Protein–RNA interactions for Protein: P51654

GPC3, Glypican-3, humanhuman

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPC3P51654 CNOT9-208ENST00000542068 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GPC3P51654 MKS1-202ENST00000393119 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GPC3P51654 TOMM34-201ENST00000372813 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GPC3P51654 EXOC6B-202ENST00000410104 5795 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GPC3P51654 AC007686.3-201ENST00000619017 3487 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
GPC3P51654 KRT8P19-201ENST00000551916 1455 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
GPC3P51654 CALM1-216ENST00000626705 1341 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GPC3P51654 ATG5-201ENST00000343245 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GPC3P51654 ADAM33-206ENST00000617732 1971 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GPC3P51654 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
GPC3P51654 PIK3IP1-201ENST00000215912 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
GPC3P51654 AC007191.1-201ENST00000623179 2995 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
GPC3P51654 AC139712.1-201ENST00000378256 1875 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
GPC3P51654 TIMP2-201ENST00000262768 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GPC3P51654 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GPC3P51654 COL25A1-203ENST00000399132 2724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GPC3P51654 GSTCD-206ENST00000507281 2091 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GPC3P51654 PTK7-210ENST00000471863 2412 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GPC3P51654 MIR762HG-203ENST00000570025 1429 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GPC3P51654 LINC01285-201ENST00000412422 2289 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GPC3P51654 FH-201ENST00000366560 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GPC3P51654 XKR9-203ENST00000520030 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GPC3P51654 MAP2K3-201ENST00000316920 1246 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GPC3P51654 GSTK1-202ENST00000409500 888 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GPC3P51654 MSC-AS1-204ENST00000518916 864 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GPC3P51654 MRPL48-210ENST00000542303 661 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GPC3P51654 TGIF1-218ENST00000551402 1089 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GPC3P51654 FGFR3P5-201ENST00000564496 886 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
GPC3P51654 AC068152.1-201ENST00000575930 685 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GPC3P51654 FAM236A-201ENST00000593662 453 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GPC3P51654 FAM236B-201ENST00000596535 465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GPC3P51654 AC079325.2-202ENST00000641031 462 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GPC3P51654 RPTOR-202ENST00000544334 5734 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GPC3P51654 CHIA-204ENST00000369740 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GPC3P51654 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GPC3P51654 PMM2-201ENST00000268261 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GPC3P51654 C15orf52-206ENST00000559313 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GPC3P51654 ZNF84-202ENST00000392319 7020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GPC3P51654 SOWAHA-201ENST00000378693 3211 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GPC3P51654 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GPC3P51654 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GPC3P51654 WDR97-201ENST00000323662 6916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GPC3P51654 KREMEN1-201ENST00000327813 2719 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GPC3P51654 KANK2-207ENST00000589894 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GPC3P51654 OGFOD1-209ENST00000568397 1681 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GPC3P51654 KLK3-216ENST00000617027 1341 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GPC3P51654 TRAF6-201ENST00000348124 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GPC3P51654 PPP4R4-201ENST00000304338 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GPC3P51654 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GPC3P51654 FOXO4-201ENST00000341558 1353 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GPC3P51654 RANBP1-208ENST00000430524 1389 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GPC3P51654 AC023908.3-201ENST00000564211 3047 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
GPC3P51654 ZNF777-201ENST00000247930 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GPC3P51654 CTBP1-209ENST00000510568 4250 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GPC3P51654 DLGAP1-213ENST00000534970 2365 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GPC3P51654 SPO11-203ENST00000371263 1834 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GPC3P51654 ABCB7-202ENST00000339447 2234 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GPC3P51654 FBXL19-202ENST00000380310 3796 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GPC3P51654 RUFY1-204ENST00000437570 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GPC3P51654 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GPC3P51654 CEP170B-202ENST00000414716 6705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GPC3P51654 IER3-201ENST00000259874 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GPC3P51654 AC079807.2-203ENST00000417692 656 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GPC3P51654 AC006335.1-201ENST00000445200 547 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
GPC3P51654 AL160290.2-202ENST00000448671 574 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GPC3P51654 LAMA4-209ENST00000453937 645 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GPC3P51654 SUPT4H1P2-201ENST00000501248 353 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
GPC3P51654 AC011773.1-201ENST00000520129 468 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GPC3P51654 CCNC-217ENST00000523985 958 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GPC3P51654 AC090857.1-201ENST00000527400 390 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
GPC3P51654 SPAG5-AS1-203ENST00000554154 491 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GPC3P51654 NFIC-204ENST00000586919 1221 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GPC3P51654 AL157813.1-201ENST00000612996 587 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
GPC3P51654 C3orf62-201ENST00000343010 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GPC3P51654 SAFB-202ENST00000454510 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GPC3P51654 TBK1-201ENST00000331710 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GPC3P51654 MAMLD1-203ENST00000370401 4854 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GPC3P51654 NFYC-215ENST00000456393 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GPC3P51654 C1orf43-206ENST00000368521 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GPC3P51654 ASGR1-201ENST00000269299 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GPC3P51654 DUSP13-208ENST00000478873 1335 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GPC3P51654 PLXDC1-201ENST00000315392 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GPC3P51654 GLIS2-201ENST00000262366 4469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GPC3P51654 BTBD11-204ENST00000420571 3478 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GPC3P51654 GRM5-205ENST00000455756 7927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GPC3P51654 SCFD2-201ENST00000388940 2221 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GPC3P51654 ORMDL3-202ENST00000394169 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GPC3P51654 TTC29-208ENST00000513335 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GPC3P51654 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GPC3P51654 UBE3B-202ENST00000342494 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GPC3P51654 MBP-204ENST00000382582 2281 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GPC3P51654 GCK-204ENST00000403799 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GPC3P51654 SERINC2-206ENST00000536859 2072 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GPC3P51654 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GPC3P51654 AC009093.10-201ENST00000641956 1442 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
GPC3P51654 YME1L1-202ENST00000375972 2517 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GPC3P51654 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GPC3P51654 SUOX-204ENST00000394115 2394 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GPC3P51654 ELOVL1-201ENST00000372458 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GPC3P51654 RPL13-204ENST00000452368 1455 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms