Protein–RNA interactions for Protein: P46100

ATRX, Transcriptional regulator ATRX, humanhuman

Predictions only

Length 2,492 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRXP46100 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
ATRXP46100 RNF167-201ENST00000262482 1915 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
ATRXP46100 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
ATRXP46100 ACTG1P17-202ENST00000560958 1662 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
ATRXP46100 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
ATRXP46100 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
ATRXP46100 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
ATRXP46100 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
ATRXP46100 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
ATRXP46100 LINC00449-201ENST00000366259 872 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
ATRXP46100 TNNT2-207ENST00000367322 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
ATRXP46100 MDS2-201ENST00000374555 1029 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
ATRXP46100 MIR645-201ENST00000385283 94 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
ATRXP46100 LINC01022-201ENST00000415652 394 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
ATRXP46100 AL512599.1-201ENST00000430724 685 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
ATRXP46100 STAG3L3-203ENST00000436857 1033 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
ATRXP46100 GCOM2-201ENST00000509133 1104 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
ATRXP46100 GABARAPL1-213ENST00000544284 531 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
ATRXP46100 KRT8P1-201ENST00000557533 1207 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
ATRXP46100 AC023421.2-201ENST00000589510 313 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
ATRXP46100 MIR6741-201ENST00000618782 63 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
ATRXP46100 AC114296.1-202ENST00000638019 771 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
ATRXP46100 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.3
ATRXP46100 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
ATRXP46100 INPPL1-213ENST00000541756 4649 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
ATRXP46100 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.3
ATRXP46100 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
ATRXP46100 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
ATRXP46100 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
ATRXP46100 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.3
ATRXP46100 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
ATRXP46100 IP6K2-211ENST00000432678 1309 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.3
ATRXP46100 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC13.21□□□□□ -0.3
ATRXP46100 AC062028.1-201ENST00000536743 1422 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
ATRXP46100 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
ATRXP46100 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
ATRXP46100 TRIQK-219ENST00000523580 1630 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.3
ATRXP46100 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
ATRXP46100 LMNA-213ENST00000473598 2015 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
ATRXP46100 EFHC1-227ENST00000637089 2133 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
ATRXP46100 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
ATRXP46100 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
ATRXP46100 LRIG3-201ENST00000320743 4070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
ATRXP46100 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
ATRXP46100 RUSC1-202ENST00000368347 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
ATRXP46100 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
ATRXP46100 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
ATRXP46100 KRTAP6-1-201ENST00000329122 500 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
ATRXP46100 IGHV3-66-201ENST00000390632 427 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
ATRXP46100 ACTG2-204ENST00000409918 927 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
ATRXP46100 OR52X1P-201ENST00000446117 914 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
ATRXP46100 AC018638.5-201ENST00000450885 754 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
ATRXP46100 AC068057.1-201ENST00000453322 709 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
ATRXP46100 TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 181 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
ATRXP46100 MIR6749-201ENST00000617008 69 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
ATRXP46100 AC245369.7-201ENST00000631386 350 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
ATRXP46100 HORMAD1-201ENST00000322343 1771 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
ATRXP46100 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
ATRXP46100 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
ATRXP46100 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
ATRXP46100 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
ATRXP46100 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
ATRXP46100 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
ATRXP46100 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
ATRXP46100 MEGF8-201ENST00000251268 9549 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
ATRXP46100 EIF4E2-201ENST00000258416 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
ATRXP46100 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
ATRXP46100 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
ATRXP46100 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
ATRXP46100 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
ATRXP46100 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
ATRXP46100 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
ATRXP46100 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
ATRXP46100 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
ATRXP46100 RPAIN-202ENST00000381208 1394 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
ATRXP46100 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
ATRXP46100 LEMD3-201ENST00000308330 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
ATRXP46100 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
ATRXP46100 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
ATRXP46100 SOD1-202ENST00000389995 865 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
ATRXP46100 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
ATRXP46100 HTATIP2-202ENST00000421577 886 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
ATRXP46100 PDZD9-201ENST00000424898 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
ATRXP46100 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
ATRXP46100 PARVG-208ENST00000466375 820 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
ATRXP46100 CACNA1C-AS1-203ENST00000544517 742 ntTSL 4 BASIC13.2□□□□□ -0.3
ATRXP46100 DUSP22-213ENST00000605035 1231 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
ATRXP46100 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
ATRXP46100 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
ATRXP46100 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
ATRXP46100 KCNMA1-262ENST00000639489 4302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
ATRXP46100 API5-203ENST00000455725 2257 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
ATRXP46100 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
ATRXP46100 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
ATRXP46100 ELFN2-207ENST00000613079 8360 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.2□□□□□ -0.3
ATRXP46100 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
ATRXP46100 RIC1-201ENST00000251879 4127 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
ATRXP46100 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
ATRXP46100 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
ATRXP46100 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
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