Protein–RNA interactions for Protein: P56915

GSC, Homeobox protein goosecoid, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GSCP56915 ELF3-202ENST00000367283 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GSCP56915 PISD-209ENST00000439502 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GSCP56915 ACSF2-202ENST00000427954 2251 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GSCP56915 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GSCP56915 AHCYP2-201ENST00000430630 1300 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
GSCP56915 AL109910.1-201ENST00000452071 1330 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GSCP56915 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GSCP56915 LRRC20-204ENST00000373224 3095 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GSCP56915 CDKL3-206ENST00000521118 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GSCP56915 ADK-205ENST00000539909 1866 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GSCP56915 ADAM17-204ENST00000618923 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GSCP56915 DMTN-220ENST00000523266 2735 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GSCP56915 CYP1A1-203ENST00000395049 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GSCP56915 RPRD1A-202ENST00000399022 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GSCP56915 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GSCP56915 NRIP3-201ENST00000309166 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GSCP56915 MUC1-202ENST00000338684 1107 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GSCP56915 TNFAIP8L2-201ENST00000368910 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GSCP56915 MXI1-205ENST00000393134 889 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GSCP56915 AC079776.1-201ENST00000401540 1152 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
GSCP56915 CNN2P10-201ENST00000443067 918 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
GSCP56915 SVIL-AS1-208ENST00000446807 1007 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GSCP56915 AL355994.2-201ENST00000447882 704 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
GSCP56915 AC109479.1-201ENST00000519603 624 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GSCP56915 AP000911.1-202ENST00000532706 543 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GSCP56915 AC008011.2-201ENST00000538113 792 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GSCP56915 NDUFC1-210ENST00000539387 725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GSCP56915 AC005544.2-201ENST00000579138 229 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GSCP56915 MIR4683-201ENST00000579659 81 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
GSCP56915 H2BFM-203ENST00000598335 465 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GSCP56915 CLEC11A-202ENST00000599973 1026 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GSCP56915 PFAS-212ENST00000625942 396 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GSCP56915 KBTBD4-202ENST00000430070 2372 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GSCP56915 FBXO8-202ENST00000503293 1546 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GSCP56915 ACADM-202ENST00000370841 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GSCP56915 IFT88-202ENST00000351808 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GSCP56915 ALDH3A1-201ENST00000225740 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GSCP56915 AC093520.1-201ENST00000567545 1767 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GSCP56915 AL365199.1-201ENST00000421320 1714 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GSCP56915 POLRMT-202ENST00000588649 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GSCP56915 IL1RAP-209ENST00000422940 1957 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GSCP56915 AC009093.10-201ENST00000641956 1442 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
GSCP56915 AC138028.2-202ENST00000567968 4528 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GSCP56915 FANCA-213ENST00000563673 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GSCP56915 TSPEAR-AS2-202ENST00000354333 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GSCP56915 BPI-201ENST00000262865 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GSCP56915 TAGLN2-202ENST00000368096 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GSCP56915 HECTD3-202ENST00000372172 3610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GSCP56915 RPS6KA1-213ENST00000526792 2596 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GSCP56915 USP19-205ENST00000398898 4474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GSCP56915 ANKRD20A19P-202ENST00000442969 2796 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GSCP56915 FZD6-206ENST00000523739 2774 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GSCP56915 PIP4K2A-201ENST00000323883 1319 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GSCP56915 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GSCP56915 PTBP1-221ENST00000635647 3691 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GSCP56915 INTS4P1-203ENST00000641008 3683 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
GSCP56915 BST2-201ENST00000252593 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GSCP56915 SOD1-201ENST00000270142 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GSCP56915 DMAC2-202ENST00000301183 1134 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GSCP56915 U91328.1-201ENST00000437528 223 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
GSCP56915 AC010745.3-201ENST00000439745 415 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GSCP56915 CROCCP4-201ENST00000457096 498 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
GSCP56915 AC104596.1-201ENST00000507826 579 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GSCP56915 AC068228.2-201ENST00000522383 777 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GSCP56915 AC079316.1-201ENST00000548397 411 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
GSCP56915 AC090502.1-201ENST00000549905 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GSCP56915 AC090502.1-204ENST00000551210 469 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GSCP56915 FKBP4-208ENST00000630279 156 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GSCP56915 AC008687.7-202ENST00000637404 953 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
GSCP56915 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GSCP56915 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GSCP56915 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GSCP56915 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GSCP56915 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GSCP56915 PDHX-201ENST00000227868 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GSCP56915 NOS2P2-202ENST00000639528 1659 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GSCP56915 NEURL1-201ENST00000369780 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GSCP56915 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GSCP56915 CEP295NL-205ENST00000619342 1866 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GSCP56915 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GSCP56915 FAM90A1-203ENST00000538603 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GSCP56915 PNMA5-205ENST00000535214 3198 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GSCP56915 RTEL1-201ENST00000318100 4676 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GSCP56915 C1QTNF9-201ENST00000332018 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GSCP56915 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GSCP56915 CDK11A-201ENST00000356200 2653 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GSCP56915 LCMT1-203ENST00000399069 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GSCP56915 GDI2-203ENST00000380191 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GSCP56915 BEND3P3-201ENST00000611030 2440 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
GSCP56915 OTP-201ENST00000306422 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GSCP56915 RGS6-217ENST00000555571 1764 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GSCP56915 BRSK1-206ENST00000590333 2977 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GSCP56915 ERC1-219ENST00000546231 4390 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GSCP56915 AC008125.1-201ENST00000548488 1538 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GSCP56915 HLA-DPA1-242ENST00000419277 1704 ntAPPRIS P2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GSCP56915 CDYL-205ENST00000449732 2139 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GSCP56915 PSEN2-202ENST00000366783 2306 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GSCP56915 TNIK-202ENST00000341852 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GSCP56915 NRDC-201ENST00000352171 3691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GSCP56915 AMIGO3-201ENST00000320431 2862 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms