Protein–RNA interactions for Protein: P48165

GJA8, Gap junction alpha-8 protein, humanhuman

Predictions only

Length 433 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJA8P48165 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GJA8P48165 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GJA8P48165 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GJA8P48165 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GJA8P48165 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GJA8P48165 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GJA8P48165 SPEG-201ENST00000312358 10782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GJA8P48165 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GJA8P48165 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GJA8P48165 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GJA8P48165 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GJA8P48165 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GJA8P48165 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GJA8P48165 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GJA8P48165 UBOX5-AS1-201ENST00000446537 1792 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GJA8P48165 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GJA8P48165 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GJA8P48165 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GJA8P48165 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GJA8P48165 JPT1-202ENST00000356033 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GJA8P48165 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GJA8P48165 DAD1-201ENST00000250498 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GJA8P48165 IL17B-201ENST00000261796 696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GJA8P48165 AC106827.1-201ENST00000366454 431 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
GJA8P48165 COLEC11-204ENST00000402794 1134 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GJA8P48165 AC093609.1-201ENST00000434020 952 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GJA8P48165 AL391415.1-201ENST00000439844 400 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GJA8P48165 LINC00313-207ENST00000451543 413 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GJA8P48165 RORA-AS1-201ENST00000501579 761 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GJA8P48165 AC107464.2-201ENST00000502923 569 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GJA8P48165 AC095040.1-201ENST00000513286 675 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
GJA8P48165 IGHEP2-201ENST00000519308 1256 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
GJA8P48165 KRT8P2-201ENST00000556193 944 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
GJA8P48165 AC092756.1-201ENST00000560248 448 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GJA8P48165 SNORD3B-1-201ENST00000577988 758 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
GJA8P48165 AC017033.1-201ENST00000603720 708 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GJA8P48165 PHF23-213ENST00000613632 850 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GJA8P48165 Metazoa_SRP.75-201ENST00000614439 293 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
GJA8P48165 LINC01669-201ENST00000623161 413 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GJA8P48165 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GJA8P48165 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GJA8P48165 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GJA8P48165 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GJA8P48165 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GJA8P48165 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GJA8P48165 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GJA8P48165 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GJA8P48165 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GJA8P48165 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GJA8P48165 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GJA8P48165 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GJA8P48165 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GJA8P48165 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GJA8P48165 PCED1B-201ENST00000432328 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GJA8P48165 AL591122.2-201ENST00000624125 1853 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
GJA8P48165 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GJA8P48165 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GJA8P48165 AC020659.1-201ENST00000309874 2900 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GJA8P48165 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GJA8P48165 ZDHHC6-201ENST00000369404 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GJA8P48165 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GJA8P48165 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GJA8P48165 EIF4E2-201ENST00000258416 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GJA8P48165 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GJA8P48165 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GJA8P48165 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GJA8P48165 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GJA8P48165 CR382285.1-201ENST00000625012 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GJA8P48165 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GJA8P48165 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GJA8P48165 TREM2-202ENST00000373113 1044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GJA8P48165 LST1-204ENST00000376086 554 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GJA8P48165 EIF4E2-205ENST00000409394 604 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GJA8P48165 AL451069.3-201ENST00000450206 1013 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GJA8P48165 WDYHV1-206ENST00000523356 869 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GJA8P48165 ADM-203ENST00000525063 867 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GJA8P48165 AC009163.3-201ENST00000563554 852 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GJA8P48165 LINC02252-201ENST00000565706 487 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GJA8P48165 FBXO36P1-201ENST00000579006 471 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
GJA8P48165 CR392039.1-201ENST00000623217 204 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
GJA8P48165 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
GJA8P48165 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GJA8P48165 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GJA8P48165 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GJA8P48165 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GJA8P48165 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GJA8P48165 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GJA8P48165 SYT17-201ENST00000355377 3081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GJA8P48165 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GJA8P48165 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GJA8P48165 PORCN-204ENST00000361988 1672 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GJA8P48165 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GJA8P48165 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GJA8P48165 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GJA8P48165 C12orf76-209ENST00000615315 1580 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GJA8P48165 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GJA8P48165 TMEM9-202ENST00000367332 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GJA8P48165 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GJA8P48165 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GJA8P48165 DMTN-201ENST00000265800 2554 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.4 ms