Protein–RNA interactions for Protein: P50607

TUB, Tubby protein homolog, humanhuman

Predictions only

Length 506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBP50607 STRN3-201ENST00000355683 3970 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TUBP50607 ITPRIPL2-201ENST00000381440 7247 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TUBP50607 GSDMA-203ENST00000635792 1546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TUBP50607 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TUBP50607 NDRG2-226ENST00000554104 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TUBP50607 LINC01305-201ENST00000420866 3123 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TUBP50607 ANKRD35-201ENST00000355594 3342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TUBP50607 OFD1-204ENST00000398395 3307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TUBP50607 GJD2-201ENST00000290374 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TUBP50607 SLC35A3-209ENST00000638338 2890 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TUBP50607 C3orf62-201ENST00000343010 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TUBP50607 KRTAP21-2-201ENST00000333892 440 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TUBP50607 IP6K2-202ENST00000340879 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TUBP50607 MRPL43-206ENST00000370236 866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TUBP50607 MRPL43-207ENST00000370241 824 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TUBP50607 CD8B-204ENST00000393759 1096 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TUBP50607 THAP4-202ENST00000402136 785 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TUBP50607 NME6-203ENST00000415644 849 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TUBP50607 CALR4P-201ENST00000431943 946 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
TUBP50607 SEPT7P2-209ENST00000450436 601 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TUBP50607 AKR7A2P1-201ENST00000460134 915 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
TUBP50607 APOPT1-207ENST00000477116 906 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TUBP50607 AC005586.1-201ENST00000488310 577 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TUBP50607 BTNL8-205ENST00000505126 1294 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TUBP50607 AC046168.2-201ENST00000560590 875 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TUBP50607 MIR4783-201ENST00000580343 82 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
TUBP50607 RANGRF-205ENST00000580434 749 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TUBP50607 NAT9-222ENST00000583476 583 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TUBP50607 FBXL12-204ENST00000586469 544 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TUBP50607 AC005324.6-201ENST00000587972 613 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
TUBP50607 BNIP3P13-201ENST00000599968 566 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
TUBP50607 LINC01672-205ENST00000635092 633 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TUBP50607 AL139099.5-201ENST00000635274 300 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
TUBP50607 CICP8-201ENST00000455800 2813 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
TUBP50607 PRMT7-202ENST00000441236 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TUBP50607 PSD2-201ENST00000274710 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TUBP50607 AC004223.3-201ENST00000593039 1638 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TUBP50607 HSDL1-201ENST00000219439 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TUBP50607 ACOT7-203ENST00000377845 1432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TUBP50607 CRACR2A-201ENST00000252322 2186 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TUBP50607 JKAMP-207ENST00000554271 2137 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TUBP50607 LYRM1-203ENST00000412082 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TUBP50607 AC027601.5-201ENST00000624065 2482 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
TUBP50607 GLIS2-201ENST00000262366 4469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TUBP50607 KRT20-201ENST00000167588 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TUBP50607 HNF4G-201ENST00000354370 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TUBP50607 TFCP2-201ENST00000257915 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TUBP50607 STX1A-201ENST00000222812 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TUBP50607 GCNT7-201ENST00000243913 2064 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TUBP50607 STX1A-204ENST00000395156 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TUBP50607 MED4-201ENST00000258648 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TUBP50607 ANO10-213ENST00000451430 2019 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TUBP50607 NOP2-222ENST00000617555 2017 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TUBP50607 MYLK3-201ENST00000394809 6911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TUBP50607 LAT2-205ENST00000460943 2527 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TUBP50607 SLC34A2-203ENST00000504570 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TUBP50607 PES1-201ENST00000335214 1988 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TUBP50607 TSPO-201ENST00000329563 955 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TUBP50607 THEG-202ENST00000346878 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TUBP50607 WDR3-202ENST00000369441 1035 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TUBP50607 TPD52L2-207ENST00000369927 1094 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TUBP50607 NRSN2-201ENST00000382285 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TUBP50607 LIMS1-206ENST00000414829 439 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TUBP50607 AL162742.1-201ENST00000434792 954 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TUBP50607 PUDPP3-201ENST00000445368 636 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
TUBP50607 AC021723.1-201ENST00000486306 515 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
TUBP50607 LIMS3-205ENST00000487150 782 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TUBP50607 RPL27A-202ENST00000524496 558 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TUBP50607 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TUBP50607 AC100827.2-201ENST00000563214 1194 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
TUBP50607 TMEM208-207ENST00000563953 887 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TUBP50607 CRHR1-208ENST00000577353 1206 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TUBP50607 TSPO-206ENST00000583777 636 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TUBP50607 SLC38A10-202ENST00000374759 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TUBP50607 AC104452.1-203ENST00000636166 2266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TUBP50607 PDGFRL-201ENST00000251630 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TUBP50607 AC018529.2-202ENST00000611482 3087 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
TUBP50607 RFX2-222ENST00000592546 2578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TUBP50607 AC018442.1-201ENST00000421439 2061 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
TUBP50607 GPKOW-201ENST00000156109 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TUBP50607 PLTP-201ENST00000354050 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TUBP50607 CRLF2-201ENST00000381566 1545 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TUBP50607 PAK6-202ENST00000455577 4215 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TUBP50607 YWHAE-208ENST00000571732 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TUBP50607 ZNF575-202ENST00000458714 2285 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TUBP50607 SLC32A1-201ENST00000217420 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TUBP50607 UROD-201ENST00000246337 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TUBP50607 TMEM200A-204ENST00000617887 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TUBP50607 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TUBP50607 PEF1-201ENST00000373703 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TUBP50607 ARRB2-204ENST00000412477 1779 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TUBP50607 MCL1-202ENST00000369026 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TUBP50607 DEGS2-201ENST00000305631 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TUBP50607 TATDN3-202ENST00000366974 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TUBP50607 NAA60-229ENST00000575076 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TUBP50607 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TUBP50607 ABCG1-205ENST00000398449 2998 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TUBP50607 SRP14-201ENST00000267884 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TUBP50607 FAM83A-201ENST00000276699 1858 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TUBP50607 CALCA-201ENST00000331587 843 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.8 ms