Protein–RNA interactions for Protein: P29375

KDM5A, Lysine-specific demethylase 5A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,690 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM5AP29375 LAMP5-202ENST00000427562 1309 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
KDM5AP29375 PDXDC2P-206ENST00000534700 1315 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
KDM5AP29375 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
KDM5AP29375 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
KDM5AP29375 CDC42SE2-202ENST00000395246 3485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
KDM5AP29375 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
KDM5AP29375 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
KDM5AP29375 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
KDM5AP29375 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
KDM5AP29375 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
KDM5AP29375 TAF12-201ENST00000263974 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
KDM5AP29375 ATF4-203ENST00000404241 1910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
KDM5AP29375 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
KDM5AP29375 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
KDM5AP29375 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
KDM5AP29375 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
KDM5AP29375 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
KDM5AP29375 DDX49-201ENST00000247003 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
KDM5AP29375 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
KDM5AP29375 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
KDM5AP29375 ZNF226-201ENST00000300823 817 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
KDM5AP29375 CST5-201ENST00000304710 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
KDM5AP29375 CCDC12-202ENST00000425441 1097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
KDM5AP29375 AC092573.1-201ENST00000433054 884 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
KDM5AP29375 AL512622.1-202ENST00000443922 478 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
KDM5AP29375 AC068057.1-201ENST00000453322 709 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
KDM5AP29375 LINC00892-203ENST00000454385 686 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
KDM5AP29375 RPS18P9-201ENST00000482817 460 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
KDM5AP29375 PRSS3P1-201ENST00000503996 742 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
KDM5AP29375 EHF-208ENST00000530286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
KDM5AP29375 AC108471.2-201ENST00000533736 1061 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
KDM5AP29375 AC103808.3-201ENST00000579714 598 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
KDM5AP29375 DUOXA1-216ENST00000613425 1867 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
KDM5AP29375 CCDC47-201ENST00000225726 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
KDM5AP29375 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
KDM5AP29375 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
KDM5AP29375 PLTP-203ENST00000372431 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
KDM5AP29375 DHRS7-209ENST00000557185 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
KDM5AP29375 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
KDM5AP29375 MX1-218ENST00000619682 1980 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
KDM5AP29375 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
KDM5AP29375 RRAGA-201ENST00000380527 1589 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
KDM5AP29375 FDFT1-214ENST00000528812 2013 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
KDM5AP29375 CYTH1-201ENST00000361101 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
KDM5AP29375 CYTH1-202ENST00000446868 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
KDM5AP29375 MRPS17-201ENST00000285298 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
KDM5AP29375 MRPL55-205ENST00000366731 1423 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
KDM5AP29375 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
KDM5AP29375 AC009053.1-204ENST00000429810 2355 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
KDM5AP29375 ADD3-202ENST00000356080 3081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
KDM5AP29375 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
KDM5AP29375 LCN6-201ENST00000341206 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
KDM5AP29375 VCX3A-202ENST00000398729 808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
KDM5AP29375 LINC01523-201ENST00000425385 450 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
KDM5AP29375 DEPDC1-AS1-201ENST00000428732 1247 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
KDM5AP29375 PSMB8-AS1-204ENST00000429600 996 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
KDM5AP29375 FOXP4-AS1-205ENST00000454812 575 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
KDM5AP29375 FRMD4A-204ENST00000475141 1233 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
KDM5AP29375 AC090136.2-201ENST00000517809 420 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
KDM5AP29375 AC111149.2-202ENST00000518355 599 ntTSL 4 BASIC20.42■□□□□ 0.86
KDM5AP29375 GOLGA2P7-209ENST00000560408 745 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
KDM5AP29375 MBP-238ENST00000580402 915 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
KDM5AP29375 PTPN20CP-201ENST00000614090 920 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
KDM5AP29375 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
KDM5AP29375 KLK4-201ENST00000324041 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
KDM5AP29375 AL365181.1-201ENST00000564032 1828 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
KDM5AP29375 KAT5-216ENST00000534650 1875 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
KDM5AP29375 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
KDM5AP29375 AC138761.6-201ENST00000583997 1423 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
KDM5AP29375 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
KDM5AP29375 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
KDM5AP29375 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
KDM5AP29375 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
KDM5AP29375 F8-201ENST00000330287 2620 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
KDM5AP29375 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
KDM5AP29375 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
KDM5AP29375 HMGCLL1-203ENST00000370850 1171 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
KDM5AP29375 HLA-DRB5-201ENST00000374975 1260 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
KDM5AP29375 HIST1H4B-201ENST00000377745 438 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
KDM5AP29375 EHMT2-AS1-201ENST00000434689 373 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
KDM5AP29375 RPS27L-203ENST00000439025 970 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
KDM5AP29375 RN7SL128P-201ENST00000467883 305 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
KDM5AP29375 AL713999.1-201ENST00000473363 753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
KDM5AP29375 IGHEP2-201ENST00000519308 1256 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
KDM5AP29375 SNRPF-204ENST00000552085 815 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
KDM5AP29375 C12orf73-210ENST00000552940 685 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
KDM5AP29375 PTOV1-AS2-203ENST00000601893 719 ntTSL 4 BASIC20.42■□□□□ 0.86
KDM5AP29375 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
KDM5AP29375 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
KDM5AP29375 CBX3-202ENST00000396386 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
KDM5AP29375 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
KDM5AP29375 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
KDM5AP29375 FKBP4P8-201ENST00000610931 1369 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
KDM5AP29375 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
KDM5AP29375 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
KDM5AP29375 ALDH3A1-201ENST00000225740 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
KDM5AP29375 VDAC2-202ENST00000313132 1467 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
KDM5AP29375 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
KDM5AP29375 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
KDM5AP29375 IL18BP-205ENST00000393705 1549 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.7 ms