-203ENST00000402711 3568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
LINC01547P58512 ADGRD1-201ENST00000261654 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
LINC01547P58512 CELF1-214ENST00000531165 3650 ntTSL 2 BASIC9.32□□□□□ -0.92
LINC01547P58512 AGGF1P1-201ENST00000509500 2073 ntBASIC9.32□□□□□ -0.92
LINC01547P58512 COL6A2-203ENST00000397763 3101 ntTSL 5 BASIC9.31□□□□□ -0.92
LINC01547P58512 CACNA1G-222ENST00000510366 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
LINC01547P58512 CACNA1G-227ENST00000513964 6735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
LINC01547P58512 AC105345.1-202ENST00000382488 3204 ntTSL 2 BASIC9.31□□□□□ -0.92
LINC01547P58512 SNX12-202ENST00000374274 2376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
LINC01547P58512 FAM90A12P-201ENST00000519497 2375 ntBASIC9.31□□□□□ -0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 218 ms